More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1304 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1304  FAD linked oxidase domain protein  100 
 
 		 456 aa  949    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0717469  normal  0.684944 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1864  FAD linked oxidase domain protein  56.02 
 
 		 458 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.105212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1637  FAD linked oxidase, N-terminal  58.02 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4415  FAD linked oxidase, N-terminal  53.69 
 
 		 456 aa  447  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2737  FAD linked oxidase domain protein  48.87 
 
 		 459 aa  433  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000391962  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0071  FAD linked oxidase domain protein  51.24 
 
 		 466 aa  422  1e-117  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1407  FAD linked oxidase-like  48.87 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3657  FAD linked oxidase domain protein  46.05 
 
 		 456 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0260627  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1762  FAD linked oxidase domain protein  45.29 
 
 		 499 aa  390  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000896481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2203  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 		 479 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.614292  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1992  FAD linked oxidase domain protein  44.72 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.918522 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2459  FAD linked oxidase-like  43.1 
 
 		 479 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.6744  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4422  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.84 
 
 		 479 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.344156  normal  0.908517 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1506  FAD linked oxidase-like  43.95 
 
 		 461 aa  377  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.290263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5365  FAD linked oxidase domain-containing protein  43.37 
 
 		 464 aa  369  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.874918 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2767  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.49 
 
 		 461 aa  371  1e-101  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0847094 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2335  FAD linked oxidase-like  42.15 
 
 		 474 aa  362  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.822844  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1606  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.07 
 
 		 472 aa  362  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.935495 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4911  FAD linked oxidase domain-containing protein  44.78 
 
 		 465 aa  359  6e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001560  putative oxidoreductase oxygen dependent FAD-dependent protein  40.39 
 
 		 461 aa  359  7e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3377  FAD linked oxidase-like  40.36 
 
 		 473 aa  352  5.9999999999999994e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0469731  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2408  FAD linked oxidase domain protein  42.6 
 
 		 469 aa  343  2.9999999999999997e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.359898  decreased coverage  0.00141792 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3469  FAD linked oxidase-like protein  40.83 
 
 		 463 aa  335  7e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1488  FAD linked oxidase domain-containing protein  40.67 
 
 		 461 aa  334  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0773  putative FAD/FMN-containing oxidoreductase  42.02 
 
 		 462 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.563549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1804  FAD linked oxidase-like  40.17 
 
 		 473 aa  325  9e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2627  FAD linked oxidase domain protein  40.85 
 
 		 468 aa  319  6e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0898791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1926  FAD linked oxidase domain protein  40.78 
 
 		 476 aa  319  7.999999999999999e-86  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.47869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4454  FAD linked oxidase domain protein  40.58 
 
 		 462 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0421641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1775  FAD linked oxidase-like protein  42.31 
 
 		 463 aa  317  4e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.719303 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3463  FAD linked oxidase domain protein  42.83 
 
 		 465 aa  316  7e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0426  FAD linked oxidase-like protein  43.53 
 
 		 465 aa  312  7.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4023  FAD linked oxidase domain protein  41.5 
 
 		 602 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3462  FAD linked oxidase domain protein  41.56 
 
 		 477 aa  310  2.9999999999999997e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2398  FAD linked oxidase domain protein  41.35 
 
 		 461 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.349533  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1025  FAD linked oxidase domain protein  40.81 
 
 		 465 aa  306  6e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2962  FAD linked oxidase domain protein  41.58 
 
 		 465 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0158537  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3750  FAD linked oxidase domain-containing protein  39.28 
 
 		 444 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.589145  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2260  FAD linked oxidase domain protein  42.57 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00839199  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1030  FAD linked oxidase domain protein  39.65 
 
 		 477 aa  298  1e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4138  FAD linked oxidase domain protein  38.62 
 
 		 470 aa  295  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1085  FAD linked oxidase-like  38.11 
 
 		 478 aa  286  5.999999999999999e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.439426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1360  FAD/FMN-containing dehydrogenase  36.02 
 
 		 473 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00315473  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0060  putative oxidoreductase, oxygen dependent, FAD-dependent protein  35.85 
 
 		 465 aa  263  4.999999999999999e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5399  FAD linked oxidase domain-containing protein  37 
 
 		 478 aa  260  3e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04780  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  36.91 
 
 		 469 aa  260  4e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.62663  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11743  oxidoreductase  37.5 
 
 		 461 aa  238  1e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0117669  normal  0.752588 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3339  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.72 
 
