More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1723 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  37.18 
 
 		 1071 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  38.98 
 
 		 1173 aa  712    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1161 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  40.17 
 
 		 1181 aa  742    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  44.69 
 
 		 1066 aa  839    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  44.82 
 
 		 1177 aa  879    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  37.84 
 
 		 1122 aa  654    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  39.74 
 
 		 1079 aa  724    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1071 aa  2160    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  36.57 
 
 		 1039 aa  640    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  39.87 
 
 		 1050 aa  761    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  38 
 
 		 1037 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  40.36 
 
 		 1155 aa  761    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  36.53 
 
 		 1066 aa  640    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  37.76 
 
 		 1038 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  37.08 
 
 		 1081 aa  626  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  37.94 
 
 		 1163 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  36.82 
 
 		 1028 aa  600  1e-170  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  36.09 
 
 		 1148 aa  593  1e-168  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0962  TonB-dependent receptor plug  36.71 
 
 		 1060 aa  590  1e-167  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000104088  decreased coverage  0.00653561 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  35.37 
 
 		 1051 aa  590  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1802  TonB-dependent receptor plug  35.57 
 
 		 1119 aa  590  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  35.37 
 
 		 1029 aa  586  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1132 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  34.94 
 
 		 1079 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  35.58 
 
 		 1006 aa  575  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  34.23 
 
 		 1023 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  36.42 
 
 		 1012 aa  573  1.0000000000000001e-162  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  35.17 
 
 		 982 aa  571  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  34.45 
 
 		 986 aa  570  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  36.16 
 
 		 1034 aa  567  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  35.64 
 
 		 1047 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  34.21 
 
 		 1063 aa  568  1e-160  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  35.34 
 
 		 1117 aa  566  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6229  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1137 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  35.22 
 
 		 1010 aa  565  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  35.04 
 
 		 1041 aa  563  1.0000000000000001e-159  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  35.01 
 
 		 1071 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  35.44 
 
 		 1128 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  35.56 
 
 		 1043 aa  561  1e-158  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  33.77 
 
 		 1114 aa  561  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  36.49 
 
 		 1025 aa  556  1e-156  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  35.99 
 
 		 1026 aa  556  1e-156  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  35.24 
 
 		 1014 aa  554  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.66 
 
 		 1051 aa  550  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  35.86 
 
 		 999 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  34.04 
 
 		 1023 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  34.64 
 
 		 989 aa  551  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3633  TonB-dependent receptor plug  34.38 
 
 		 1172 aa  548  1e-154  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.896331  normal  0.266388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  34.81 
 
 		 1023 aa  546  1e-154  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  33.78 
 
 		 1059 aa  546  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  35.11 
 
 		 1008 aa  549  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  32.35 
 
 		 1038 aa  546  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1027 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1124 aa  542  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  34.75 
 
 		 1019 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  32.97 
 
 		 1058 aa  538  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  34 
 
 		 1036 aa  537  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  34.32 
 
 		 1000 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1103 aa  535  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  33.14 
 
 		 1155 aa  536  1e-150  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1039 aa  532  1e-149  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.49 
 
 		 1152 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  34.7 
 
 		 1075 aa  530  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  34.74 
 
 		 1154 aa  531  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  34.02 
 
 		 1150 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  35.03 
 
 		 1076 aa  529  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4819  TonB-dependent receptor  33.94 
 
 		 1033 aa  528  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0660191  unclonable  0.000000000000144143 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 1116 aa  528  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  34.41 
 
 		 1023 aa  525  1e-147  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1164 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  34.18 
 
 		 1076 aa  523  1e-146  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  34.27 
 
 		 1020 aa  522  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1076 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0546  outer membrane receptor; ragA protein  34.07 
 
 		 1024 aa  516  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  34.69 
 
 		 1053 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1040 aa  514  1e-144  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.01 
 
 		 1097 aa  512  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  34.16 
 
 		 1177 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.71 
 
 		 1154 aa  507  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0553  tonB-dependent outer membrane receptor  33.88 
 
 		 1019 aa  504  1e-141  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261689  normal  0.358258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  32.49 
 
 		 1080 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1573  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 1041 aa  505  1e-141  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.885203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  33.39 
 
 		 1096 aa  506  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  33.55 
 
 		 1147 aa  504  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1120 aa  502  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 994 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.43 
 
 		 1010 aa  497  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6368  TonB-dependent receptor  31.66 
 
 		 1065 aa  495  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.161575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1064 aa  492  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  32.77 
 
 		 1129 aa  486  1e-136  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2079  TonB-dependent receptor  33.89 
 
 		 1028 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.297647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.51 
 
 		 1018 aa  484  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4849  TonB-dependent receptor plug  33.02 
 
 		 1052 aa  481  1e-134  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.626865  hitchhiker  0.00508751 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 		 1082 aa  483  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.26 
 
 		 1049 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  32.35 
 
 		 1113 aa  476  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1380  TonB-dependent receptor plug  33.76 
 
 		 1192 aa  479  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000706938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 		 1017 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.43 
 
 		 1006 aa  477  1e-133  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>