176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0985 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0594  hypothetical protein  57.42 
 
 		 1053 aa  1231    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5296  hypothetical protein  54.85 
 
 		 1071 aa  1187    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.774342  normal  0.228264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3450  hypothetical protein  46.31 
 
 		 1068 aa  926    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0554556 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0637  hypothetical protein  53.35 
 
 		 1066 aa  1167    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0627569 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0985  hypothetical protein  100 
 
 		 1052 aa  2150    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  58.81 
 
 		 1067 aa  1311    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2076  hypothetical protein  25 
 
 		 1074 aa  242  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3010  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1129 aa  238  6e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5935  TonB-dependent receptor plug  26.27 
 
 		 1097 aa  236  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.545401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5072  OmpA-related protein  26.92 
 
 		 1125 aa  234  6e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.813038  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0171  hypothetical protein  25.15 
 
 		 1077 aa  225  4e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0330  TonB-dependent outer membrane receptor precursor  26.06 
 
 		 1041 aa  214  1e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000673436  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1306  TonB-dependent receptor plug  24.54 
 
 		 1100 aa  197  9e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.634411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1376  TonB-dependent outer membrane receptor  23.8 
 
 		 1081 aa  187  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00784128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3920  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1071 aa  178  4e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.818859  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01318  TonB-dependent outer membrane Receptor/Oar-like protein  24.21 
 
 		 1056 aa  176  2.9999999999999996e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3841  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1105 aa  174  6.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  30.57 
 
 		 1074 aa  162  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3841  TonB-dependent receptor  26.69 
 
 		 1123 aa  156  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0315  hypothetical protein  27.64 
 
 		 1125 aa  143  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.269975  normal  0.693881 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0143  Oar protein  22.49 
 
 		 1068 aa  134  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0467162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0313  TonB-dependent receptor  25.57 
 
 		 1008 aa  134  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0638  hypothetical protein  23.79 
 
 		 1069 aa  133  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000046909  normal  0.0437117 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00733  putative Outer membrane protein with a TonB box  23.32 
 
 		 1057 aa  133  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.250529  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0663  TonB-dependent receptor  31.54 
 
 		 1176 aa  132  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00550591  normal  0.789281 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0348  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1008 aa  131  7.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0784  hypothetical protein  30.87 
 
 		 1075 aa  129  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.410737  normal  0.275915 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0445  hypothetical protein  31.88 
 
 		 1173 aa  129  4.0000000000000003e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0367904 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00878  TonB-dependent outer membrane receptor  30.93 
 
 		 992 aa  128  5e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.556038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0783  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 1041 aa  128  7e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.149411  normal  0.179647 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2685  TonB-dependent receptor  24.84 
 
 		 1026 aa  127  1e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1968  putative OmpA family protein  22.09 
 
 		 1051 aa  122  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1538  TonB-dependent receptor  29.81 
 
 		 1232 aa  122  3e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000318851  normal  0.580638 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2744  putative outer membrane protein with a TonB box  23.76 
 
 		 1061 aa  122  3e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.111846 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1501  TonB-dependent receptor  29.91 
 
 		 1123 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.175276  normal  0.273267 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1545  TonB-dependent receptor  31.12 
 
 		 1105 aa  120  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.222059 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0368  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  26.78 
 
 		 1066 aa  119  3.9999999999999997e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.73574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3218  hypothetical protein  29.9 
 
 		 1075 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.158023  normal  0.188502 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1116  TonB-dependent receptor, plug  31.02 
 
 		 1116 aa  117  2.0000000000000002e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.880967  normal  0.249969 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0918  Cna B-type protein  30.89 
 
 		 1203 aa  114  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.133902  normal  0.024731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0428  hypothetical protein  30.33 
 
 		 1196 aa  114  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.211152  normal  0.0171632 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03612  TonB-dependent outer membrane receptor  25.58 
 
 		 1010 aa  112  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1678  hypothetical protein  25.33 
 
 		 986 aa  109  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3909  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 1153 aa  107  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000652763  hitchhiker  0.00581227 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3831  hypothetical protein  27.08 
 
 		 1141 aa  107  1e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885568  normal  0.451604 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1549  TonB-dependent receptor  30.16 
 
 		 1065 aa  107  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.114571 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3895  TonB-dependent receptor  29.34 
 
 		 1149 aa  106  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1015  TonB-dependent receptor  25.34 
 
