More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1138 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1138  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 
357 aa  738    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.655902  normal  0.0194678 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1795  histidinol-phosphate aminotransferase  67.82 
 
 
374 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1269  histidinol phosphate aminotransferase  57.64 
 
 
348 aa  428  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.346305 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1819  histidinol-phosphate aminotransferase  56.81 
 
 
351 aa  410  1e-113  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3193  histidinol-phosphate aminotransferase  52.12 
 
 
355 aa  389  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.969039  normal  0.361127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2876  histidinol-phosphate aminotransferase  48.29 
 
 
349 aa  351  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.489058  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09006  histidinol-phosphate aminotransferase  47.71 
 
 
351 aa  342  8e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38891  predicted protein  40.79 
 
 
373 aa  277  2e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.319117  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_44612  histidinol-phosphate aminotransferase  40.1 
 
 
401 aa  261  8.999999999999999e-69  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.331379  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_006684  CNB03030  histidinol-phosphate transaminase, putative  41.15 
 
 
410 aa  257  3e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252075  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01116  histidinol-phosphate aminotransferase  37.78 
 
 
359 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1743  histidinol-phosphate aminotransferase  36.65 
 
 
357 aa  247  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0624479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2331  histidinol-phosphate aminotransferase  38.48 
 
 
356 aa  244  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0618101  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2882  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
371 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00717  Histidinol-phosphate aminotransferase (Eurofung)  37.32 
 
 
447 aa  243  3e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2010  histidinol-phosphate aminotransferase  36.65 
 
 
357 aa  243  5e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.450874  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2229  histidinol-phosphate aminotransferase  38.55 
 
 
356 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.125889  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2527  histidinol-phosphate aminotransferase  37.01 
 
 
382 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2430  histidinol-phosphate aminotransferase  37.01 
 
 
382 aa  239  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3171  histidinol-phosphate aminotransferase  36.72 
 
 
382 aa  238  9e-62  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.777037 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1211  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
356 aa  235  7e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1614  histidinol-phosphate aminotransferase  36.9 
 
 
362 aa  235  7e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.216179 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1636  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
356 aa  235  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.258033  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2954  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
356 aa  235  8e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000139891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1351  histidinol-phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1418  histidinol-phosphate aminotransferase  37.68 
 
 
365 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.537835  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2633  histidinol-phosphate aminotransferase  37.29 
 
 
353 aa  233  3e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.063608  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1039  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.191971 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1621  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
356 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.796299 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2411  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
359 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.989603  hitchhiker  0.000518388 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2312  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
356 aa  233  5e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2160  histidinol-phosphate aminotransferase  35.69 
 
 
356 aa  233  5e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2198  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
359 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2301  histidinol-phosphate aminotransferase  37.08 
 
 
359 aa  232  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106884  normal  0.0656474 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01923  histidinol-phosphate aminotransferase  35.41 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01909  hypothetical protein  35.41 
 
 
356 aa  232  8.000000000000001e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2299  histidinol-phosphate aminotransferase  36.8 
 
 
359 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0250644  normal  0.0715726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2252  histidinol-phosphate aminotransferase  36.8 
 
 
359 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.124333 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1758  histidinol-phosphate aminotransferase  36.42 
 
 
364 aa  226  3e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351829  normal  0.0305206 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0704  histidinol-phosphate aminotransferase  37.22 
 
 
346 aa  225  1e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00834  histidinol-phosphate aminotransferase  36.18 
 
 
354 aa  224  2e-57  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000149734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01832  histidinol-phosphate aminotransferase  37.82 
 
 
346 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0403  histidinol-phosphate aminotransferase  38.68 
 
 
360 aa  218  2e-55  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.752723  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2543  histidinol-phosphate aminotransferase  35.94 
 
 
356 aa  216  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.562111  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003847  histidinol-phosphate aminotransferase  37.25 
 
 
346 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1135  histidinol-phosphate aminotransferase  38.33 
 
