More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1017 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  80.14 
 
 		 449 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 431 aa  857    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  62.97 
 
 		 432 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  61.88 
 
 		 430 aa  548  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  62.85 
 
 		 431 aa  547  1e-154  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  60.85 
 
 		 439 aa  533  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  60.76 
 
 		 426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  57.21 
 
 		 436 aa  508  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  58.61 
 
 		 454 aa  506  9.999999999999999e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  48.93 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  50.71 
 
 		 453 aa  415  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  50.12 
 
 		 424 aa  391  1e-107  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 430 aa  380  1e-104  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  46.53 
 
 		 433 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  44.92 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  45.39 
 
 		 429 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  44.21 
 
 		 430 aa  366  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  43.97 
 
 		 430 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  45.56 
 
 		 427 aa  364  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  44.13 
 
 		 429 aa  364  2e-99  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  43.82 
 
 		 468 aa  363  3e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  43.4 
 
 		 430 aa  358  9e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  43.43 
 
 		 429 aa  328  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  41.33 
 
 		 480 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  41.33 
 
 		 441 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  41.07 
 
 		 449 aa  318  1e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  41.09 
 
 		 441 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  39.25 
 
 		 441 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  39.48 
 
 		 445 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  41.13 
 
 		 439 aa  309  5e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  39.03 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  39.76 
 
 		 439 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  40.14 
 
 		 442 aa  303  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  38 
 
 		 442 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  41.02 
 
 		 457 aa  296  4e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  41.22 
 
 		 435 aa  296  6e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  39.67 
 
 		 432 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  38.77 
 
 		 441 aa  288  2e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  39.48 
 
 		 441 aa  282  7.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  37.8 
 
 		 489 aa  276  4e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  40.32 
 
 		 428 aa  275  8e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  36.17 
 
 		 479 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  37.88 
 
 		 501 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  37.2 
 
 		 424 aa  256  4e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  35 
 
 		 411 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  33.89 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  40.21 
 
 		 425 aa  242  9e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.73 
 
 		 435 aa  239  8e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  37.2 
 
 		 434 aa  239  9e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  34.38 
 
 		 409 aa  238  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  33.85 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  33.85 
 
 		 425 aa  234  3e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  34.28 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  33.95 
 
 		 430 aa  229  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.68 
 
 		 432 aa  229  8e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  33.72 
 
 		 430 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  34.37 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  34.37 
 
 		 433 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  34.37 
 
 		 434 aa  223  4e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  33.33 
 
 		 433 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  33.09 
 
 		 429 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  32.87 
 
 		 474 aa  221  3e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  33.07 
 
 		 433 aa  219  1e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  31.55 
 
 		 432 aa  218  2e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  32.63 
 
 		 435 aa  218  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  31.55 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  31.55 
 
 		 432 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  31.55 
 
 		 472 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  34.02 
 
 		 432 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  34.63 
 
 		 440 aa  216  9e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  33.07 
 
 		 433 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  34.36 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  34.56 
 
 		 432 aa  212  1e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 411 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  30.56 
 
 		 434 aa  211  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  33.33 
 
 		 434 aa  210  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  33.08 
 
 		 434 aa  209  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  33.49 
 
 		 443 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  31.79 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  31.79 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  31.79 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  31.79 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  31.79 
 
 		 432 aa  206  5e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  32.07 
 
 		 424 aa  206  6e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  32.39 
 
 		 433 aa  205  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  33 
 
 		 430 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  33.41 
 
 		 423 aa  204  3e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  32.62 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  33.65 
 
 		 423 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5219  MFS transporter, phthalate permease family  35.1 
 
 		 436 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5154  major facilitator transporter  30.81 
 
 		 428 aa  200  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.379393  normal  0.385289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3060  major facilitator transporter  32.38 
 
 		 436 aa  199  7e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.135918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5058  major facilitator superfamily MFS_1  33.59 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.796866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>