More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0901 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0901  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
319 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0777869 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5514  putative dihydrokaempferol 4-reductase (NAD-dependent epimerase/dehydratase)  49.55 
 
 
340 aa  319  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.918772 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.34 
 
 
346 aa  306  2.0000000000000002e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.178304  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3396  NAD-dependent epimerase/dehydratase  49.25 
 
 
342 aa  303  2.0000000000000002e-81  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3803  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.16 
 
 
347 aa  296  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0426426  normal  0.159992 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4564  NAD-dependent epimerase/dehydratase  47.04 
 
 
325 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3990  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.97 
 
 
351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4455  NAD-dependent epimerase/dehydratase  41.07 
 
 
346 aa  272  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153396  normal  0.0330864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4376  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.97 
 
 
351 aa  271  1e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3538  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.7 
 
 
351 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.249443  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0387  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.73 
 
 
341 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.831837  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0377  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  42.73 
 
 
341 aa  263  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56924  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  41.72 
 
 
332 aa  229  5e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.302956 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80185  CAD family protein  40.24 
 
 
331 aa  226  4e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.101414  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34417  hypothetical protein  40.73 
 
 
328 aa  216  5e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.584917  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.47 
 
 
332 aa  202  7e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.527428  normal  0.235169 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5719  NAD-dependent epimerase/dehydratase  39.94 
 
 
352 aa  200  3e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.512451  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0529  dihydrokaempferol 4-reductase  41.11 
 
 
332 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4312  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.44 
 
 
341 aa  193  4e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.558578  normal  0.0371472 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.73 
 
 
335 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_31128  cinnamoyl-Coa reductase  36.53 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15511  dihydroflavonol-4-reductase  37.4 
 
 
322 aa  171  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.738069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.63 
 
 
348 aa  169  6e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.621455 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0547  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  37.78 
 
 
347 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.403557 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0788  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.56 
 
 
348 aa  158  1e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.892865 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0843  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
347 aa  154  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.34755  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05977  ketoreductase (AFU_orthologue; AFUA_2G10280)  35.59 
 
 
334 aa  151  1e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.396271 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5234  hypothetical protein  37.59 
 
 
349 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31257  predicted protein  35.19 
 
 
354 aa  144  2e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.367524  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_58065  dihydroflavonol-4-reductases  34.23 
 
 
335 aa  143  5e-33  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1931  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.23 
 
 
349 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.593459  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03560  dihydrokaempferol 4-reductase, putative  33.33 
 
 
346 aa  140  3e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.50925  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0503  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
346 aa  140  3e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2413  cinnamyl-alcohol dehydrogenase  31.94 
 
 
352 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208408  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1666  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.1 
 
 
355 aa  138  1e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0378933  normal  0.767388 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6522  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.8 
 
 
363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.21909 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_72153  NADPH-dependent methylglyoxal reductase GRE2  31.51 
 
 
337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00635585 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03540  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.29 
 
 
346 aa  130  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5668  dihydrokaempferol 4-reductase  33.7 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6032  dihydrokaempferol 4-reductase  33.7 
 
 
363 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.469593 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03550  D-lactaldehyde dehydrogenase, putative  31.27 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5544  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.7 
 
 
357 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.849034 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5780  dihydrokaempferol 4-reductase  34.42 
 
 
357 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42555 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36555  Cinnamyl-alcohol dehydrogenase Flavonol reductase/cinnamoyl-CoA reductase  30.63 
 
 
339 aa  120  1.9999999999999998e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0121063  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32463  protein induced by osmotic stress  30.29 
 
 
334 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.254213  normal  0.336313 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_49223  protein induced by osmotic stress  32.31 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.376808 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_50500  predicted protein  34.1 
 
 
358 aa  117  3e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.650002  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00765  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02250)  32.35 
 
 
343 aa  116  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56762  protein induced by osmotic stress  32.68 
 
 
334 aa  108  1e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.516497  normal  0.0996379 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2077  hypothetical protein  48.7 
 
 
155 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.398465  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42452  dihydroflavonol-4-reductases  28.27 
 
 
336 aa  105  9e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_39216  GRE2-like protein  29.64 
 
 
335 aa  105  1e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.239106  hitchhiker  0.00871069 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01830  oxidoreductase, putative  29.21 
 
 
357 aa  100  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2707  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.23 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.529174  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0153  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.57 
 
 
338 aa  97.4  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34974  NADPH-dependent Cinnamyl-alcohol dehydrogenase.  29.57 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.577054 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2986  oxidoreductase, putative  30.52 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0471013 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1830  hopanoid-associated sugar epimerase  30.8 
 
 
363 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.87 
 
 
333 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3249  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.43 
 
 
339 aa  87.8  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0678518 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0121  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.64 
 
 
361 aa  86.7  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20730  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase, RmlD  29.84 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.989981  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2444  hopanoid-associated sugar epimerase  28.26 
 
 
329 aa  85.1  0.000000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1207  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.82 
 
 
339 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0228638  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5422  hopanoid-associated sugar epimerase  27.03 
 
 
328 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.969886  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08583  aldehyde reductase II (AFU_orthologue; AFUA_1G11360)  29.82 
 
 
341 aa  82.8  0.000000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.835406  normal  0.302961 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2055  hopanoid-associated sugar epimerase  30.08 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2029  hopanoid-associated sugar epimerase  29.88 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3257  hopanoid-associated sugar epimerase  27.3 
 
 
335 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273856  normal  0.115519 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3939  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
352 aa  80.9  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.0000297127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7142  hopanoid-associated sugar epimerase  27.45 
 
 
347 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.516154  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3275  hopanoid-associated sugar epimerase  29.37 
 
 
328 aa  80.9  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1831  hopanoid-associated sugar epimerase  28.1 
 
 
341 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3897  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.67 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.213475 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1218  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.97 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
355 aa  79.3  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.129655 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1900  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.28 
 
 
358 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0547255  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5420  hopanoid-associated sugar epimerase  27.66 
 
 
335 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10818  hypothetical protein  37.86 
 
 
151 aa  78.6  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000907114  normal  0.897069 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4170  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.1 
 
 
358 aa  77.8  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.117289  normal  0.322206 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6351  hopanoid-associated sugar epimerase  25.89 
 
 
345 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4723  hopanoid-associated sugar epimerase  28.17 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0109  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5311  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.114305  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4873  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5549  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.17 
 
 
335 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.482021  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1940  hopanoid-associated sugar epimerase  27.45 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2216  hopanoid-associated sugar epimerase  27.45 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.313238  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0690  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.61 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1211  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.74 
 
 
347 aa  76.3  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2547  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  26.91 
 
 
334 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000238477  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2702  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.19 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0848085  normal  0.577467 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0551  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.76 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0999  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.14 
 
 
329 aa  73.9  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.170606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1325  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.96 
 
 
340 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1303  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.87 
 
 
333 aa  73.6  0.000000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.956027  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.08 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1223  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.6 
 
 
340 aa  72.8  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0774  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.15 
 
 
321 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.966324  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1543  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.96 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0124132  normal  0.0261393 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>