More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1428 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  54.43 
 
 		 799 aa  906    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  54.58 
 
 		 772 aa  839    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  57.96 
 
 		 797 aa  938    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 791 aa  1625    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  39.33 
 
 		 798 aa  553  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  36.38 
 
 		 782 aa  513  1e-144  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  39.22 
 
 		 713 aa  483  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  34.14 
 
 		 1117 aa  385  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  30.79 
 
 		 792 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  31.23 
 
 		 781 aa  329  1.0000000000000001e-88  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 823 aa  303  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  31 
 
 		 763 aa  299  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  28.59 
 
 		 767 aa  297  4e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.56 
 
 		 788 aa  297  5e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  28.79 
 
 		 960 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0102  TonB-dependent siderophore receptor  32.82 
 
 		 795 aa  115  4.0000000000000004e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  31.11 
 
 		 848 aa  101  7e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3110  TonB-dependent receptor  32.19 
 
 		 943 aa  97.8  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.183565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  27.92 
 
 		 760 aa  96.7  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 		 748 aa  97.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  32.9 
 
 		 1004 aa  96.7  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  30.22 
 
 		 776 aa  94.7  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0687  TonB-dependent receptor plug  32.08 
 
 		 1066 aa  94.4  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000368549  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 		 882 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  31.22 
 
 		 747 aa  92  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4805  TonB-dependent siderophore receptor  29.92 
 
 		 791 aa  90.9  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0410465  normal  0.0531231 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0876  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 759 aa  90.9  8e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.366778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1274  TonB-dependent receptor plug  21.97 
 
 		 861 aa  89.7  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  29.15 
 
 		 809 aa  89  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2008  TonB-dependent receptor, putative  26.67 
 
 		 833 aa  88.2  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2496  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 785 aa  87.8  7e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2718  TonB-dependent receptor plug  31.95 
 
 		 1068 aa  87.4  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1769  TonB-dependent receptor plug  30.26 
 
 		 1085 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  28.35 
 
 		 814 aa  87  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 828 aa  86.7  0.000000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1260  TonB-dependent receptor  27.82 
 
 		 866 aa  86.3  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1535  TonB-dependent receptor  29.88 
 
 		 972 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.39302  normal  0.5632 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  29.59 
 
 		 769 aa  85.9  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  28.68 
 
 		 836 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  31.25 
 
 		 932 aa  85.5  0.000000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0685  TonB-dependent siderophore receptor  30.08 
 
 		 781 aa  85.1  0.000000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00630295  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  33.19 
 
 		 1062 aa  85.1  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1034  TonB-dependent receptor  26.44 
 
 		 938 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  26.54 
 
 		 833 aa  85.1  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  31.6 
 
 		 1047 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3052  TonB-dependent receptor plug  28.11 
 
 		 753 aa  85.1  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.129578 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4298  TonB-dependent siderophore receptor  27.57 
 
 		 824 aa  84.7  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.742577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  30.41 
 
 		 778 aa  84.3  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5287  TonB-dependent receptor  30.21 
 
 		 933 aa  84.7  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.284266 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 986 aa  84  0.000000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0300  TonB-dependent receptor plug  31.54 
 
 		 1079 aa  84  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.11238 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2624  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1051 aa  82.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  26.27 
 
 		 750 aa  82.4  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  33.33 
 
 		 1189 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0975  TonB-dependent siderophore receptor  28.11 
 
 		 806 aa  82.4  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.608799  normal  0.162482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  32.84 
 
 		 1040 aa  82  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6808  TonB-dependent receptor plug  28.23 
 
 		 1040 aa  81.6  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.14685  hitchhiker  0.0000111053 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  31.8 
 
 		 1034 aa  81.3  0.00000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.21 
 
 		 1102 aa  80.9  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.91 
 
 		 793 aa  80.9  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 		 1050 aa  80.9  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  26.78 
 
 		 721 aa  80.9  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.69 
 
 		 1021 aa  80.5  0.0000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  35.98 
 
 		 1076 aa  80.9  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4238  TonB-dependent receptor plug  32.31 
 
 		 1101 aa  80.5  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  32.04 
 
 		 845 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  27.84 
 
 		 854 aa  80.9  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2444  TonB-dependent receptor  27.44 
 
 		 1001 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0203  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 		 1047 aa  79.7  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  29.36 
 
 		 1026 aa  79.3  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  26.88 
 
 		 828 aa  79  0.0000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5138  TonB-dependent siderophore receptor  30.11 
 
 		 789 aa  79  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0272944 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4721  TonB-dependent receptor  28.51 
 
 		 917 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1103 aa  78.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.13 
 
 		 1023 aa  78.2  0.0000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4224  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1063 aa  78.2  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4221  TonB-dependent siderophore receptor  28.94 
 
 		 795 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2454  TonB-dependent receptor plug  34.91 
 
 		 1024 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000521114  normal  0.729289 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 1076 aa  77.8  0.0000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.49 
 
 		 1161 aa  77.8  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  29.53 
 
 		 1019 aa  77.8  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  28.84 
 
 		 1006 aa  77  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0199  TonB-dependent siderophore receptor  28.21 
 
 		 810 aa  75.9  0.000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.286371 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 1089 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4648  TonB-dependent receptor  32.58 
 
 		 653 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  29.57 
 
 		 1071 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.45 
 
 		 1050 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1905  TonB-dependent receptor plug  30.36 
 
 		 1070 aa  76.6  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  32.96 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 		 1013 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  30.24 
 
 		 815 aa  76.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2119  TonB-dependent siderophore receptor  27.87 
 
 		 810 aa  76.6  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_4000  hypothetical protein  28.94 
 
 		 972 aa  75.9  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.463681 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2284  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 767 aa  75.9  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.175544  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4568  TonB-dependent receptor  27.19 
 
 		 776 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0824  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 		 659 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  26.72 
 
 		 942 aa  75.5  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3220  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 1115 aa  75.5  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1006  TonB-dependent receptor plug  30.56 
 
 		 1038 aa  75.1  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0320899  normal  0.449755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0198  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 1020 aa  75.1  0.000000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>