118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1646 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1646  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 359 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.23409  normal  0.518942 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3387  sodium/calcium exchanger membrane region  67.81 
 
 		 360 aa  432  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1979  calcium/proton antiporter  51.57 
 
 		 382 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.632798 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3860  sodium/calcium exchanger membrane region  50.85 
 
 		 358 aa  340  2e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1195  calcium/proton exchanger  54.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0433  calcium/cation antiporter  54.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.420944  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1490  calcium/proton exchanger  54.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.687933  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1405  calcium/cation antiporter  54.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1144  calcium/cation antiporter  54.86 
 
 		 361 aa  330  2e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.293577  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4124  sodium/calcium exchanger membrane region  58.58 
 
 		 362 aa  330  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.488327 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0009  calcium/proton exchanger  54.86 
 
 		 380 aa  329  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0155  calcium/cation antiporter  54.57 
 
 		 361 aa  328  7e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.416293  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1393  calcium/proton exchanger  56 
 
 		 381 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.107806  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3837  sodium/calcium exchanger membrane region  57.84 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0780669  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3961  sodium/calcium exchanger membrane region  55.71 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0830114  normal  0.184483 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4531  sodium/calcium exchanger membrane region  57.84 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.117991  normal  0.913167 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4424  sodium/calcium exchanger membrane region  55.71 
 
 		 362 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.612228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5773  sodium/calcium exchanger membrane region  57.52 
 
 		 362 aa  326  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4874  putative sodium/calcium exchanger membrane region  58.54 
 
 		 392 aa  317  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4970  sodium/calcium exchanger membrane region  58.94 
 
 		 360 aa  316  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.14573 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4012  sodium/calcium exchanger membrane region  53.98 
 
 		 360 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.406694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3898  sodium/calcium exchanger membrane region  53.98 
 
 		 360 aa  315  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.905693 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4399  Sodium/calcium exchanger membrane region  58.79 
 
 		 361 aa  315  8e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.636528  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1316  Sodium/calcium exchanger  55.14 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.572805  normal  0.640052 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1680  Ca2+/H+ antiporter  58.31 
 
 		 360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.56452  normal  0.743279 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0997  Ca2+/H+ antiporter  57.81 
 
 		 355 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.24422  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3452  sodium/calcium exchanger membrane region  51.25 
 
 		 368 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0339  sodium/calcium exchanger membrane region  52.12 
 
 		 343 aa  303  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5473  sodium/calcium exchanger membrane region  55.08 
 
 		 361 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37302  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4437  sodium/calcium antiporter  54.28 
 
 		 355 aa  296  5e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.212303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6051  sodium/calcium exchanger membrane region  52.82 
 
 		 379 aa  294  1e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6853  putative ionic transporter y4hA  52.81 
 
 		 365 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.529173  normal  0.370974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3735  sodium/calcium exchanger membrane region  53.35 
 
 		 371 aa  286  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0265  sodium/calcium exchanger membrane region  56.33 
 
 		 359 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.152273  normal  0.0264375 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3245  sodium/calcium exchanger membrane region  56.66 
 
 		 382 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400754  normal  0.71488 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0343  calcium/proton antiporter  49.53 
 
 		 385 aa  278  1e-73  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6768  sodium/calcium exchanger membrane region  47.29 
 
 		 392 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.449933  normal  0.231095 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6447  calcium/proton exchanger  47.88 
 
 		 369 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.194017  normal  0.51142 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3965  sodium/calcium exchanger membrane region  50 
 
 		 360 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116135  normal  0.85718 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3493  sodium/calcium exchanger membrane region  40.73 
 
 		 386 aa  243  3e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0439084  normal  0.408385 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11623  ionic transporter integral membrane protein chaA  51.65 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.140145 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0910  sodium/calcium exchanger membrane region  40.31 
 
 		 365 aa  219  7.999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3397  sodium/calcium exchanger membrane region  38.67 
 
 		 365 aa  219  8.999999999999998e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.689879  normal  0.0994344 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3290  sodium/calcium exchanger membrane region  38.96 
 
 		 365 aa  217  2e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1001  calcium/proton antiporter  40.99 
 
