253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0754 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  100 
 
 
189 aa  388  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0402  dihydrofolate reductase (DHFR)  54.3 
 
 
185 aa  217  8.999999999999998e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.166347  normal  0.291819 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.86 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.169407 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1408  bifunctional deaminase-reductase domain protein  38.74 
 
 
193 aa  125  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3191  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  39.67 
 
 
181 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2196  bifunctional deaminase-reductase-like  37.1 
 
 
183 aa  114  7.999999999999999e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1598  bifunctional deaminase-reductase-like protein  34.95 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.127756  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1622  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 
188 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.63 
 
 
188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0840105  normal  0.042227 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1568  deaminase-reductase domain-containing protein  34.95 
 
 
188 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3231  deaminase-reductase domain-containing protein  34.41 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.134555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0841  hypothetical protein  35.68 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6982  deaminase-reductase domain-containing protein  34.46 
 
 
183 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal  0.296954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4224  hypothetical protein  37.85 
 
 
178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.233961  hitchhiker  0.00450142 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3049  dihydrofolate reductase  36.46 
 
 
177 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.611041  normal  0.73255 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3226  riboflavin biosynthesis protein RibD C- domain protein  38.04 
 
 
181 aa  106  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3264  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.26 
 
 
199 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.254237 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0435  deaminase-reductase domain-containing protein  37.36 
 
 
190 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0235  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.11 
 
 
185 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.574714  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2769  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.57 
 
 
180 aa  101  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000125006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5174  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.59 
 
 
187 aa  100  9e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3986  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.29 
 
 
201 aa  100  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.348417  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0206  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
187 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.399944  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3696  deaminase-reductase domain-containing protein  36.16 
 
 
181 aa  99.4  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0966015 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1407  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.15 
 
 
190 aa  98.2  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.436948  normal  0.325348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0446  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.63 
 
 
192 aa  98.2  6e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.218483 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6890  putative pyrimidine reductase  34.44 
 
 
179 aa  97.1  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.041344  normal  0.0312743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6617  deaminase-reductase domain-containing protein  34.74 
 
 
188 aa  96.7  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9200  hypothetical protein  40.67 
 
 
183 aa  96.7  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.461066 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1753  dihydrofolate reductase  32.04 
 
 
182 aa  95.9  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6952  dihydrofolate reductase  32 
 
 
178 aa  95.5  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0947  bifunctional deaminase-reductase-like protein  38.96 
 
 
180 aa  95.5  5e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.828499  normal  0.189337 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2243  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35 
 
 
184 aa  95.1  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0952608  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2088  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.37 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.810748 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1417  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.87 
 
 
187 aa  94.7  7e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.291407  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5813  deaminase-reductase domain-containing protein  35.71 
 
 
188 aa  94.4  8e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3320  bifunctional deaminase-reductase domain protein  39.01 
 
 
182 aa  94.4  9e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3441  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.45 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3394  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.58 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.836759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4552  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.59 
 
 
183 aa  92.4  3e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4888  deaminase-reductase domain-containing protein  33.9 
 
 
187 aa  92  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.600343 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4785  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.22 
 
 
195 aa  92  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4307  bifunctional deaminase-reductase-like  37.41 
 
 
167 aa  91.7  6e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.912167  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25630  dihydrofolate reductase  32.45 
 
 
196 aa  91.3  7e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.258312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3313  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.55 
 
 
181 aa  91.3  8e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6356  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
177 aa  90.9  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0933407 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0073  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.64 
 
 
202 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3196  bifunctional deaminase-reductase-like  35.26 
 
 
182 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4124  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.56 
 
 
181 aa  90.9  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0157  deaminase-reductase domain-containing protein  32.57 
 
 
180 aa  90.9  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.017532  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0878  bifunctional deaminase-reductase domain protein  37.41 
 
 
183 aa  90.1  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00263452 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7425  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.36 
 
 
178 aa  89.4  3e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1605  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.03 
 
