86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_1015 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_1015  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  100 
 
 		 335 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3954  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  50.76 
 
 		 334 aa  352  7e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.940601 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0939  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.67 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.340074  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0881  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.67 
 
 		 309 aa  129  9.000000000000001e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1422  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  33.99 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3690  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  33.33 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0845  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  30.13 
 
 		 305 aa  116  5e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.492192  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.25 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.313039  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0135  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.25 
 
 		 341 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0150281  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6031  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.04 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0444196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0586  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.84 
 
 		 341 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0942826  normal  0.0399726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0519  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.82 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0543  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.82 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.436571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3700  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.13 
 
 		 341 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148027  normal  0.619285 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2068  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  30.49 
 
 		 309 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.195031 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0502  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.67 
 
 		 304 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3914  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  31.84 
 
 		 284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0112503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0392  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.21 
 
 		 328 aa  110  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.402341 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0962  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.65 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0937  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  36.65 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00123  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  32.78 
 
 		 292 aa  109  7.000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117441  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2767  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.09 
 
 		 341 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.922315 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0543  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  29.65 
 
 		 354 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2872  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.55 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.578568 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2598  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.15 
 
 		 296 aa  108  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0743  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.37 
 
 		 299 aa  107  2e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2618  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.55 
 
 		 346 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3665  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.09 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000857364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0038  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  32.1 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1269  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.66 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0409  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.66 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.970472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3488  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.66 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.66 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3296  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.66 
 
 		 337 aa  106  7e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1176  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.85 
 
 		 337 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03672  hypothetical protein  30.57 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03723  putative conserved protein  30.57 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4213  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.57 
 
 		 334 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226475 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0545  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  29.14 
 
 		 305 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51340  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.38 
 
 		 322 aa  103  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.266057  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3451  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.37 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.531643  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1371  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.37 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4929  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.94 
 
 		 304 aa  103  5e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.876987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3489  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.37 
 
 		 337 aa  103  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0437  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  30.1 
 
 		 306 aa  102  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.282001 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0023  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  28.66 
 
 		 298 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2605  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  31.61 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3534  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  30.26 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.254637 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4620  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.48 
 
 		 295 aa  100  4e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0235772 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3594  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.74 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.943632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2012  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  27.01 
 
 		 319 aa  99.8  6e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.975056  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.24 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0009  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.24 
 
 		 292 aa  99.4  8e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03577  2-oxo-3-deoxygalactonate kinase  35.24 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03521  hypothetical protein  35.24 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.225897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3906  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.24 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4804  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.09 
 
 		 293 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0138053  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0054  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.47 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4203  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.4 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1097  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  35.4 
 
 		 292 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1242  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  30.16 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.502361  normal  0.183094 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3489  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  27.24 
 
 		 304 aa  96.3  6e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.770772 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3414  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  28.45 
 
 		 350 aa  95.9  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302272  normal  0.341449 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4059  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  34.51 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4163  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.75 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.824257 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0028  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.5 
 
 		 307 aa  95.1  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4125  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  32.07 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.505866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4221  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.44 
 
 		 292 aa  92.8  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4114  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  31.88 
 
 		 292 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6942  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  28.65 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000967621  normal  0.967512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0007  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  28.66 
 
 		 292 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0042  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.16 
 
 		 297 aa  91.3  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.351596 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3530  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  26.49 
 
 		 318 aa  90.9  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2177  2-dehydro-3-deoxygalactonate kinase  27.69 
 
 		 334 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.075101  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0949  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.03 
 
 		 351 aa  87.4  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0898  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.01 
 
 		 353 aa  87.4  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1987  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  27.76 
 
 		 334 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.021694 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3833  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  28.2 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.516302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2246  2-keto-3-deoxygalactonate kinase  29.84 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.279182  hitchhiker  0.00000435705 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2998  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  28.24 
 
 		 337 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.296432  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2759  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  31.33 
 
 		 331 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.245127  normal  0.540885 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2748  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  29.73 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1287  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase  32.16 
 
 		 316 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0108847 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2588  2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  28.71 
 
 		 337 aa  75.9  0.0000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3614  2-keto-3-deoxy-galactonokinase  31.08 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3778  putative 2-dehydro-3-deoxygalactonokinase protein  27.7 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.585219 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>