More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0811 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0811  TonB-dependent receptor  100 
 
 
1016 aa  2061    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000353149  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1482  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 
1051 aa  532  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0024542  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  32.79 
 
 
1161 aa  451  1e-125  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  32.29 
 
 
1128 aa  440  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 
1037 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  32.17 
 
 
1008 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 
1177 aa  425  1e-117  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.48 
 
 
1155 aa  423  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 
1124 aa  412  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  32.32 
 
 
1029 aa  404  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  31.68 
 
 
1066 aa  396  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 
1137 aa  395  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 
1127 aa  391  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  30.51 
 
 
1117 aa  388  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  31.39 
 
 
1013 aa  389  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.48 
 
 
1181 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  30.78 
 
 
1000 aa  384  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 
1006 aa  385  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  30.86 
 
 
1063 aa  386  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 
1012 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  31.26 
 
 
1012 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  30.92 
 
 
1038 aa  384  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 
1014 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 
1028 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 
979 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  31.41 
 
 
1140 aa  380  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  29.64 
 
 
1114 aa  381  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  30.47 
 
 
1155 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.95 
 
 
1023 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  30.61 
 
 
1026 aa  376  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  29.76 
 
 
1102 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
1087 aa  379  1e-103  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  30.2 
 
 
1082 aa  375  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  30.03 
 
 
1038 aa  375  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  29.77 
 
 
1050 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5059  TonB-dependent receptor plug  31.16 
 
 
1047 aa  369  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.25287 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.03 
 
 
1175 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  31.9 
 
 
1041 aa  368  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  29.2 
 
 
1132 aa  370  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  30.85 
 
 
1006 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  32.45 
 
 
1019 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  30.75 
 
 
1004 aa  369  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  29.14 
 
 
1079 aa  365  2e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  30.86 
 
 
1017 aa  364  4e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3251  TonB-dependent receptor  29.6 
 
 
1128 aa  364  5.0000000000000005e-99  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.672464  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  30.92 
 
 
1053 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  31.89 
 
 
1164 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  29.83 
 
 
1103 aa  363  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 
1039 aa  362  2e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 
1129 aa  362  2e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  29.26 
 
 
1025 aa  362  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
1144 aa  361  4e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  31.45 
 
 
1071 aa  358  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 
1006 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  29.33 
 
 
994 aa  358  2.9999999999999997e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  30.68 
 
 
1060 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  29.63 
 
 
1122 aa  357  8.999999999999999e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  28.97 
 
 
982 aa  356  1e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  30.04 
 
 
1021 aa  356  2e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 
1071 aa  356  2e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 
1051 aa  354  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 
1163 aa  354  5.9999999999999994e-96  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 
1043 aa  353  8e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  30.17 
 
 
1027 aa  353  8.999999999999999e-96  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0566  TonB-dependent receptor  31.23 
 
 
984 aa  352  1e-95  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0829893  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  28.6 
 
 
1023 aa  352  1e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 
976 aa  352  3e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4234  TonB-dependent receptor, plug  28.58 
 
 
1047 aa  350  6e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3172  TonB-dependent receptor plug  29.98 
 
 
1138 aa  350  6e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.455515  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  29.69 
 
 
1014 aa  350  7e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 
1097 aa  349  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  31.07 
 
 
1002 aa  349  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1762  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 
1023 aa  348  2e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  29.75 
 
 
1003 aa  348  3e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  29.93 
 
 
1168 aa  348  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.6 
 
 
1051 aa  348  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 
1008 aa  347  5e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7271  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 
1084 aa  345  2e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000107039  normal  0.655848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  28.83 
 
 
1064 aa  345  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 
1085 aa  345  2.9999999999999997e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5062  TonB-dependent receptor plug  30.97 
 
 
1037 aa  344  4e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  30.9 
 
 
1055 aa  344  4e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  29.55 
 
 
1189 aa  343  8e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.92 
 
 
1039 aa  342  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  30.13 
 
 
1152 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  27.82 
 
 
1040 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  29.79 
 
 
1081 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.58 
 
 
986 aa  342  2.9999999999999998e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.19 
 
 
1106 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  30.37 
 
 
1076 aa  341  4e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 
1023 aa  340  9e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2431  TonB-dependent receptor  29.73 
 
 
1011 aa  339  1.9999999999999998e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.086819  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  29.06 
 
 
1096 aa  339  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  28.02 
 
 
1071 aa  339  1.9999999999999998e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5798  TonB-dependent receptor plug  29.61 
 
 
1202 aa  338  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.887115  normal  0.170321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  28.82 
 
 
1062 aa  338  3.9999999999999995e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 
993 aa  337  7.999999999999999e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  29.37 
 
 
1004 aa  337  7.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.44 
 
 
1076 aa  336  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0640  TonB-dependent receptor plug  28.5 
 
 
1125 aa  336  2e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.138421 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>