More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0718 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0617  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  43.34 
 
 
1773 aa  1405    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.716673  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0718  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  100 
 
 
1783 aa  3683    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.281324  normal  0.533675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4322  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.13 
 
 
1797 aa  1272    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000460936  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1484  hypothetical protein  29.32 
 
 
937 aa  219  4e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0188972  normal  0.663437 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4242  hypothetical protein  27.61 
 
 
903 aa  213  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.37715  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  28.23 
 
 
2552 aa  165  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0937  KP-43 peptidase  27.23 
 
 
1351 aa  157  2e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.215277  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.19 
 
 
1726 aa  139  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0130  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 
1231 aa  139  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.231553  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.74 
 
 
1328 aa  139  6.0000000000000005e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  29.65 
 
 
1223 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3524  peptidase S8 and S53  29.52 
 
 
1748 aa  129  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4157  S-layer domain protein  30.27 
 
 
1204 aa  127  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151258 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3479  KP-43 peptidase  27.93 
 
 
697 aa  115  7.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3548  APHP domain-containing protein  27.37 
 
 
1613 aa  113  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.107963  normal  0.0158906 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.67 
 
 
1234 aa  112  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00562436  hitchhiker  0.0000368528 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3015  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.13 
 
 
835 aa  112  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000302047  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
1016 aa  111  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  33.16 
 
 
665 aa  97.8  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5991  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.34 
 
 
1343 aa  95.1  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0085  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 
866 aa  94  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2050  FG-GAP repeat protein  27.71 
 
 
1437 aa  93.2  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0502  lipoprotein  34.52 
 
 
1575 aa  91.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620204  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2120  hypothetical protein  30.65 
 
 
362 aa  89.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2283  polymorphic outer membrane protein  32.86 
 
 
1296 aa  89.7  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4312  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.87 
 
 
1253 aa  89  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.338305 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3219  fibronectin type III domain-containing protein  25.12 
 
 
2030 aa  87.8  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.341316  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2139  CHU large protein, SAP or adhesin AidA-related  29.82 
 
 
688 aa  88.2  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.534536  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1747  hypothetical protein  32.84 
 
 
495 aa  88.6  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5291  hypothetical protein  32.11 
 
 
736 aa  87  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.775862  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0532  hypothetical protein  30 
 
 
757 aa  86.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0519891  normal  0.677455 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2192  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.19 
 
 
576 aa  85.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1792  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.06 
 
 
686 aa  84.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0554398 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0537  hypothetical protein  32.46 
 
 
1029 aa  84  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.244955  normal  0.441829 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1757  hypothetical protein  32.62 
 
 
341 aa  84  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  33.21 
 
 
1106 aa  83.6  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  32.45 
 
 
803 aa  82.8  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2527  FG-GAP repeat protein  35.48 
 
 
1433 aa  82.4  0.00000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000205902  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5990  hypothetical protein  29.03 
 
 
925 aa  82.4  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.671162 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4535  hypothetical protein  33.12 
 
 
333 aa  82  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.896481 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1660  hypothetical protein  32.43 
 
 
491 aa  81.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4418  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.05 
 
 
2171 aa  80.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4867  hypothetical protein  33.5 
 
 
657 aa  81.3  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.863369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0083  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  31.1 
 
 
1361 aa  80.1  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1275  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
509 aa  79.7  0.0000000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0258128  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0384  hypothetical protein  35.91 
 
 
700 aa  79.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000171472  normal  0.22141 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.15 
 
 
2182 aa  79  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2655  Spore coat protein CotH  32.65 
 
 
1174 aa  78.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2179  hypothetical protein  32.63 
 
 
541 aa  77.8  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5604  hypothetical protein  31.48 
 
 
1294 aa  78.2  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4630  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.94 
 
 
1405 aa  77.4  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8183  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.33 
 
 
1239 aa  77  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574663  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1942  hypothetical protein  31.22 
 
 
501 aa  77  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.507224 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0821  hypothetical protein  29.09 
 
 
1055 aa  76.6  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661621  normal  0.324111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2829  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.94 
 
 
999 aa  75.9  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0476517  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1580  hypothetical protein  30.85 
 
 
601 aa  75.5  0.000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000412506  normal  0.738361 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0535  hypothetical protein  29.17 
 
 
1003 aa  75.5  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.525327 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0572  hypothetical protein  32.88 
 
 
347 aa  74.3  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5262  hypothetical protein  27.24 
 
 
1215 aa  73.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.653834  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1853  lipoprotein  32.8 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0367597  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5651  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.06 
 
 
628 aa  73.9  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.460503  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4118  hypothetical protein  30.98 
 
 
755 aa  73.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.637469 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  44.19 
 
 
297 aa  73.2  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2656  hypothetical protein  35.2 
 
 
571 aa  73.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5663  hypothetical protein  32.29 
 
 
324 aa  73.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1579  hypothetical protein  31.82 
 
 
394 aa  72.4  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.039353  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.14 
 
 
1172 aa  72.4  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4203  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.74 
 
 
1333 aa  72  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5318  hitchhiker  0.00171277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.7 
 
 
678 aa  71.6  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2027  hypothetical protein  28.41 
 
 
693 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5728  Ig family protein  29.82 
 
 
646 aa  71.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.972475  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1867  lipoprotein  30.68 
 
 
634 aa  70.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0726  hypothetical protein  24.04 
 
 
1263 aa  70.5  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.434756  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0023  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.03 
 
 
1008 aa  70.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.421595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3327  hypothetical protein  35.17 
 
 
428 aa  70.5  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.802157  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.64 
 
 
699 aa  70.1  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1341  conserved repeat domain protein  29.53 
 
 
1668 aa  69.7  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2279  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.22 
 
 
589 aa  69.7  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  32.67 
 
 
644 aa  69.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4181  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  29.63 
 
 
570 aa  69.3  0.0000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.100139  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.29 
 
 
1060 aa  69.3  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.16 
 
 
1261 aa  68.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.791667  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0723  hypothetical protein  23.23 
 
 
1318 aa  67.4  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.661776 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3308  hypothetical protein  28.49 
 
 
340 aa  67.8  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2437  hypothetical protein  29.59 
 
 
846 aa  67  0.000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0846  subtilisin-like serine protease  42.35 
 
 
1618 aa  66.6  0.000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4203  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.9 
 
 
915 aa  66.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3347  hypothetical protein  40.95 
 
 
477 aa  66.2  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.702063  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1569  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.35 
 
 
806 aa  66.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  49.25 
 
 
1570 aa  66.2  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4652  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.6 
 
 
986 aa  66.2  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0586324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0385  metallophosphoesterase  32.52 
 
 
701 aa  66.2  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00164005  normal  0.49014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1596  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 
1262 aa  66.2  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.79 
 
 
900 aa  65.9  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  38.71 
 
 
917 aa  65.9  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4541  hypothetical protein  31.11 
 
 
996 aa  65.9  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.444049  normal  0.286675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2773  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.34 
 
 
997 aa  65.9  0.000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0362893  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2337  hypothetical protein  31.22 
 
 
1147 aa  65.5  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00625396  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4090  minor extracellular protease  37.1 
 
 
917 aa  65.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.957358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4436  minor extracellular protease VpR  37.1 
 
 
917 aa  65.5  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>