More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1528 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
246 aa  495  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.606354  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4444  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  75.2 
 
 
246 aa  392  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.740498  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0128  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  73.17 
 
 
246 aa  369  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1378  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.73 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3776  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.51 
 
 
247 aa  263  2e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0886  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.51 
 
 
246 aa  262  4e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  56.43 
 
 
260 aa  261  8e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.673066  normal  0.302564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0342  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.85 
 
 
247 aa  255  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.973802  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.36 
 
 
254 aa  255  5e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.188133 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2504  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
245 aa  252  3e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0547462  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5811  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.05 
 
 
245 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.256095 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1428  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.44 
 
 
247 aa  250  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.65 
 
 
246 aa  248  5e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.934127 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1155  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
269 aa  248  5e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3099  short chain dehydrogenase  52.03 
 
 
247 aa  246  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0900092 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3448  short chain dehydrogenase  51.43 
 
 
246 aa  242  3e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3357  short chain dehydrogenase  50.41 
 
 
247 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0533956 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
245 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2479  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.46 
 
 
245 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.314744  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 
245 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.912792 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4640  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.37 
 
 
246 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.384242  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2528  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.44 
 
 
245 aa  237  1e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1622  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  52.28 
 
 
245 aa  236  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.06 
 
 
246 aa  236  3e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.348425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3012  putative short-chain dehydrogenase  52.87 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2692  short chain dehydrogenase  50.61 
 
 
246 aa  234  9e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.843441 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1272  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1104  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0256  short chain dehydrogenase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.22 
 
 
245 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.455308  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0103  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0321  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.732036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1687  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  53.75 
 
 
247 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.867635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1775  dehydrogenases with different specificities  53.75 
 
 
247 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.2 
 
 
246 aa  228  5e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.37 
 
 
254 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0504887  normal  0.311319 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1707  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50 
 
 
247 aa  223  2e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0769  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.03 
 
 
244 aa  221  9e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2168  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.54 
 
 
247 aa  221  9.999999999999999e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.681241  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3110  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.94 
 
 
246 aa  217  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07806  Versicolorin reductase (EC 1.1.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00791]  45.63 
 
 
264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00450533  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0785  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  45.53 
 
 
246 aa  211  7e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
262 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4663  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.61 
 
 
248 aa  208  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.273887  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.33 
 
 
244 aa  208  7e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06560  short chain dehydrogenase  47.3 
 
 
245 aa  207  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.96 
 
 
248 aa  207  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.997672 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.12 
 
 
245 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2838  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
253 aa  205  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.34 
 
 
250 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.75 
 
 
248 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0806  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
248 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0061  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.2 
 
 
249 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.212664 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06450  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G01040)  44.58 
 
 
247 aa  200  1.9999999999999998e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0336  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.56 
 
 
248 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.87 
 
 
243 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal  0.0260274 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1091  7-alpha-hydroxysteroid dehydrogenase  44.53 
 
 
246 aa  198  6e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0983747 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2870  3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein] reductase  43.43 
 
 
254 aa  198  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00146  oxidoreductase, putative (Eurofung)  41.96 
 
 
265 aa  198  7e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.465009  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0719  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.15 
 
 
248 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4634  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.17 
 
 
245 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.821225  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
251 aa  196  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.755812  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.72 
 
 
249 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.728081  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1303  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.04 
 
 
243 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.58 
 
 
251 aa  195  6e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  194  1e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3184  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.98 
 
 
249 aa  193  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0196402  normal  0.84005 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2299  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
248 aa  192  5e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.470556  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1712  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1689  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1847  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1886  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4263  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.9 
 
 
247 aa  189  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.218256  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1370  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.37 
 
 
271 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3856  short chain dehydrogenase  46.25 
 
 
245 aa  188  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.578417  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0266  putative short-chain dehydrogenase  44.94 
 
 
248 aa  188  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3493  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  188  8e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1932  short chain dehydrogenase  42.51 
 
 
252 aa  187  9e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.362835  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3812  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.03 
 
 
255 aa  188  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466174  normal  0.349855 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1150  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.48 
 
 
253 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.718772 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1994  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.35 
 
 
254 aa  187  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.150923 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0958  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  44.72 
 
 
247 aa  187  1e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1849  short chain dehydrogenase  42.91 
 
 
252 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4301  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
249 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.865881  normal  0.154046 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1664  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
252 aa  186  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.316007  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2858  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.28 
 
 
245 aa  185  5e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3459  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.74 
 
 
249 aa  185  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0287  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.45 
 
 
253 aa  184  8e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.129193  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4562  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.53 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0570869  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1337  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.94 
 
 
248 aa  184  8e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.378694  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1290  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.756389  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1315  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  42.74 
 
 
246 aa  184  1.0000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0295  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.15 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.963194  normal  0.327663 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5822  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.72 
 
 
248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.245983 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3866  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.68 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.508042  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1705  short chain dehydrogenase  42.11 
 
 
252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.957083  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2884  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.43 
 
 
254 aa  183  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.247602  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45430  short chain dehydrogenase  45.83 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>