164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1853 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  100 
 
 		 558 aa  1155    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1758  lipoprotein  39.85 
 
 		 933 aa  355  2e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.25404 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1906  lipoprotein  33.9 
 
 		 647 aa  316  6e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  46.79 
 
 		 1575 aa  316  8e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  32.06 
 
 		 634 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2786  lipoprotein  44.76 
 
 		 857 aa  191  2.9999999999999997e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000228029  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46561  predicted protein  49.28 
 
 		 500 aa  186  8e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0924573  normal  0.560204 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3150  lipoprotein  36.42 
 
 		 2670 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009372  OSTLU_33739  predicted protein  43.95 
 
 		 331 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.39925  hitchhiker  0.0000589113 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2789  lipoprotein  36.47 
 
 		 395 aa  184  4.0000000000000006e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_30925  predicted protein  45.98 
 
 		 427 aa  181  2e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43047  predicted protein  46.6 
 
 		 399 aa  181  4e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0199168  normal  0.21868 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0310  hypothetical protein  43.42 
 
 		 300 aa  179  1e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2442  lipoprotein  42.02 
 
 		 789 aa  178  3e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000531268  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0942  lipoprotein  36.33 
 
 		 741 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00629705  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0300  hypothetical protein  39.1 
 
 		 497 aa  170  6e-41  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.39136  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2788  lipoprotein  41.67 
 
 		 800 aa  169  2e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0944  lipoprotein  37.87 
 
 		 609 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.528122  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2784  lipoprotein  36.95 
 
 		 486 aa  167  5.9999999999999996e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000491799  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0782  putative lipoprotein  37.4 
 
 		 377 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0309  hypothetical protein  38 
 
 		 309 aa  159  1e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2787  lipoprotein  26.91 
 
 		 862 aa  158  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000522963  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0311  hypothetical protein  36.95 
 
 		 323 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2790  lipoprotein  27.99 
 
 		 862 aa  156  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119405  Lipoprotein Q-related gene  43.06 
 
 		 2415 aa  156  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0370764  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0943  lipoprotein  44.13 
 
 		 754 aa  154  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000209151  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0040  lipoprotein  30.74 
 
 		 898 aa  152  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0293  hypothetical protein  48.7 
 
 		 251 aa  152  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.72575  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0276  hypothetical protein  49.02 
 
 		 173 aa  151  3e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.455861  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0302  hypothetical protein  43.72 
 
 		 226 aa  147  7.0000000000000006e-34  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.36288  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_89715  predicted protein  36.26 
 
 		 3060 aa  145  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.288694 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0292  hypothetical protein  42.86 
 
 		 250 aa  145  2e-33  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.997759  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4609  hypothetical protein  42.26 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.318539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40634  predicted protein  36.21 
 
 		 1038 aa  141  3e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0207387  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0170  hypothetical protein  44.68 
 
 		 250 aa  140  4.999999999999999e-32  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40278  predicted protein  38.84 
 
 		 934 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0268  putative lipoprotein  33.07 
 
 		 451 aa  139  2e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0579209  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0626  hypothetical protein  33.33 
 
 		 467 aa  137  4e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0659718  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0721  putative lipoprotein  43.59 
 
 		 414 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.327009  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0718  lipoprotein  33.78 
 
 		 774 aa  137  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12591  hypothetical protein  38.97 
 
 		 1214 aa  135  9.999999999999999e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0704  putative lipoprotein  37.35 
 
 		 399 aa  135  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0815  lipoprotein  40.88 
 
 		 762 aa  132  2.0000000000000002e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.315298  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl446  membrane-associated lipoprotein precurser  32.52 
 
 		 907 aa  131  3e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150893  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0289  hypothetical protein  41.72 
 
 		 226 aa  130  7.000000000000001e-29  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_3281  predicted protein  37.14 
 
 		 253 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00042278  hitchhiker  0.000000386444 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0287  putative lipoprotein  44.97 
 
 		 272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0770  putative lipoprotein  32.3 
 
 		 452 aa  126  9e-28  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.320317  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2351  predicted protein  37.99 
 
 		 279 aa  126  1e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0859014  normal  0.811549 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0269  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 450 aa  124  4e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.384227  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0720  putative lipoprotein  42.31 
 
 		 405 aa  123  9e-27  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.298254  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  40.35 
 
 		 1437 aa  117  7.999999999999999e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41562  predicted protein  37.11 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0981287  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2783  lipoprotein  41.1 
 
 		 180 aa  115  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000140646  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0262  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  35.46 
 
 		 200 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50519  predicted protein  32.74 
 
 		 982 aa  111  4.0000000000000004e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2183  hypothetical protein  36.31 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  30.24 
 
 		 688 aa  107  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0622  hypothetical protein  43.86 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0735448  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  39.75 
 
 		 755 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2646  lipoprotein  36.91 
 
 		 275 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.46452 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  35.15 
 
 		 495 aa  104  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0186  hypothetical protein  50 
 
 		 913 aa  102  1e-20  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  33.96 
 
 		 1147 aa  101  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  38.46 
 
 		 1029 aa  100  9e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2528  hypothetical protein  38.27 
 
 		 221 aa  100  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00180911  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0033  conserved hypothetical protein, putative MoxR/RavA-like ATPase  44.76 
 
 		 560 aa  100  1e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.836793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  47.37 
 
 		 428 aa  99.8  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  35.8 
 
 		 571 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  28.16 
 
 		 501 aa  99.8  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0047  conserved hypothetical protein (DUF285 domain protein)  32.37 
 
 		 204 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  34.78 
 
 		 491 aa  99  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  31.91 
 
 		 1668 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  33.33 
 
 		 1174 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_34199  predicted protein  37.5 
 
 		 321 aa  97.4  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.16 
 
 		 996 aa  97.4  6e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5606  hypothetical protein  33.91 
 
 		 408 aa  97.1  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  30.2 
 
 		 541 aa  96.7  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  33.7 
 
 		 757 aa  96.3  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0312  putative lipoprotein  50.54 
 
 		 371 aa  95.1  3e-18  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.386247  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  34.55 
 
 		 665 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  31.22 
 
 		 324 aa  94.7  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2409  hypothetical protein  34.16 
 
 		 336 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00135262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3748  hypothetical protein  33.96 
 
 		 371 aa  94.4  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.012971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4487  lipoprotein  46.09 
 
 		 658 aa  94  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0247775 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6092  hypothetical protein  34.52 
 
 		 254 aa  94  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2066  metallophosphoesterase  33.92 
 
 		 686 aa  93.6  9e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1062  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  29.96 
 
 		 1227 aa  92.4  2e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0190621 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0288  hypothetical protein  37.69 
 
 		 190 aa  91.7  3e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  31.76 
 
 		 1055 aa  91.3  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  32.14 
 
 		 394 aa  90.5  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  33.71 
 
 		 803 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  36.02 
 
 		 362 aa  89.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6007  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  46.88 
 
 		 1015 aa  89.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00134837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  33.58 
 
 		 477 aa  89  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0173  hypothetical protein  57.14 
 
 		 95 aa  88.6  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.93 
 
 		 1433 aa  88.6  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  37.9 
 
 		 333 aa  88.2  4e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2349  hypothetical protein  44.35 
 
 		 230 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0736668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0814  lipoprotein  35.26 
 
 		 166 aa  87.4  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0458839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>