102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0795 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  100 
 
 		 346 aa  718    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  72.17 
 
 		 346 aa  524  1e-148  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4846  Xylan 1,4-beta-xylosidase  64.58 
 
 		 367 aa  441  1e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960373  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0822  Alpha-L-arabinofuranosidase  66.98 
 
 		 385 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000001862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1998  Alpha-N-arabinofuranosidase  62.27 
 
 		 344 aa  420  1e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1323  Alpha-N-arabinofuranosidase  60.75 
 
 		 330 aa  404  1e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2614  glycoside hydrolase family 43  58.26 
 
 		 326 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  59.94 
 
 		 383 aa  396  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0375  Alpha-N-arabinofuranosidase  56.88 
 
 		 320 aa  389  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03869  beta-xylosidase (1,4-beta-D-xylan xylohydrolase) (Xylan1,4-beta-xylosidase) (Exo-beta-(1,4)-xylanase)  56.76 
 
 		 344 aa  388  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01477  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  52.45 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0551  Xylan 1,4-beta-xylosidase  54.43 
 
 		 335 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239269 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0810  carbohydrate-binding family 6 protein  36.36 
 
 		 450 aa  204  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.034958  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  35.28 
 
 		 444 aa  192  8e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.65 
 
 		 316 aa  182  7e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0946  SecY protein  35.39 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.409307  hitchhiker  0.0000724629 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  33.13 
 
 		 533 aa  156  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  33.64 
 
 		 509 aa  150  4e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  31.15 
 
 		 464 aa  147  3e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  29.45 
 
 		 618 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  31.85 
 
 		 1186 aa  145  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2447  putative xylosidase  31.02 
 
 		 468 aa  145  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.320135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  31.77 
 
 		 679 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  31.69 
 
 		 524 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  30.99 
 
 		 535 aa  137  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2837  glycoside hydrolase family 43  29.17 
 
 		 348 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.61366  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10919  hypothetical protein  28.83 
 
 		 383 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0280473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1982  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 315 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000010784  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1992  glycoside hydrolase family protein  31.07 
 
 		 315 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000493506  unclonable  0.0000204974 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2069  glycoside hydrolase family protein  30.77 
 
 		 315 aa  125  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000027007  hitchhiker  0.0000035019 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2063  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000284349  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2143  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 		 311 aa  120  3e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.209046  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01459  xylosidase; arabinosidase  29.38 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.928055  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0789  endo-1,4-beta-xylanase D precursor  28.85 
 
 		 317 aa  116  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0130439  normal  0.452031 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  30.65 
 
 		 487 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0823  glycoside hydrolase family 43  25.9 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.328209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2384  glycoside hydrolase family 43  28.3 
 
 		 330 aa  101  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0182  glycoside hydrolase family 43  27.69 
 
 		 1338 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0193  glycoside hydrolase family 43  29.38 
 
 		 324 aa  97.8  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00680352  normal  0.581709 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1928  Carbohydrate-binding CenC domain protein  26.56 
 
 		 712 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6730  glycoside hydrolase family 43  30.45 
 
 		 323 aa  93.6  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.575675  normal  0.920031 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3109  glycoside hydrolase family protein  28.65 
 
 		 644 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3276  carbohydrate-binding family 6 protein  27.84 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16970  beta-xylosidase  29.04 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.374085 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0531  Alpha-N-arabinofuranosidase  26.96 
 
 		 471 aa  82.8  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1660  carbohydrate binding domain/beta-xylosidase family protein  27.08 
 
 		 667 aa  82  0.00000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.324921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1011  glycoside hydrolase family 43  27.38 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01870  xylosidase/arabinosidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G04480)  25.93 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20580  glycoside hydrolase family 43  26.24 
 
 		 315 aa  69.3  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  26.37 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0536  glycoside hydrolase family 43  30.09 
 
 		 393 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.812392 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  26.77 
 
 		 334 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0359  glycoside hydrolase family protein  27.78 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212595 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3519  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.51 
 
 		 640 aa  59.3  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2722  glycoside hydrolase family protein  26.21 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123508  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2482  glycoside hydrolase family 43  27.1 
 
 		 384 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24102 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.57 
 
 		 352 aa  57  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  35.8 
 
 		 472 aa  53.5  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2027  glycoside hydrolase family protein  28.27 
 
 		 325 aa  53.1  0.000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.808853  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2639  glycoside hydrolase family 43  24.51 
 
 		 472 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.431626  normal  0.0143862 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 		 337 aa  51.2  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0745  glycoside hydrolase family 43  26.24 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.465475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  27.89 
 
 		 543 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  26.64 
 
 		 495 aa  50.4  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6022  glycoside hydrolase family 43  28.79 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  25.41 
 
 		 343 aa  49.7  0.00007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2556  glycoside hydrolase family 43  27.54 
 
 		 319 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.149373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.1 
 
 		 357 aa  47  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  27.9 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  25.52 
 
 		 345 aa  47  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.57 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  37.5 
 
 		 636 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  24.24 
 
 		 355 aa  46.2  0.0009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.57 
 
 		 355 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  34.48 
 
 		 512 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  23.27 
 
 		 341 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3903  glycoside hydrolase family protein  24.87 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.969992  normal  0.175565 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  22.34 
 
 		 829 aa  46.2  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  33.86 
 
 		 341 aa  45.4  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  22.34 
 
 		 346 aa  44.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  23.98 
 
 		 789 aa  45.1  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0753  glycoside hydrolase family protein  21.16 
 
 		 465 aa  45.1  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  34.48 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2971  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 		 855 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0529993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  25.32 
 
 		 536 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  27.98 
 
 		 519 aa  44.3  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1751  coagulation factor 5/8 type domain protein  23.19 
 
 		 576 aa  44.3  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  27.48 
 
 		 315 aa  44.3  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  31.4 
 
 		 510 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3932  glycoside hydrolase family 43  26.3 
 
 		 456 aa  44.3  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0739  glycoside hydrolase family protein  28.98 
 
 		 348 aa  43.9  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29240  beta-xylosidase  35.71 
 
 		 527 aa  43.9  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21180  beta-xylosidase  24.49 
 
 		 526 aa  43.9  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.851115  normal  0.166078 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1115  family 43 glycoside hydrolase  23.53 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3298  coagulation factor 5/8 type domain protein  44.83 
 
 		 593 aa  43.5  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.679676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0628  glycoside hydrolase family 43  39.51 
 
 		 505 aa  43.5  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  25.68 
 
 		 400 aa  43.1  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1500  glycoside hydrolase family 43  25.1 
 
 		 551 aa  43.1  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.36043 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2392  glycoside hydrolase family 43  26.37 
 
 		 306 aa  42.7  0.009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000540158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>