More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1147 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1147  glycosyl transferase family 2  100 
 
 
338 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.466774  hitchhiker  0.00852999 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2011  glycosyl transferase family 2  64.26 
 
 
335 aa  455  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.814426  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1791  b-glycosyltransferase  57.99 
 
 
344 aa  375  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.780002 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3180  glycosyl transferase family 2  56.01 
 
 
322 aa  355  7.999999999999999e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.816568  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0354  glycosyl transferase family 2  44.03 
 
 
331 aa  256  4e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3463  glycosyl transferase family protein  44.79 
 
 
332 aa  251  1e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0230104  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1880  glycosyl transferase, group 2 family protein  44.65 
 
 
336 aa  239  4e-62  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09478  putative glycosyltransferase  44.29 
 
 
309 aa  216  5e-55  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.544273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2255  glycosyl transferase family 2  29.73 
 
 
305 aa  102  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4204  glycosyl transferase family 2  30.21 
 
 
305 aa  99.4  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5106  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  40.71 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.94 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  28.7 
 
 
373 aa  84  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.05 
 
 
326 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  38.05 
 
 
326 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4050  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.46 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4126  glycosyl transferase, group 2 family protein  40.46 
 
 
327 aa  82.4  0.000000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.521987  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03480  putative beta1,3-glucosyltransferase  40.46 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.307597  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03431  hypothetical protein  40.46 
 
 
327 aa  82.4  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.1979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3927  glycosyl transferase family 2  42.34 
 
 
291 aa  82  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0129456 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3960  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.69 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0389703  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4271  glycosyl transferase family 2  24.01 
 
 
528 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3834  glycosyl transferase, group 2 family protein  39.69 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000153474  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0086  glycosyl transferase family protein  39.69 
 
 
327 aa  81.6  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0142969  normal  0.0610644 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0519  glycosyl transferase family 2  28.16 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1818  glycosyl transferase family protein  26.07 
 
 
335 aa  80.9  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  26.47 
 
 
1177 aa  80.5  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3546  glycosyl transferase family protein  24.69 
 
 
924 aa  79  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2017  glycosyl transferase family 2  36.21 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000864394 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2374  glycosyl transferase family 2  29.29 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1878  glycosyl transferase family 2  28.09 
 
 
597 aa  77  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1961  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.61 
 
 
295 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.76952  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.11 
 
 
352 aa  75.9  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1422  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.62 
 
 
341 aa  74.7  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1429  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.82 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0341  glycosyl transferase family 2  24.67 
 
 
428 aa  74.3  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0957  ss-1,4-galactosyltransferase  36.84 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.655191  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.22 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  36.04 
 
 
697 aa  74.7  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  28.39 
 
 
322 aa  74.3  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1920  glucosaminyltransferase  23.93 
 
 
403 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.807733 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1727  glycosyl transferase family 2  40 
 
 
689 aa  73.9  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.158076 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  29.87 
 
 
326 aa  74.3  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  25.63 
 
 
324 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0136  glycosyl transferase family 2  39.58 
 
 
746 aa  73.9  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000940813  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3553  glycosyl transferase family protein  26.3 
 
 
477 aa  73.9  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  39.62 
 
 
398 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0844  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.59 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0746386  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1552  glycosyl transferase family 2  27.56 
 
 
299 aa  73.6  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1813  glycosyl transferase family 2  41.58 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.37725  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1675  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
415 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  37.27 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3110  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
325 aa  72.8  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.36 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00155  putative fucosyl transferase  35 
 
 
311 aa  72  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.749849  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0745  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosphotransferase  41.18 
 
 
1169 aa  72  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2081  glycosyl transferase  29.02 
 
 
316 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.797991  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4093  glycosyl transferase family 2  29.02 
 
 
296 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.206516  normal  0.102605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3111  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3065  glycosyl transferase family protein  34.38 
 
 
289 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.807338  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3171  glycosyl transferase family protein  25.18 
 
 
297 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.675731  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0058  glycosyl transferase family 2  29.39 
 
 
337 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.246717 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1781  glycosyl transferase family 2  25.11 
 
 
326 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.456914  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1645  glycosyl transferase family 2  28.15 
 
 
253 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0133  glycosyl transferase family 2  41.3 
 
 
581 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000274352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1571  glycosyl transferase family 2  36.36 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  1.79772e-16 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4073  glycosyl transferase family protein  28.4 
 
 
334 aa  70.9  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.162964  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1959  glycosyl transferase family 2  25.65 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07280  glycosyl transferase  38.78 
 
 
272 aa  70.9  0.00000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.131156  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  41.05 
 
 
1168 aa  70.9  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3355  glycosyl transferase family 2  27.54 
 
 
233 aa  70.9  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1888  glycosyl transferase family protein  34.34 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.826317  normal  0.852765 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  35.71 
 
 
302 aa  70.5  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  36.19 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1131  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  23.68 
 
 
337 aa  70.1  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0715  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.95 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.887983  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2856  glycosyl transferase family protein  34 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0808  glycosyl transferase family 2  32.46 
 
 
334 aa  70.1  0.00000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227461  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0136  glycosyl transferase family protein  24.21 
 
 
311 aa  70.1  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0443669  normal  0.762685 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  34.69 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1364  glycosyl transferase family protein  39.36 
 
 
348 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000343006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  35.9 
 
 
1157 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30120  Glycosyl transferase, family 2 protein  33.91 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  36.84 
 
 
302 aa  69.3  0.00000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1465  cell wall membrane glycosyltransferase  41.35 
 
 
391 aa  69.3  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0706  glycosyl transferase group 2 family protein  28.95 
 
 
334 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.912597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  28.44 
 
 
305 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0982  glucosaminyltransferase  23 
 
 
461 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0669944  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2746  glycosyl transferase family 2  28.89 
 
 
260 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0945  glycosyl transferase family 2  26.34 
 
 
358 aa  68.2  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.761656  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  41.84 
 
 
321 aa  68.6  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0301  glycosyltransferase  34.82 
 
 
309 aa  68.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.4815  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  37.89 
 
 
785 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  35.92 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1956  glycosyl transferase family 2  23.74 
 
 
310 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.179656  normal  0.45422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4771  glycosyl transferase family protein  36.08 
 
 
1035 aa  68.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1428  glycosyltransferase-like protein  29.38 
 
 
323 aa  68.2  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.221347  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1662  glycosyl transferase family protein  22.29 
 
 
345 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.363785  hitchhiker  0.00433752 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3495  glycosyl transferase family 2  42.71 
 
 
276 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>