263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0963 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0963  alpha/beta hydrolase fold protein  100 
 
 
374 aa  775    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0623938  hitchhiker  0.00346396 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2478  hypothetical protein  45.58 
 
 
442 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.991617 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1592  peptidase S15  43.7 
 
 
580 aa  268  8e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000232254  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6266  peptidase S15  33.83 
 
 
465 aa  213  4.9999999999999996e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0476291  normal  0.558827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6145  peptidase S15  37.13 
 
 
380 aa  212  9e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000966122  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2249  peptidase S15  36.84 
 
 
474 aa  209  4e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000310265  normal  0.111012 
 
 
-
 
NC_002950  PG1948  putative lipoprotein  34.84 
 
 
473 aa  177  2e-43  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0501  hypothetical protein  26.86 
 
 
436 aa  114  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.672777  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3018  hypothetical protein  32.32 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277726  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3126  hypothetical protein  30.42 
 
 
342 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3372  hypothetical protein  30.42 
 
 
341 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3112  hypothetical protein  30.77 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.200391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3346  hypothetical protein  30.8 
 
 
320 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3325  hypothetical protein  30.12 
 
 
317 aa  110  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3343  hypothetical protein  30.42 
 
 
337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.975652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3539  alpha/beta hydrolase fold protein  28.82 
 
 
309 aa  110  5e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.173848 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3348  hypothetical protein  30.42 
 
 
339 aa  110  5e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.077916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4484  BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase  29.02 
 
 
477 aa  110  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.061544  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0162  alpha/beta hydrolase fold  28.25 
 
 
321 aa  107  4e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1717  alpha/beta hydrolase fold  26.38 
 
 
315 aa  104  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1620  hypothetical protein  27.69 
 
 
309 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0597  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.76 
 
 
412 aa  97.4  3e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.458805  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0583  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  27.76 
 
 
412 aa  97.4  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1906  hypothetical protein  26.02 
 
 
434 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.189773  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0877  hypothetical protein  28.04 
 
 
316 aa  92.4  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000690525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3161  putative hydrolase  26.63 
 
 
512 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1232  alpha/beta fold family hydrolase  26.88 
 
 
305 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1262  alpha/beta hydrolase fold  30.71 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2905  putative hydrolase  27.86 
 
 
512 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.212149  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2298  alpha/beta hydrolase fold protein  29.01 
 
 
322 aa  87.8  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321032  decreased coverage  0.000193345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04770  alpha/beta hydrolase fold protein  25.58 
 
 
424 aa  87.4  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000317728  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2079  putative hydrolase  27.78 
 
 
512 aa  87.4  4e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1315  alpha/beta hydrolase fold  28.16 
 
 
320 aa  86.3  9e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0924774  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1130  hypothetical protein  29.43 
 
 
400 aa  85.9  9e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07480  hypothetical protein  28.4 
 
 
308 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0100804  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2741  hypothetical protein  26.25 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5497  putative hydrolase  27.83 
 
 
460 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.134483 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3820  PGAP1 family protein  27.72 
 
 
485 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.233276  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1881  lysophospholipase-like protein  26.74 
 
 
330 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.27985  normal  0.592044 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5342  hypothetical protein  27.14 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.764052  normal  0.588325 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3592  hypothetical protein  25.23 
 
 
323 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.712485  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0096  hydrolase  25.32 
 
 
517 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1702  hypothetical protein  25.54 
 
 
334 aa  82  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.412108  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0994  hypothetical protein  27.93 
 
 
460 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3509  Dienelactone hydrolase  28.57 
 
 
438 aa  81.6  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0691  hypothetical protein  26.04 
 
 
319 aa  80.1  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42770  hypothetical protein  23.99 
 
 
327 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4315  hypothetical protein  26.74 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1982  hypothetical protein  29.68 
 
 
460 aa  77  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.900389  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.83 
 
 
259 aa  76.6  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0541  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.48 
 
 
518 aa  76.3  0.0000000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.429802  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0299  hypothetical protein  24.46 
 
 
307 aa  76.3  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.261674 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1953  hypothetical protein  28.66 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1730  hypothetical protein  29.15 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1866  hypothetical protein  29.15 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1904  hypothetical protein  29.15 
 
 
460 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1475  hydrolase family protein  25.9 
 
 
335 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  33.07 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6453  hypothetical protein  24.28 
 
 
496 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.73648  normal  0.0509113 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6540  alpha/beta hydrolase fold  25.61 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.300513  normal  0.534481 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1708  hydrolase  29.5 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1682  hydrolase  28.61 
 
 
460 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.35711  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4544  hypothetical protein  26.14 
 
 
490 aa  70.5  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0186679  normal  0.180104 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23740  hydrolase, alpha/beta fold family  24.83 
 
 
317 aa  69.3  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.582768  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1501  Alpha/beta hydrolase  23.51 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.568195  normal  0.537602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2168  hypothetical protein  27.75 
 
 
498 aa  66.2  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.79256  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1578  dienelactone hydrolase  34.35 
 
 
255 aa  65.9  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1437  alpha/beta hydrolase fold  24.27 
 
 
320 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.872938  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0273  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.84 
 
 
292 aa  63.9  0.000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2582  peptidase S15  32.85 
 
 
258 aa  62.8  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1721  Alpha/beta hydrolase fold  24.24 
 
 
317 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3783  hypothetical protein  25.93 
 
 
354 aa  62.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1829  alpha/beta fold family hydrolase  23.86 
 
 
319 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.174462  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3881  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
320 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00418628  normal  0.248118 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2367  hypothetical protein  32.85 
 
 
290 aa  60.8  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4103  OsmC family protein  32.64 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.671514  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1279  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.54 
 
 
261 aa  60.1  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000359236  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  23.24 
 
 
286 aa  60.1  0.00000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1852  hypothetical protein  22.69 
 
 
343 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.613868  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0457  Lysophospholipase-like protein  35.34 
 
 
274 aa  59.3  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  23.24 
 
 
286 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1407  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
320 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0821941  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1150  dienelactone hydrolase  32 
 
 
254 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0847  hydrolase of the alpha/beta superfamily  38.04 
 
 
631 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1762  alpha/beta fold family hydrolase  36.08 
 
 
260 aa  58.5  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000326151  normal  0.089199 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5774  hypothetical protein  22.73 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.471625  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6139  hypothetical protein  22.73 
 
 
339 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.728188  normal  0.412726 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2430  esterase/lipase/thioesterase family protein  38.71 
 
 
285 aa  57  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.509013  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0807  hypothetical protein  29.55 
 
 
277 aa  56.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.552448  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1684  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  33.33 
 
 
248 aa  56.2  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2030  hypothetical protein  22.32 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258009 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2042  hypothetical protein  21.68 
 
 
343 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.429785  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7673  hypothetical protein  21.87 
 
 
339 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.310419 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5571  OsmC family protein  27.69 
 
 
408 aa  54.7  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0439292 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  27.34 
 
 
292 aa  54.7  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3329  hypothetical protein  25.48 
 
 
362 aa  54.7  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  31.07 
 
 
284 aa  54.3  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1903  hypothetical protein  29.71 
 
 
386 aa  53.5  0.000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1419  hypothetical protein  23.68 
 
 
328 aa  53.9  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.692935  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0470  hypothetical protein  42.5 
 
 
294 aa  53.1  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.739112 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>