 
346 aa  215  7e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1626  histidinol-phosphate aminotransferase  36.94 
 
 
355 aa  211  2e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1655  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
356 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.2243  normal  0.955793 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1616  histidinol-phosphate aminotransferase  35.98 
 
 
352 aa  208  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  38.53 
 
 
351 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2458  histidinol-phosphate aminotransferase  35.92 
 
 
351 aa  204  1e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1718  histidinol-phosphate aminotransferase  34.01 
 
 
349 aa  202  8e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1200  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  36.76 
 
 
364 aa  201  9.999999999999999e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1206  histidinol-phosphate aminotransferase (imidazole acetol-phosphate transaminase)  36.45 
 
 
364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2199  histidinol-phosphate aminotransferase  33.62 
 
 
360 aa  199  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0306111 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  35.25 
 
 
370 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2420  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
399 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  35.28 
 
 
371 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2538  histidinol-phosphate aminotransferase  32.67 
 
 
386 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0259653 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1931  histidinol-phosphate aminotransferase  32.31 
 
 
399 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.5021  normal  0.393324 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2090  histidinol-phosphate aminotransferase  35.07 
 
 
348 aa  194  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2427  histidinol-phosphate aminotransferase  32.39 
 
 
399 aa  193  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0753  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 
357 aa  193  5e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1798  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 
396 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3247  histidinol-phosphate aminotransferase  34.35 
 
 
366 aa  192  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2179  histidinol-phosphate aminotransferase  32.76 
 
 
406 aa  192  8e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1493  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 
360 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0712  histidinol-phosphate aminotransferase  32.66 
 
 
344 aa  191  2e-47  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000819741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1086  histidinol-phosphate aminotransferase  34.07 
 
 
363 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.742726  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1023  histidinol-phosphate aminotransferase  36.44 
 
 
368 aa  189  7e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1852  histidinol-phosphate aminotransferase  33.24 
 
 
401 aa  189  7e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.506177  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_747  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 
358 aa  186  4e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000600675  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2072  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 
391 aa  186  6e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3891  histidinol-phosphate aminotransferase  32.12 
 
 
368 aa  185  9e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.10299  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0399  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
356 aa  184  3e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2180  histidinol-phosphate aminotransferase  32 
 
 
373 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0383  histidinol-phosphate aminotransferase  33.15 
 
 
358 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0843  histidinol-phosphate aminotransferase  33.61 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1080  histidinol-phosphate aminotransferase  32.47 
 
 
363 aa  181  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.463173  hitchhiker  0.0000000000154847 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  34.32 
 
 
370 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3110  histidinol-phosphate aminotransferase  35.31 
 
 
366 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.155015  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2758  histidinol-phosphate aminotransferase  33.71 
 
 
356 aa  180  4e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1382  histidinol-phosphate aminotransferase  30.62 
 
 
357 aa  179  4.999999999999999e-44  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3559  histidinol-phosphate aminotransferase  33.43 
 
 
356 aa  179  8e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000559348 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2587  histidinol-phosphate aminotransferase  36.61 
 
 
369 aa  178  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000154742 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3240  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3692  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2777  histidinol-phosphate aminotransferase  33.8 
 
 
360 aa  177  3e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2764  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2713  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3723  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.158561  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1789  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  177  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3665  histidinol-phosphate aminotransferase  34.48 
 
 
356 aa  176  5e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802766  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1156  histidinol-phosphate aminotransferase  34.25 
 
 
355 aa  176  6e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2992  histidinol-phosphate aminotransferase  34.2 
 
 
356 aa  176  7e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0824  histidinol-phosphate aminotransferase  35.05 
 
 
383 aa  176  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0205035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  34.08 
 
 
362 aa  175  9e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0762  aminotransferase  35.01 
 
 
358 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4535  histidinol-phosphate aminotransferase  34.18 
 
 
364 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1453  histidinol phosphate aminotransferase  29.59 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0142373  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>