More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1187 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3344  heavy metal translocating P-type ATPase  51.56 
 
 
663 aa  649    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.601445  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6746  heavy metal translocating P-type ATPase  53.9 
 
 
670 aa  674    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11668  cation-transporting ATPase, P-type, putative zinc-transporting ATPase  52 
 
 
654 aa  654    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.292435  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6787  heavy metal translocating P-type ATPase  53.68 
 
 
671 aa  672    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.423495  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1187  heavy metal translocating P-type ATPase  100 
 
 
671 aa  1360    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.491713 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1064  cation-transporting ATPase  60.74 
 
 
667 aa  743    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.632696  normal  0.380581 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1510  cation-transporting ATPase; zinc-transporting ATPase  58.37 
 
 
664 aa  751    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00216994  normal  0.157435 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2686  heavy metal translocating P-type ATPase  60.67 
 
 
656 aa  789    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.682129  normal  0.103785 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1966  heavy metal translocating P-type ATPase  56.09 
 
 
682 aa  666    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2557  cadmium-translocating P-type ATPase  51.45 
 
 
629 aa  588  1e-167  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00040081  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0433  heavy metal translocating P-type ATPase  49.51 
 
 
786 aa  579  1e-164  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0512  heavy metal translocating P-type ATPase  47.78 
 
 
785 aa  565  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0508  cation-transporting ATPase, P-type  48.9 
 
 
788 aa  557  1e-157  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0652  heavy metal-transporting ATPase  49.07 
 
 
788 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000329605 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0634  heavy metal-transporting ATPase  49.07 
 
 
788 aa  557  1e-157  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.373732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0506  cation-transporting ATPase, P-type  48.73 
 
 
788 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.907696  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1276  heavy metal translocating P-type ATPase  48.85 
 
 
786 aa  552  1e-156  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.248068  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4704  heavy metal-transporting ATPase  48.9 
 
 
788 aa  555  1e-156  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0990671 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0927  heavy metal translocating P-type ATPase  47.97 
 
 
800 aa  549  1e-155  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.28162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0770  heavy metal translocating P-type ATPase  43.2 
 
 
699 aa  548  1e-154  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0510  cadmium-translocating P-type ATPase  46.02 
 
 
784 aa  544  1e-153  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0663  heavy metal-transporting ATPase  48.39 
 
 
788 aa  539  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2203  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  50 
 
 
700 aa  541  9.999999999999999e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.588592 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0244  heavy metal translocating P-type ATPase  45.95 
 
 
707 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.787519  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0723  heavy metal-transporting ATPase  48.39 
 
 
788 aa  541  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1162  heavy metal translocating P-type ATPase  46.28 
 
 
658 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0564  heavy metal-transporting ATPase  48.22 
 
 
788 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0595  heavy metal-transporting ATPase  48.22 
 
 
788 aa  536  1e-151  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0121  heavy metal translocating P-type ATPase  45.69 
 
 
616 aa  525  1e-148  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000385765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2587  cadmium-translocating P-type ATPase  43.53 
 
 
738 aa  526  1e-148  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20930  heavy metal translocating P-type ATPase  43.12 
 
 
745 aa  523  1e-147  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000162182  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1265  heavy metal translocating P-type ATPase  43.93 
 
 
696 aa  524  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.247851  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0801  heavy metal translocating P-type ATPase  47.25 
 
 
682 aa  520  1e-146  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2289  zinc-transporting atpase  44.69 
 
 
738 aa  513  1e-144  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.362912  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0336  heavy metal translocating P-type ATPase  45.72 
 
 
690 aa  514  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0234  cadmium-translocating P-type ATPase  47.01 
 
 
618 aa  510  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00321637  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0421  heavy metal translocating P-type ATPase  46.68 
 
 
721 aa  501  1e-140  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.403796  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1231  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 
696 aa  496  1e-139  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1742  cadmium-translocating P-type ATPase  47 
 
 
773 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.106711  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2462  heavy metal translocating P-type ATPase  43.23 
 
 
724 aa  489  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1065  hypothetical protein  44.54 
 
 
626 aa  478  1e-133  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.770799  normal  0.783776 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13740  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  42.49 
 
 
638 aa  462  1e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2261  heavy metal translocating P-type ATPase  42.98 
 
 
658 aa  462  9.999999999999999e-129  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1384  cadmium-translocating P-type ATPase  41.91 
 
 
643 aa  456  1e-127  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0290  heavy metal translocating P-type ATPase  40.92 
 
