41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0743 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0743  methyltransferase FkbM family  100 
 
 		 219 aa  449  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.522267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2284  hypothetical protein  44.33 
 
 		 231 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0555539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04490  hypothetical protein  35.94 
 
 		 265 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.210415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1730  methyltransferase FkbM  37.95 
 
 		 342 aa  112  3e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0402  methyltransferase FkbM  34.5 
 
 		 1644 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0882  FkbM family methyltransferase  34.5 
 
 		 1644 aa  112  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4282  methyltransferase FkbM  32.99 
 
 		 409 aa  111  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00730  methyltransferase, FkbM family  35.93 
 
 		 314 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.614397  normal  0.455624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6938  FkbM family methyltransferase  34.2 
 
 		 243 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0169669 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0307  methyltransferase FkbM  34.94 
 
 		 271 aa  101  8e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000376535  normal  0.78325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2964  methyltransferase, FkbM family domain protein  30.05 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2577  methyltransferase FkbM family  30.05 
 
 		 249 aa  96.7  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.40457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0748  FkbM family methyltransferase  32 
 
 		 447 aa  95.1  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1160  methyltransferase FkbM family  31.89 
 
 		 879 aa  94.7  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.080922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2942  FkbM family methyltransferase  29.9 
 
 		 477 aa  92.8  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.342102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0229  FkbM family methyltransferase  30.05 
 
 		 320 aa  91.7  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0759  methyltransferase FkbM family  30.54 
 
 		 444 aa  91.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1328  methyltransferase FkbM family protein  29.76 
 
 		 785 aa  85.9  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1703  hypothetical protein  29.44 
 
 		 459 aa  85.9  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1632  FkbM family methyltransferase  29.44 
 
 		 456 aa  85.1  8e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.973104  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1795  methyltransferase FkbM  26.91 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.62261  normal  0.0138427 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3994  methyltransferase FkbM  29.19 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2698  methyltransferase FkbM family  30.39 
 
 		 579 aa  62.8  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00917993 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1043  methyltransferase FkbM  27.67 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00348419  hitchhiker  0.00514259 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36060  predicted protein  25.27 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45808  predicted protein  22.4 
 
 		 784 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.558065  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0538  methyltransferase FkbM family  28.27 
 
 		 228 aa  51.6  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1497  hypothetical protein  23.33 
 
 		 241 aa  50.8  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0111137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37903  predicted protein  24.76 
 
 		 293 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.166915  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3754  FkbM family methyltransferase  24.31 
 
 		 569 aa  48.9  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.909062 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35605  predicted protein  23.08 
 
 		 251 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0243363  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_49826  predicted protein  22.82 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.078765  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50348  predicted protein  22.82 
 
 		 317 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00515891  n/a   
 
 
-
 
NC_011700  PHATRDRAFT_50607  predicted protein  22.03 
 
 		 351 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4762  FkbM family methyltransferase  29.67 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.175794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0046  methyltransferase FkbM family  23.32 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0044  methyltransferase FkbM family  23.32 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.170743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3354  hypothetical protein  24.51 
 
 		 238 aa  42.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.96457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18201  hypothetical protein  24 
 
 		 430 aa  42.4  0.005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.48017 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13911  hypothetical protein  23.76 
 
 		 264 aa  42  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2951  methyltransferase FkbM family  26.45 
 
 		 829 aa  41.6  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14981  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>