 
187 aa  88.6  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.184387  normal  0.0697027 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0483  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.02 
 
 
182 aa  88.6  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.269465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1520  deaminase-reductase domain-containing protein  33.52 
 
 
178 aa  88.2  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0559645  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4299  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.49 
 
 
188 aa  87.8  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.293289  normal  0.211021 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0585  bifunctional deaminase-reductase domain protein  36.81 
 
 
188 aa  86.7  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.705013  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1267  deaminase-reductase domain-containing protein  37.59 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.924885  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2386  bifunctional deaminase-reductase domain protein  28.72 
 
 
192 aa  87  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.385756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3362  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.64 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.543985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1507  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  29.73 
 
 
186 aa  86.3  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467899  normal  0.0556657 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4932  deaminase-reductase domain-containing protein  35.06 
 
 
182 aa  85.1  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.916718  normal  0.605792 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1391  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.61 
 
 
204 aa  84.7  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.942421  normal  0.0216388 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2316  bifunctional deaminase-reductase-like protein  32.62 
 
 
179 aa  84.7  7e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1327  deaminase-reductase domain-containing protein  33.57 
 
 
228 aa  84.7  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.152684  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1023  bifunctional deaminase-reductase-like protein  35.8 
 
 
178 aa  84.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.181423  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5735  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  33.7 
 
 
203 aa  84  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.592899 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4011  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.81 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0562  hypothetical protein  36.36 
 
 
198 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.154273  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2336  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.94 
 
 
185 aa  83.2  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00114514  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1754  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
187 aa  83.2  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.898411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5832  deaminase-reductase domain-containing protein  32.4 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3912  bifunctional deaminase-reductase-like  30.43 
 
 
215 aa  81.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1353  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.68 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.137932 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0204  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.58 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3841  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.42 
 
 
196 aa  80.5  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.760815  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2385  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.34 
 
 
197 aa  80.9  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0718176  decreased coverage  0.000891672 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2260  deaminase-reductase domain-containing protein  31.71 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.163458  normal  0.0390077 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2397  dihydrofolate reductase  40.2 
 
 
116 aa  80.1  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26350  dihydrofolate reductase  27.98 
 
 
208 aa  80.1  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.595114 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4641  deaminase-reductase domain-containing protein  33.87 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.487001  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3071  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
188 aa  79.3  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4298  deaminase-reductase domain-containing protein  34.34 
 
 
186 aa  79.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.943714 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1629  deaminase-reductase domain-containing protein  32.46 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.399046  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0824  bifunctional deaminase-reductase domain protein  30.43 
 
 
194 aa  78.6  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.308589 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0677  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.84 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.755409  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3251  deaminase-reductase domain-containing protein  34.13 
 
 
204 aa  78.6  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4053  bifunctional deaminase-reductase domain protein  33.33 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1616  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.47 
 
 
204 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.363546  normal  0.130243 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1554  bifunctional deaminase-reductase domain protein  35.71 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00264154  normal  0.0363963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1904  bifunctional deaminase-reductase domain-containing protein  35 
 
 
200 aa  77  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0360214  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2917  dihydrofolate reductase  31.16 
 
 
181 aa  77  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0223185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5158  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.39 
 
 
187 aa  76.3  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3842  bifunctional deaminase-reductase domain protein  32.07 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1068  bifunctional deaminase-reductase domain protein  34.29 
 
 
221 aa  75.1  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.335275  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1784  bifunctional deaminase-reductase domain protein  27.32 
 
 
189 aa  74.7  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.577777  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1705  deaminase-reductase domain-containing protein  31.77 
 
 
194 aa  74.3  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.734607 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1347  bifunctional deaminase-reductase domain protein  26.59 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.211147 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1818  deaminase-reductase domain-containing protein  30.38 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0584367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3871  bifunctional deaminase-reductase domain protein  31.22 
 
 
180 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.957428  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>