 
631 aa  458  1e-127  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000372175  normal  0.539461 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05940  heavy metal-translocating P-type ATPase, Cd/Co/Hg/Pb/Zn-transporting  43.2 
 
 
638 aa  452  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.558589 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1544  heavy metal translocating P-type ATPase  42.52 
 
 
640 aa  450  1e-125  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0567508  normal  0.0780509 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1517  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 
624 aa  443  1e-123  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0910099  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0552  cadmium-translocating P-type ATPase  38.23 
 
 
645 aa  431  1e-119  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0314  heavy metal translocating P-type ATPase  37.05 
 
 
695 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.040905  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1095  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 
641 aa  415  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.0000123465  hitchhiker  0.000000122053 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18520  heavy metal translocating P-type ATPase  40.46 
 
 
712 aa  404  1e-111  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1410  heavy metal translocating P-type ATPase  36.67 
 
 
613 aa  405  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.575689  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5352  heavy metal translocating P-type ATPase  39.55 
 
 
799 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.448816  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1815  heavy metal translocating P-type ATPase  39.06 
 
 
800 aa  397  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2204  heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
833 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.149675  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5284  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
800 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.225774  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1643  heavy metal translocating P-type ATPase  38.66 
 
 
800 aa  391  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.960315  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0549  heavy metal translocating P-type ATPase  35.45 
 
 
712 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1548  heavy metal translocating P-type ATPase  37.09 
 
 
707 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1448  cadmium-translocating P-type ATPase  37.94 
 
 
748 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1138  heavy metal translocating P-type ATPase  35.62 
 
 
712 aa  388  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1244  heavy metal translocating P-type ATPase  35.07 
 
 
784 aa  388  1e-106  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1718  heavy metal translocating P-type ATPase  34.5 
 
 
712 aa  387  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5139  heavy metal translocating P-type ATPase  37.28 
 
 
750 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.921896  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5192  heavy metal translocating P-type ATPase  38.41 
 
 
750 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0326  heavy metal translocating P-type ATPase  39.04 
 
 
750 aa  385  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.451186  normal  0.576346 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16660  putative metal-transporting P-type ATPase  39.09 
 
 
742 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5012  heavy metal translocating P-type ATPase  36.95 
 
 
750 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.530784  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4225  heavy metal translocating P-type ATPase  36.98 
 
 
734 aa  384  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5279  cadmium-translocating P-type ATPase  38.15 
 
 
752 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2103  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
800 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2631  ATPase, E1-E2 type:heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  36.16 
 
 
739 aa  380  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.873232 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2810  heavy metal translocating P-type ATPase  39.89 
 
 
800 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3773  heavy metal translocating P-type ATPase  36.49 
 
 
737 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.364819  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0026  heavy metal translocating P-type ATPase  37.77 
 
 
701 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260901  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2390  heavy metal translocating P-type ATPase  38.76 
 
 
800 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0451824  normal  0.128679 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2976  cadmium-translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
713 aa  376  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3304  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  39.58 
 
 
866 aa  378  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3290  cadmium-translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
830 aa  377  1e-103  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1563  cadmium-translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
832 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3462  heavy metal translocating P-type ATPase  39.43 
 
 
801 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4019  cadmium-translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
832 aa  377  1e-103  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3038  cadmium-translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
834 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  39.47 
 
 
856 aa  378  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3333  cadmium-translocating P-type ATPase  38.7 
 
 
834 aa  377  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4001  heavy metal translocating P-type ATPase  37.7 
 
 
745 aa  379  1e-103  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.703594  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1257  cation transporter E1-E2 family ATPase  34.88 
 
 
709 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3390  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
984 aa  374  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0773629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0150  cadmium-translocating P-type ATPase  38.53 
 
 
713 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2303  heavy metal translocating P-type ATPase  37.99 
 
 
984 aa  374  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0230591  hitchhiker  0.00032078 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3946  cadmium-translocating P-type ATPase  38.39 
 
 
828 aa  375  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2147  cadmium-translocating P-type ATPase  35.66 
 
 
713 aa  371  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5371  heavy metal-(Cd/Co/Hg/Pb/Zn)-translocating P-type ATPase  35.49 
 
 
769 aa  372  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2931  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
846 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1527  heavy metal translocating P-type ATPase  37 
 
 
783 aa  371  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00585098  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0114  heavy metal translocating P-type ATPase  39.34 
 
 
704 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0124  heavy metal translocating P-type ATPase  38.88 
 
 
846 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.772511  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0138  heavy metal translocating P-type ATPase  38.35 
 
 
848 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4451  heavy metal translocating P-type ATPase  36.05 
 
 
673 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>