More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1048 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_1048  FolC bifunctional protein  100 
 
 
433 aa  895  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252372 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1166  FolC bifunctional protein  51.97 
 
 
428 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3070  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
428 aa  442  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1996  FolC bifunctional protein  52.53 
 
 
428 aa  434  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0734572  normal  0.0222652 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1979  FolC bifunctional protein  49.77 
 
 
404 aa  423  1e-117  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0461  FolC bifunctional protein  47.8 
 
 
408 aa  398  1e-110  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1542  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase (folylpolyglutamate synthetase)  45.69 
 
 
429 aa  390  1e-107  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0207441  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0463  folylpolyglutamate synthase  47.1 
 
 
429 aa  383  1e-105  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06680  putative folylpolyglutamate synthase  44.42 
 
 
404 aa  376  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0738  folylpolyglutamate synthetase; dihydrofolate synthetase  36.67 
 
 
422 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00754435  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2308  FolC bifunctional protein  36.89 
 
 
442 aa  243  6e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  9.1683e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3277  FolC bifunctional protein  37.24 
 
 
424 aa  238  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2475  folylpolyglutamate synthetase  37.24 
 
 
424 aa  232  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1490  FolC bifunctional protein  34.32 
 
 
432 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1671  FolC bifunctional protein  36.57 
 
 
431 aa  230  3e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.239696  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3345  FolC bifunctional protein  36.61 
 
 
429 aa  229  6e-59  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.63219  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2209  FolC bifunctional protein  35.89 
 
 
429 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.791737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1885  FolC bifunctional protein  33.94 
 
 
441 aa  227  4e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3348  FolC bifunctional protein  35.5 
 
 
424 aa  227  4e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2174  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
441 aa  226  5e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0758  FolC bifunctional protein  35.76 
 
 
443 aa  224  2e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0602  dihydropteroate synthase  36.36 
 
 
813 aa  222  1e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0390  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
422 aa  221  3e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  5.76883e-07  normal  0.0116756 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4541  FolC bifunctional protein  35.96 
 
 
453 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.195738  normal  0.774158 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1510  FolC bifunctional protein  33.96 
 
 
413 aa  218  1e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1041  FolC bifunctional protein  33.78 
 
 
451 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0467  FolC bifunctional protein  37.67 
 
 
434 aa  218  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  3.74021e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0426  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
422 aa  217  3e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.776712  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14370  Folylpolyglutamate synthase  32.79 
 
 
457 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.37038e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0603  FolC bifunctional protein  32.2 
 
 
435 aa  215  1e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4590  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.96 
 
 
433 aa  215  1e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4360  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
459 aa  215  1e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0015  FolC bifunctional protein  36.71 
 
 
438 aa  215  1e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.124008  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0897  FolC bifunctional protein  35.5 
 
 
424 aa  215  1e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.54283e-31 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4548  folylpolyglutamate synthase  32.23 
 
 
433 aa  214  2e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2572  FolC bifunctional protein  33.18 
 
 
431 aa  214  2e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3147  FolC bifunctional protein  35.54 
 
 
817 aa  213  5e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0120997  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2764  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 
424 aa  213  6e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3284  dihydropteroate synthase  35.59 
 
 
847 aa  213  6e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4544  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  33.19 
 
 
433 aa  212  8e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4689  folylpolyglutamate synthase  33.19 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4354  folylpolyglutamate synthase  33.19 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4190  folylpolyglutamate synthase  33.19 
 
 
433 aa  212  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1160  FolC bifunctional protein  33.26 
 
 
425 aa  212  1e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1447  FolC bifunctional protein  35.35 
 
 
424 aa  211  3e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0119  FolC bifunctional protein  34.93 
 
 
447 aa  210  3e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.205687 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0880  FolC bifunctional protein  35.73 
 
 
431 aa  210  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4201  folylpolyglutamate synthase  33.26 
 
 
433 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_15  folylpolyglutamate synthetase  36.93 
 
 
437 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07720  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  35.08 
 
 
427 aa  210  5e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.278263 
 
 
-
 
NC_002936  DET0016  folylpolyglutamate synthetase  36.39 
 
 
439 aa  209  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4302  FolC bifunctional protein  32.06 
 
