27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1633 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1633  phosphopantetheine-binding  100 
 
 		 82 aa  165  2e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0617964 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3405  phosphopantetheine-binding  65.43 
 
 		 82 aa  115  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.439455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0027  phosphopantetheine-binding  29.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0175854  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0029  phosphopantetheine-binding  29.33 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1973  8-amino-7-oxononanoate synthase  27.78 
 
 		 544 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1157  putative polyketide synthase subunit  26.32 
 
 		 94 aa  47.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2939  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  26.32 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2785  phosphopantetheine attachment site domain-containing protein  26.32 
 
 		 89 aa  47.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4108  Beta-ketoacyl synthase  25.35 
 
 		 1656 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.307999 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0280  polyketide synthase, putative  27.63 
 
 		 94 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1647  phosphopantetheine-binding  30.43 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.546913 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3102  phosphopantetheine-binding  27.63 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0141016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3020  phosphopantetheine-binding  27.63 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1750  amino acid adenylation domain protein  33.75 
 
 		 3337 aa  45.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0447353 
 
 
-
 
NC_003296  RS01916  hypothetical protein  27.27 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.41353  normal  0.0259122 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6476  amino acid adenylation domain-containing protein  28.38 
 
 		 4478 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1874  Beta-ketoacyl synthase  28.99 
 
 		 2762 aa  43.9  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.441588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2412  Beta-ketoacyl synthase  22.22 
 
 		 1939 aa  42.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2690  beta-ketoacyl synthase  31.17 
 
 		 1698 aa  42.7  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.588409  normal  0.25936 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1961  Beta-ketoacyl synthase  25 
 
 		 2103 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.771786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2735  phosphopantetheine-binding  25.33 
 
 		 103 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5619  polyketide synthase  22.78 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00123968  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1425  KR domain protein  19.74 
 
 		 6876 aa  40.8  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3485  beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 		 1704 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.19651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3535  beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 		 1704 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3472  beta-ketoacyl synthase  28.95 
 
 		 1704 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5324  beta-ketoacyl synthase  22.22 
 
 		 897 aa  40.4  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>