 		 1016 aa  106  2e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.501659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0292  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1122 aa  105  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.740643  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0281  hypothetical protein  29.02 
 
 		 1120 aa  104  8e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0270  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1126 aa  104  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0933  Cna B-type protein  30.03 
 
 		 1194 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.000219871  decreased coverage  0.000250734 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03611  TonB-dependent outer membrane receptor  25.76 
 
 		 1012 aa  103  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4154  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 		 1206 aa  101  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0417  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 1167 aa  101  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0498154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3506  Cna B-type protein  25.53 
 
 		 1195 aa  99  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.378795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2388  Cna B-type protein  28.75 
 
 		 1162 aa  94.4  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.315243  normal  0.974277 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0532  hypothetical protein  27.36 
 
 		 1161 aa  93.2  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.909749  normal  0.440813 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0536  OmpA family Oar-like outer membrane protein protein  24.16 
 
 		 1008 aa  92.8  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2573  Cna B-type protein  25.95 
 
 		 511 aa  91.3  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3525  Cna B-type protein  21.76 
 
 		 966 aa  90.1  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0423  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1162 aa  89.4  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000804756  normal  0.0470711 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0910  Cna B-type protein  29.03 
 
 		 1210 aa  89  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0761407  normal  0.0249052 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4190  TonB-dependent receptor  25.08 
 
 		 1114 aa  87.8  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.351423 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0292  hypothetical protein  27.76 
 
 		 1109 aa  87.8  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0395  hypothetical protein  25.16 
 
 		 1257 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3840  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1122 aa  85.9  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0625  Cna B-type protein  27.47 
 
 		 1298 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.320234 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0691  hypothetical protein  25.74 
 
 		 979 aa  83.2  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0168  TonB-dependent receptor  28.48 
 
 		 1066 aa  83.2  0.00000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1319  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1066 aa  82  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0274612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5509  TonB-dependent receptor plug  25.98 
 
 		 1054 aa  81.3  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.180232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4189  TonB-dependent receptor  25.61 
 
 		 1105 aa  80.5  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.316829  normal  0.196574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0401  TonB-dependent receptor  25.77 
 
 		 993 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00163541  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2819  TonB-dependent receptor  28.85 
 
 		 897 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0355  TonB-dependent receptor  27.09 
 
 		 888 aa  79  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.66622  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2136  TonB-dependent receptor  27.24 
 
 		 1124 aa  78.6  0.0000000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0917219  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2698  TonB-dependent receptor  26 
 
 		 1010 aa  77.4  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.396614 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3060  TonB-dependent receptor, plug  22.98 
 
 		 972 aa  77.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000347806  normal  0.043287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2675  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 1188 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.124411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2674  hypothetical protein  23.57 
 
 		 1132 aa  76.3  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01883  TonB-dependent Receptor/Oar-like protein  25.19 
 
 		 1037 aa  76.3  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.144968  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02276  TonB-dependent outer membrane Receptor  27.95 
 
 		 1050 aa  75.9  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0970  TonB-dependent receptor  25.73 
 
 		 991 aa  73.9  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0281  TonB-dependent receptor  27.89 
 
 		 952 aa  74.3  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3213  putative oar protein  23.47 
 
 		 1001 aa  73.6  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000600939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1750  TonB-dependent receptor  28.4 
 
 		 1087 aa  71.2  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0342  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 		 1007 aa  69.3  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.557003 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2820  TonB-dependent receptor plug  30.41 
 
 		 1057 aa  67.8  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.195725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1148  TonB-dependent receptor, plug  25.16 
 
 		 1007 aa  66.6  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  27.27 
 
 		 793 aa  64.7  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 		 791 aa  61.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0150  TonB-dependent receptor, plug  26.02 
 
 		 872 aa  59.7  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.755251  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0274  TonB-dependent receptor  35.57 
 
 		 1083 aa  58.9  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.302704 
 
 
-
 
NC_002950  PG0668  TonB-dependent receptor  28.7 
 
 		 757 aa  58.2  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.217902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4069  TonB-dependent receptor  32.06 
 
 		 824 aa  58.2  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0444701  normal  0.141518 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1161  TonB-dependent receptor  24.58 
 
 		 935 aa  57.4  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880371  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4954  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 1182 aa  57.8  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0461208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1758  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1089 aa  57.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5310  hypothetical protein  27.24 
 
 		 791 aa  57.8  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.26896  normal  0.238591 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>