87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1582 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1582  peptidase M14 carboxypeptidase A  100 
 
 		 405 aa  838    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00197244  normal  0.432396 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.09 
 
 		 376 aa  104  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.11613  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1960  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.12 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.240759  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2160  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.83 
 
 		 379 aa  103  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.746604  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2073  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.12 
 
 		 375 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0474309  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2424  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  32.35 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2149  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.22 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.385121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2051  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.77 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.888658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2246  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.67 
 
 		 384 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.222943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3024  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.17 
 
 		 378 aa  101  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0863993  normal  0.0499845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2300  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.77 
 
 		 375 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000207192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2222  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.67 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1905  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.71 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00901911  hitchhiker  0.0000123678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1610  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.67 
 
 		 384 aa  101  3e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2073  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.45 
 
 		 384 aa  100  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.378615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0979  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.09 
 
 		 380 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.268801  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2415  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.35 
 
 		 375 aa  100  6e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000158665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2047  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.35 
 
 		 375 aa  99.8  8e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  hitchhiker  0.0000000000723635 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3575  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.29 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.577581  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1055  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.29 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387993  normal  0.570338 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1376  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.86 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0050041 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1937  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.29 
 
 		 375 aa  97.8  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.568911  normal  0.0124059 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1942  peptidase M14, carboxypeptidase A  30.17 
 
 		 375 aa  97.4  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0268  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.78 
 
 		 375 aa  97.1  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3179  zinc carboxypeptidase  28.46 
 
 		 384 aa  96.7  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129073  normal  0.290427 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2315  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.96 
 
 		 375 aa  96.3  8e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000568724  hitchhiker  0.00110139 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1798  hypothetical protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.117776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0445  zinc carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.884358  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1322  zinc carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.111007  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0707  zinc carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.000200577  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1162  zinc carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000370841  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2139  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.86 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.187915  normal  0.791166 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1331  zinc carboxypeptidase family protein  27.8 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1468  peptidase  27.8 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000305268  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1978  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.8 
 
 		 388 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.228376  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2260  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.86 
 
 		 384 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1091  zinc carboxypeptidase family protein  28.22 
 
 		 384 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0175299  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5550  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.46 
 
 		 384 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.400192  normal  0.189635 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2692  zinc carboxypeptidase family protein  25.74 
 
 		 429 aa  94  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.0016795  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1015  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.75 
 
 		 380 aa  94  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.967061  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2558  zinc carboxypeptidase family protein  29.24 
 
 		 380 aa  93.6  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2295  peptidase M14 carboxypeptidase A  28.99 
 
 		 375 aa  93.6  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00080179  normal  0.434754 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1719  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  29.41 
 
 		 375 aa  93.2  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127578  normal  0.0560142 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1465  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.85 
 
 		 376 aa  93.2  8e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000868597  normal  0.0173526 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1338  peptidase M14, carboxypeptidase A  29.58 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.412426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000756  zinc carboxypeptidase domain protein  29.34 
 
 		 374 aa  92.4  1e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000314112  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3662  peptidase M14, carboxypeptidase A  31.03 
 
 		 383 aa  92  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000173445  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2257  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.11 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000328738  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04891  zinc-carboxypeptidase  26.02 
 
 		 400 aa  90.9  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1641  peptidase M14, carboxypeptidase A  32.65 
 
 		 375 aa  91.3  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1839  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.83 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.419157  normal  0.0171769 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1231  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.45 
 
 		 378 aa  89.4  1e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601484 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01259  predicted carboxypeptidase, Zn dependent  29.8 
 
 		 379 aa  88.6  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.59847  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1964  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.94 
 
 		 382 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0593717 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1804  peptidase M14 carboxypeptidase A  25.26 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0544452  normal  0.0731495 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2163  peptidase M14 carboxypeptidase A  30 
 
 		 381 aa  85.1  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.304741  normal  0.191747 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2364  hypothetical protein  25.52 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0816102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0741  hypothetical protein  26.79 
 
 		 463 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.849095  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2324  zinc carboxypeptidase domain-containing protein  28.28 
 
 		 375 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2008  hypothetical protein  28.86 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0949497 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3331  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.52 
 
 		 382 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.7125 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3278  peptidase M14, carboxypeptidase A  29 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.546138  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3113  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.2 
 
 		 380 aa  84.7  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2832  peptidase M14, carboxypeptidase A  25.46 
 
 		 369 aa  84.3  0.000000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.100219 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27470  putative zinc carboxypeptidase  27.54 
 
 		 375 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.152383  normal  0.163866 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0079  zinc carboxypeptidase  27.43 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3253  peptidase M14 carboxypeptidase A  27.78 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.310529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1240  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.33 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.398831  normal  0.291375 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1519  peptidase M14, carboxypeptidase A  23.42 
 
 		 398 aa  76.3  0.0000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49091  predicted protein  33.1 
 
 		 459 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2589  hypothetical protein  36.03 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0393538  normal  0.0858047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1906  hypothetical protein  31.58 
 
 		 351 aa  61.2  0.00000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3979  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.98 
 
 		 500 aa  59.7  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.946753 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3329  peptidase M14 carboxypeptidase A  30.11 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0666  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.67 
 
 		 361 aa  56.2  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0037  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.94 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  33.04 
 
 		 821 aa  53.5  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2804  peptidase M14, carboxypeptidase A  27.07 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2664  peptidase M14 carboxypeptidase A  32.71 
 
 		 365 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00317155  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1725  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.37 
 
 		 355 aa  51.2  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1204  peptidase M14, carboxypeptidase A  34.31 
 
 		 262 aa  49.7  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.670707  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4236  peptidase M14 carboxypeptidase A  23.9 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0580382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3421  peptidase M14 carboxypeptidase A  29.46 
 
 		 406 aa  47  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000158618  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4249  peptidase M14 carboxypeptidase A  31.86 
 
 		 557 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3043  hypothetical protein  25.95 
 
 		 490 aa  45.4  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217728 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2389  peptidase M14, carboxypeptidase A  28.29 
 
 		 599 aa  44.3  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.979451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10433  hypothetical protein  25.95 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.968158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>