 		 448 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.235624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2025  FAD-binding protein  31.93 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3666  FAD linked oxidase domain protein  34.59 
 
 		 446 aa  207  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2731  FAD linked oxidase domain-containing protein  34.3 
 
 		 472 aa  207  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0114478  normal  0.981249 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1883  FAD linked oxidase domain protein  32.89 
 
 		 462 aa  200  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000001515  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4534  FAD linked oxidase domain-containing protein  33.26 
 
 		 490 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.021743 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4344  FAD linked oxidase domain protein  35.81 
 
 		 450 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.577793 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4113  FAD linked oxidase domain-containing protein  31.13 
 
 		 492 aa  186  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2404  FAD linked oxidase domain protein  33.33 
 
 		 495 aa  183  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.173158  hitchhiker  0.00629594 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2149  FAD linked oxidase domain protein  35.38 
 
 		 458 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3943  FAD linked oxidase domain protein  30.52 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0351  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.56 
 
 		 466 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0426  FAD-dependent oxidase  30.02 
 
 		 444 aa  177  5e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0166645  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4754  FAD linked oxidase domain protein  31.69 
 
 		 467 aa  176  9e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.13941 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4892  FAD-dependent oxidase  29.39 
 
 		 444 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.070023  normal  0.492965 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06290  FAD/FMN-dependent dehydrogenase  30.41 
 
 		 734 aa  173  6.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.945102  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1637  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.32 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4161  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.49 
 
 		 481 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.127366 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1131  FAD linked oxidase domain protein  34 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1816  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.6 
 
 		 460 aa  166  8e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0655989  normal  0.012595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1767  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.25 
 
 		 484 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.778905  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0376  FAD linked oxidase domain protein  30.4 
 
 		 753 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.169515  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6811  FAD/FMN-containing dehydrogenase-like protein  30.07 
 
 		 596 aa  165  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2430  FAD linked oxidase domain protein  29.12 
 
 		 459 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.000620146  normal  0.138472 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1471  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 		 462 aa  163  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3376  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.66 
 
 		 726 aa  162  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.082286  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3087  FAD linked oxidase-like protein  29.74 
 
 		 752 aa  162  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00332  FAD linked oxidase, N-terminal  26.5 
 
 		 705 aa  160  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2044  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.98 
 
 		 490 aa  160  5e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.412161  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0926  FAD linked oxidase domain protein  30.89 
 
 		 764 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1435  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.29 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.910534  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1417  FAD linked oxidase-like protein  28.29 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09308  FAD binding domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G00730)  32.31 
 
 		 473 aa  155  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.898615 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3488  FAD linked oxidase domain-containing protein  38.17 
 
 		 474 aa  154  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.953836  normal  0.585034 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05846  FAD binding oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G14630)  29.85 
 
 		 472 aa  151  2e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0061  FAD linked oxidase domain protein  28.67 
 
 		 474 aa  151  3e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3122  FAD linked oxidase domain protein  31.21 
 
 		 449 aa  150  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4651  FAD linked oxidase domain-containing protein  28.57 
 
 		 462 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.338628  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2435  oxidoreductase, FAD-binding, putative  28.13 
 
 		 471 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0684957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6331  FAD linked oxidase domain protein  30.5 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00000929143  hitchhiker  0.000833417 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0043  twin-arginine translocation pathway signal  29.78 
 
 		 532 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.162495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0347  FAD linked oxidase-like  28.08 
 
 		 459 aa  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.604176  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6057  FAD linked oxidase domain-containing protein  29.93 
 
 		 451 aa  135  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7186  FAD linked oxidase domain-containing protein  26.54 
 
 		 473 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.73776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0404  putative reticuline oxidase  39.15 
 
 		 448 aa  134  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.993736  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0127  FAD linked oxidase domain protein  27.33 
 
 		 775 aa  134  5e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.48716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1027  FAD/FMN-containing dehydrogenase  26.16 
 
 		 436 aa  134  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.548155  normal  0.360167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2763  putative F420-dependent oxidoreductase  27.91 
 
 		 758 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1620  FAD linked oxidase domain protein  28.21 
 
 		 465 aa  131  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.600504  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3628  FAD linked oxidase domain protein  29.57 
 
 		 451 aa  131  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1824  FAD linked oxidase domain protein  32.26 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3115  putative F420-dependent oxidoreductase  28.35 
 
 		 754 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1448  histidine kinase  38.33 
 
 		 487 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>