255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1273 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1273  manganese transporter NRAMP  100 
 
 
428 aa  847    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1689  natural resistance-associated macrophage protein  67.25 
 
 
401 aa  545  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.973606  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3378  natural resistance-associated macrophage protein  35.18 
 
 
439 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3567  natural resistance-associated macrophage protein  29.53 
 
 
401 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6352  natural resistance-associated macrophage protein  30.08 
 
 
419 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1593  natural resistance-associated macrophage protein  28.35 
 
 
412 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1144  natural resistance-associated macrophage protein  28.57 
 
 
406 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.131374  normal  0.181979 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3408  natural resistance-associated macrophage protein  27.32 
 
 
397 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.913071  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01595  putative manganese/divalent cation transport protein (NRAMP family)  29.38 
 
 
398 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0168  natural resistance-associated macrophage protein  29.62 
 
 
416 aa  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.988448  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01940  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  29.32 
 
 
415 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.612589 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1157  natural resistance-associated macrophage protein  30.55 
 
 
432 aa  125  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08916  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family protein  25.12 
 
 
403 aa  124  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3239  natural resistance-associated macrophage protein  29.23 
 
 
408 aa  122  9e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.770322  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3815  natural resistance-associated macrophage protein  25.66 
 
 
408 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0657  natural resistance-associated macrophage protein  30.03 
 
 
415 aa  117  3e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000666945  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1739  natural resistance-associated macrophage protein  27.54 
 
 
418 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0068  natural resistance-associated macrophage protein  28.25 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2040  natural resistance-associated macrophage protein  27.98 
 
 
432 aa  107  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000137009  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2339  natural resistance-associated macrophage protein  29.65 
 
 
432 aa  105  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1141  manganese transporter NRAMP  25.52 
 
 
425 aa  100  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2230  Mn2+/Fe2+ transporter  26.25 
 
 
433 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.446003 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2933  natural resistance-associated macrophage protein  28.47 
 
 
453 aa  96.7  6e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2464  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.46 
 
 
434 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0413329  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2655  manganese transporter NRAMP  29.22 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0379  natural resistance-associated macrophage protein  23.23 
 
 
441 aa  95.1  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0915646 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0233  Mn2+/Fe2+ transporter  25.16 
 
 
435 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0866984  normal  0.483046 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5257  natural resistance-associated macrophage protein  25.31 
 
 
432 aa  93.2  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.885599  normal  0.0446579 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2242  natural resistance-associated macrophage protein  27.13 
 
 
447 aa  92.8  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1353  natural resistance-associated macrophage protein  27.59 
 
 
455 aa  92.8  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.573768  normal  0.0815096 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3647  natural resistance-associated macrophage protein  26.54 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.438351  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0868  manganese transporter NRAMP  25.93 
 
 
431 aa  89.7  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1916  Mn2+/Fe2+ transporter  25.25 
 
 
434 aa  85.5  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0325807  decreased coverage  0.000000836565 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17030  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.86 
 
 
429 aa  84.3  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.400291  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0697  natural resistance-associated macrophage protein  25.5 
 
 
430 aa  83.2  0.000000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3999  natural resistance-associated macrophage protein  25.58 
 
 
428 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.358351 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0796  manganese transport protein MntH  23.36 
 
 
434 aa  82.4  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00765423  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5250  Mn2+/Fe2+ transporter  25.4 
 
 
445 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1257  manganese transporter NRAMP  25.18 
 
 
435 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1894  natural resistance-associated macrophage protein  22.89 
 
 
414 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6733  natural resistance-associated macrophage protein  25.96 
 
 
430 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.694206  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1574  natural resistance-associated macrophage protein  25.64 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6257  natural resistance-associated macrophage protein  25.64 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1755  natural resistance-associated macrophage protein  21.92 
 
 
404 aa  80.1  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1183  natural resistance-associated macrophage protein  22.83 
 
 
420 aa  80.1  0.00000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1556  manganese/divalent cation transport protein  24.68 
 
 
439 aa  80.1  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.123302 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6575  manganese/iron transporter  25.81 
 
 
432 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3045  natural resistance-associated macrophage protein  24.58 
 