 		 365 aa  216  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0979  sodium/calcium exchanger membrane region  40 
 
 		 365 aa  215  9e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3384  sodium/calcium exchanger membrane region  39.38 
 
 		 370 aa  211  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0959  sodium/calcium exchanger membrane region  39.69 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0994  sodium/calcium exchanger membrane region  39.69 
 
 		 361 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2920  calcium/sodium:proton antiporter  35.38 
 
 		 366 aa  207  3e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2332  calcium/sodium:proton antiporter  34.93 
 
 		 364 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1552  calcium/sodium:proton antiporter  36.03 
 
 		 366 aa  203  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.154529 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2574  calcium/sodium:proton antiporter  35.89 
 
 		 366 aa  203  4e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3806  sodium/calcium exchanger membrane region  37.82 
 
 		 377 aa  203  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.209552  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2430  calcium/proton exchanger  35.57 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.64101  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2267  calcium/sodium:proton antiporter  35.79 
 
 		 366 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1793  calcium/sodium:proton antiporter  37.58 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.102364  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2124  calcium/sodium:proton antiporter  36.01 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.898006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2523  calcium/sodium:proton antiporter  36.01 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2233  calcium/sodium:proton antiporter  36.01 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1699  calcium/sodium:proton antiporter  35.57 
 
 		 366 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.569241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1924  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  200  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.25776  normal  0.0698126 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01194  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1324  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.185191  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1366  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0643431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2407  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1383  calcium/sodium:proton antiporter  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.779424  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1902  calcium/sodium:proton antiporter  35.47 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.22655  normal  0.347346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1908  calcium/sodium:proton antiporter  35.47 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01204  hypothetical protein  35.29 
 
 		 366 aa  199  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1966  calcium/sodium:proton antiporter  35.2 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.788667 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1368  calcium/sodium:proton antiporter  35.47 
 
 		 366 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.455587  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3511  sodium/calcium exchanger membrane region  38.1 
 
 		 377 aa  199  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1757  calcium/sodium:proton antiporter  36.34 
 
 		 366 aa  197  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1359  sodium/calcium exchanger membrane region  38.03 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0140249 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0545  calcium/proton transporter, putative  36.29 
 
 		 378 aa  189  8e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.97035  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5666  sodium/calcium exchanger membrane region  37.96 
 
 		 380 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2175  CaCA family calcium/proton exchanger  32.05 
 
 		 382 aa  142  9.999999999999999e-33  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.226472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0674  Sodium/calcium exchanger membrane region  28.29 
 
 		 363 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.774852  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2992  sodium/calcium exchanger membrane region  31.95 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198433  normal  0.141377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0764  calcium/proton antiporter, putative  28.35 
 
 		 365 aa  135  9e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3147  Ca2+/H+ antiporter  27.61 
 
 		 385 aa  132  7.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.409231  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0668  Sodium/calcium exchanger membrane region  27.62 
 
 		 367 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.479816 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2731  sodium/calcium exchanger membrane region  31.6 
 
 		 365 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0140  sodium/calcium exchanger membrane region  28.25 
 
 		 374 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.414584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24550  Ca2+/H+ antiporter  33.14 
 
 		 440 aa  96.7  5e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0945764  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4046  calcium/proton antiporter, CaCA family  25.56 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.633248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_67118  Ca2+/H+ antiporter  25.77 
 
 		 416 aa  67.8  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.112466  normal  0.866268 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0894  calcium/proton exchanger  25.32 
 
 		 367 aa  66.2  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0484  calcium/proton exchanger  26.53 
 
 		 351 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0535  calcium/proton exchanger  26.12 
 
 		 354 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0535  calcium/proton exchanger  26.12 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0397  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  26.12 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0465  calcium/proton exchanger  26.12 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0406  calcium/proton exchanger  25.71 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0419  calcium/proton exchanger  25.71 
 
 		 354 aa  60.5  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0393  Ca2+/H+ antiporter (calcium/proton exchanger)  25.71 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0142  calcium/proton exchanger  26.69 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2705  calcium/cation antiporter  24.63 
 
 		 370 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000150317  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1527  calcium/proton exchanger  24.13 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.872367  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>