 
433 aa  208  2e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1757  folylpolyglutamate synthetase  32.88 
 
 
443 aa  208  2e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  5.20472e-07  normal  0.349316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1549  FolC bifunctional protein  35.62 
 
 
422 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2675  FolC bifunctional protein  37.91 
 
 
423 aa  207  4e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0659  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.08 
 
 
433 aa  206  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1384  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 
428 aa  206  8e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0971  FolC bifunctional protein  35.22 
 
 
463 aa  205  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.764071  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0759  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
437 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0782  FolC bifunctional protein  33.71 
 
 
435 aa  205  1e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3173  FolC bifunctional protein  32.74 
 
 
433 aa  204  2e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4575  tetrahydrofolylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  32.52 
 
 
433 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.095656  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2552  FolC bifunctional protein  33.48 
 
 
431 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0970266  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1648  hypothetical protein  36.03 
 
 
416 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1110  FolC bifunctional protein  32.77 
 
 
465 aa  203  4e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.94602 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01530  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.56 
 
 
466 aa  203  4e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0193239 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0458  folylpolyglutamate synthetase  34.71 
 
 
428 aa  201  2e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0322  FolC bifunctional protein  34.06 
 
 
411 aa  200  3e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.439015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0533  FolC bifunctional protein  34.69 
 
 
440 aa  200  4e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.861672 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1883  FolC bifunctional protein  35.83 
 
 
407 aa  200  5e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0423  FolC bifunctional protein  32.07 
 
 
436 aa  199  6e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.395258  normal  0.0242986 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0087  FolC bifunctional protein  34.22 
 
 
454 aa  199  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0279686 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1236  FolC bifunctional protein  36.11 
 
 
428 aa  199  7e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3525  FolC bifunctional protein  34.35 
 
 
440 aa  199  8e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2353  FolC bifunctional protein  37.67 
 
 
430 aa  197  3e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.167549  normal  0.0264715 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0295  FolC bifunctional protein  35.1 
 
 
426 aa  197  4e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1456  FolC bifunctional protein  36.5 
 
 
461 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.363059  normal  0.651546 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0510  FolC bifunctional protein  34.7 
 
 
437 aa  194  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23910  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  34.26 
 
 
466 aa  194  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.290984  normal  0.331564 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0325  dihydropteroate synthase  35.09 
 
 
878 aa  193  4e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.899871  normal  0.0161218 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3497  FolC bifunctional protein  36.04 
 
 
526 aa  193  5e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2780  FolC bifunctional protein  39.08 
 
 
437 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.38262  normal  0.709673 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1582  FolC bifunctional protein  36.77 
 
 
447 aa  192  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0325  FolC bifunctional protein  36.49 
 
 
438 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1456  FolC bifunctional protein  36.31 
 
 
438 aa  191  2e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1472  FolC bifunctional protein  35.99 
 
 
425 aa  191  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0335611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4359  FolC bifunctional protein  33.49 
 
 
427 aa  191  3e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.601802  normal  0.624925 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1166  FolC bifunctional protein  35.31 
 
 
452 aa  190  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.343564  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1568  FolC bifunctional protein  32.35 
 
 
432 aa  190  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0544  FolC bifunctional protein  34.58 
 
 
425 aa  189  7e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1149  FolC bifunctional protein  35.75 
 
 
468 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.498576  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0715  folylpolyglutamate synthase  34.45 
 
 
442 aa  189  1e-46  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0351  FolC bifunctional protein  34.55 
 
 
414 aa  188  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.651098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3099  FolC bifunctional protein  33.41 
 
 
438 aa  188  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4713  dihydropteroate synthase  32.13 
 
 
810 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.464706  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0059  FolC bifunctional protein  35.35 
 
 
421 aa  187  3e-46  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.873383  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12370  folylpolyglutamate synthase/dihydrofolate synthase  36.24 
 
 
470 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867028  normal  0.34816 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0391  FolC bifunctional protein  35.14 
 
 
428 aa  186  7e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.455156  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1218  folylpolyglutamate synthase  32.08 
 
 
419 aa  186  9e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.672843  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2554  dihydropteroate synthase  32.6 
 
 
840 aa  186  1e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.324611  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>