More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0997 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_0583  sulfatase  68.7 
 
 
522 aa  736    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0997  sulfatase  100 
 
 
517 aa  1071    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.224171  normal  0.0910854 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3390  sulfatase  53.89 
 
 
513 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0663726  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2015  sulfatase  49.3 
 
 
497 aa  489  1e-137  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.295257  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1655  sulfatase  46.85 
 
 
554 aa  462  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.789399  normal  0.0842498 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1755  sulfatase  48.12 
 
 
562 aa  447  1.0000000000000001e-124  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1520  sulfatase  34.13 
 
 
631 aa  236  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0881  sulfatase  33.21 
 
 
510 aa  226  6e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.789189  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0571  sulfatase  30.55 
 
 
517 aa  226  1e-57  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1881  sulfatase  31.27 
 
 
490 aa  218  2.9999999999999998e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2379  sulfatase  30.84 
 
 
470 aa  216  5.9999999999999996e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3650  sulfatase  31.04 
 
 
482 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127194  decreased coverage  0.00847064 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3654  sulfatase  31.55 
 
 
489 aa  209  8e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0466355 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2364  sulfatase family protein  32.59 
 
 
492 aa  206  1e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.027189  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3985  sulfatase  31.53 
 
 
478 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.135566  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6052  sulfatase  31.29 
 
 
453 aa  194  4e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3659  sulfatase  31.51 
 
 
484 aa  186  7e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000330438  normal  0.826759 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1638  sulfatase  31.24 
 
 
457 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.132093 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2725  sulfatase  31.81 
 
 
724 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0744828  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4240  twin-arginine translocation pathway signal  32.85 
 
 
457 aa  181  2e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.615359  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0889  sulfatase  29.8 
 
 
500 aa  177  4e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00184444  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3949  sulfatase  29.39 
 
 
470 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.184377  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0895  sulfatase  29.91 
 
 
471 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.281969  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6288  sulfatase  27.45 
 
 
523 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.44956 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1879  sulfatase  32.12 
 
 
462 aa  169  9e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0785  sulfatase  28.98 
 
 
472 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.288009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2602  sulfatase  29.44 
 
 
452 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.128586 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3870  sulfatase  27.46 
 
 
578 aa  167  5e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0936  sulfatase  27.94 
 
 
479 aa  167  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2052  sulfatase  26.55 
 
 
543 aa  166  6.9999999999999995e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430392  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2743  sulfatase  26.28 
 
 
581 aa  166  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1449  sulfatase  28.3 
 
 
495 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.499056  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0302  sulfatase  31.69 
 
 
543 aa  164  3e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.139649 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2680  arylsulfatase  26.8 
 
 
584 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.246177  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3296  sulfatase  30.1 
 
 
460 aa  163  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0308085  hitchhiker  0.000582836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3999  sulfatase  28.32 
 
 
467 aa  162  2e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4652  sulfatase  28.7 
 
 
551 aa  161  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2166  sulfatase  28.14 
 
 
497 aa  161  3e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.696706  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3436  sulfatase  30.66 
 
 
462 aa  161  3e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4501  sulfatase  28.19 
 
 
481 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.930305  normal  0.505642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3903  arylsulfatase  28.24 
 
 
563 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313687  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4498  sulfatase  27.2 
 
 
462 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.697848  normal  0.704843 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2657  sulfatase  28.45 
 
 
519 aa  158  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2408  sulfatase  28.98 
 
 
548 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.387467  hitchhiker  0.00012242 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2674  sulfatase  29.04 
 
 
559 aa  158  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2941  sulfatase  27.2 
 
 
480 aa  157  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.515365 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3662  sulfatase  28.78 
 
 
637 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.33998  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1213  sulfatase  31.56 
 
 
487 aa  157  6e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.255178  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2738  sulfatase  31.47 
 
 
466 aa  156  8e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.846304  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1327  sulfatase  27.29 
 
 
480 aa  155  1e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.499609  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6289  sulfatase  26.74 
 
 
486 aa  156  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.235101 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0039  sulfatase  26.43 
 
 
497 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.225946 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0038  sulfatase  26.43 
 
 
497 aa  155  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.292867  hitchhiker  0.00560398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1516  sulfatase  28.17 
 
 
553 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.943825  normal  0.893122 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0360  Steryl-sulfatase  30.35 
 
 
553 aa  155  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0040  sulfatase  26.43 
 
 
497 aa  155  2e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.843312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0345  sulfatase  27.71 
 
 
474 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00158762  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0040  sulfatase  26.43 
 
 
497 aa  154  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.872346  normal  0.13967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0263  arylsulfatase  28.02 
 
 
536 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4692  sulfatase  29.38 
 
 
491 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.66699 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3990  sulfatase  26.43 
 
 
582 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1182  sulfatase  27.69 
 
 
465 aa  150  4e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02310  arylsulfatase  27.89 
 
 
536 aa  150  8e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0038  sulfatase  26.25 
 
 
497 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1986  sulfatase  26.54 
 
 
555 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.737695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2624  arylsulfatase  26.02 
 
 
541 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.344429  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3651  sulfatase  28.71 
 
 
483 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000643806  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2981  sulfatase  27.08 
 
 
766 aa  149  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0740  sulfatase  27.22 
 
 
440 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0208  sulfatase  27.97 
 
 
536 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2065  sulfatase  25.81 
 
 
542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0577602 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4650  sulfatase  27.68 
 
 
539 aa  147  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2850  sulfatase  25.59 
 
 
563 aa  146  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00796001  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1131  sulfatase  28.22 
 
 
551 aa  145  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1353  n-acetylgalactosamine-6-sulfate sulfatase  27.8 
 
 
471 aa  145  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0725989  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0474  sulfatase  30.16 
 
 
491 aa  144  5e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3373  sulfatase  27.72 
 
 
481 aa  143  6e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0426  sulfatase  26.22 
 
 
772 aa  143  6e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.452033  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1776  sulfatase  25.79 
 
 
520 aa  143  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.791288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5404  sulfatase  28.03 
 
 
457 aa  143  8e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.268396  normal  0.742595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0015  sulfatase  26.65 
 
 
497 aa  143  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.689426  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0383  sulfatase  26.16 
 
 
563 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1675  sulfatase  27.09 
 
 
539 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1506  sulfatase  24.55 
 
 
501 aa  142  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.265184 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2148  sulfatase  27.09 
 
 
560 aa  141  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.541761  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01456  hypothetical protein  26.91 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01469  hypothetical protein  26.91 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2159  sulfatase  26.91 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1583  sulfatase  26.91 
 
 
560 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.096723  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3661  sulfatase  27.64 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0317755  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3577  sulfatase  29.16 
 
 
438 aa  140  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.176651  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3375  sulfatase  24.39 
 
 
571 aa  140  7e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.590124 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06847  arylsulfatase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G12940)  25.75 
 
 
616 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.246594  normal  0.336427 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3352  arylsulfatase, putative  27.73 
 
 
554 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.386484  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1497  sulfatase  26.8 
 
 
536 aa  139  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.139846  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3852  sulfatase  27.27 
 
 
468 aa  139  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2294  sulfatase  28.42 
 
 
442 aa  137  4e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.434198  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0565  sulfatase  26.38 
 
 
542 aa  137  4e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.776698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3374  sulfatase  26.44 
 
 
507 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4996  sulfatase  28.05 
 
 
506 aa  136  9e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.317023 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>