 
420 aa  79.3  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.830988  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1583  natural resistance-associated macrophage protein  22.94 
 
 
417 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3908  natural resistance-associated macrophage protein  23.65 
 
 
423 aa  77  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3781  manganese transporter NRAMP  24.15 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.175654  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4086  natural resistance-associated macrophage protein  24.1 
 
 
429 aa  76.6  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5718  Mn2+/Fe2+ transporter  24.15 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0603927  normal  0.190696 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4587  Mn2+/Fe2+ transporter  24.15 
 
 
436 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39040  hypothetical protein  24.68 
 
 
433 aa  75.9  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5808  natural resistance-associated macrophage protein  26.44 
 
 
439 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0465  natural resistance-associated macrophage protein  22.25 
 
 
414 aa  75.5  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.169893  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4171  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  25.13 
 
 
433 aa  75.1  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.248736  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0709  manganese transport protein MntH  24.49 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.947225  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0297  natural resistance-associated macrophage protein  23.38 
 
 
427 aa  75.1  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1187  manganese transport protein MntH  23.38 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000302407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0075  natural resistance-associated macrophage protein  26.11 
 
 
438 aa  75.5  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.289103  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1165  manganese transport protein MntH  23.38 
 
 
450 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.00000527226  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4551  natural resistance-associated macrophage protein  24.1 
 
 
429 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0406196 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7276  putative manganese transport protein  24.18 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0735  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.31 
 
 
432 aa  73.9  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4366  manganese transporter NRAMP  25.89 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3643  natural resistance-associated macrophage protein  24.5 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.145249  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4453  Mn2+/Fe2+ transporter  25.89 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0420753  normal  0.0620923 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2571  putative metal ion transport protein  24.41 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.662179  normal  0.0502051 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4747  Mn2+/Fe2+ transporter  25.89 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0640  Mn2+/Fe2+ transporter  23.94 
 
 
411 aa  73.2  0.000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.122692  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2251  natural resistance-associated macrophage protein  21.78 
 
 
427 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000998148  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1218  natural resistance-associated macrophage protein  24.83 
 
 
422 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0750  Mn2+/Fe2+ transporter  25.06 
 
 
435 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0913306 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1583  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  24.02 
 
 
439 aa  72.8  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1308  natural resistance-associated macrophage protein  24.89 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.133817  normal  0.629684 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2624  Mn2+/Fe2+ transporter  25 
 
 
444 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.882003  normal  0.940847 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4013  Mn2+/Fe2+ transporter  23.9 
 
 
441 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.223223  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2642  manganese transport protein MntH  23.72 
 
 
413 aa  71.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01790  Mn2+/Fe2_ transporter, NRAMP family  24.92 
 
 
446 aa  70.9  0.00000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0731  manganese transport protein MntH  24.51 
 
 
412 aa  70.9  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0992532  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0541  Mn2+/Fe2+ transporter  25.99 
 
 
457 aa  70.5  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2772  manganese transport protein MntH  23.66 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0925815  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1960  manganese transport protein MntH  23.83 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.763494  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2551  manganese transport protein MntH  23.66 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.628016  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3570  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.97 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.801312  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2600  manganese transport protein MntH  23.66 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.752392  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2666  manganese transport protein MntH  23.66 
 
 
392 aa  70.5  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0966  manganese transport protein MntH  24.81 
 
 
412 aa  70.1  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00858217  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3586  Mn2+/Fe2+ transporter  24.03 
 
 
463 aa  69.7  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0586621 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1735  manganese transport protein MntH  23.87 
 
 
431 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4475  Mn2+/Fe2+ transporter  23.66 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.361085  normal  0.934286 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1266  Mn2+/Fe2+ transporter, NRAMP family  22.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.796866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3623  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.180789  normal  0.74128 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1278  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.913398  normal  0.0884608 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3295  manganese transport protein MntH  23.87 
 
 
411 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.386188  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6795  natural resistance-associated macrophage protein  21.94 
 
 
438 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2543  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.630875  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2682  manganese transport protein MntH  22.83 
 
 
412 aa  68.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0112645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>