286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0701 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0701  protein of unknown function DUF59  100 
 
 
105 aa  211  1.9999999999999998e-54  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.965894  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2151  protein of unknown function DUF59  47.92 
 
 
107 aa  87.8  5e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1551  protein of unknown function DUF59  42.55 
 
 
100 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0721  protein of unknown function DUF59  41.49 
 
 
100 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1389  protein of unknown function DUF59  40.95 
 
 
106 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2963  hypothetical protein  44.79 
 
 
113 aa  80.1  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.097887  normal  0.074667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2804  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2739  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1695  hypothetical protein  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2681  phenylacetic acid degradation protein paaD  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2380  hypothetical protein  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2907  hypothetical protein  41.58 
 
 
114 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2291  protein of unknown function DUF59  43.53 
 
 
109 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0318532  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3948  hypothetical protein  42.05 
 
 
109 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0668  hypothetical protein  43.16 
 
 
156 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00352857  normal  0.307047 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5673  hypothetical protein  47.73 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1484  hypothetical protein  37 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0464568  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6120  hypothetical protein  48.81 
 
 
136 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0673511  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1812  mrp protein  38.32 
 
 
112 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0588494  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1833  protein of unknown function DUF59  45.98 
 
 
99 aa  73.9  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0641  hypothetical protein  40.21 
 
 
111 aa  73.9  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0200  hypothetical protein  43.16 
 
 
160 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0466  protein of unknown function DUF59  43.62 
 
 
100 aa  73.6  0.0000000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420765  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0657  hypothetical protein  39.18 
 
 
111 aa  72.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0991  hypothetical protein  41.84 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.110893  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0972  hypothetical protein  41.84 
 
 
102 aa  72.8  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.530657  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2957  protein of unknown function DUF59  40.82 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1281  hypothetical protein  42.99 
 
 
118 aa  72.8  0.000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.654013 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2106  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.070916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0960  hypothetical protein  38.24 
 
 
110 aa  72  0.000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000488551  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1447  hypothetical protein  39.22 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.399108  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2575  hypothetical protein  46.99 
 
 
131 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.051429  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2230  protein of unknown function DUF59  37.5 
 
 
117 aa  72  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000479191  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0562  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0876  hypothetical protein  42.86 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1425  hypothetical protein  37.25 
 
 
113 aa  71.2  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00404545  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1842  YitW  38.3 
 
 
96 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0133153  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0937  protein of unknown function DUF59  37.86 
 
 
107 aa  70.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00705521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0973  hypothetical protein  36.84 
 
 
108 aa  71.2  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0901491  normal  0.0907936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1981  hypothetical protein  42.71 
 
 
120 aa  70.5  0.000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.170034  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0632  hypothetical protein  41.38 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.534801  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3876  hypothetical protein  39.25 
 
 
179 aa  70.5  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107724  normal  0.0166162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0268  protein of unknown function DUF59  33.65 
 
 
133 aa  68.9  0.00000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3473  hypothetical protein  32.69 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.642924  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2107  hypothetical protein  45.05 
 
 
110 aa  68.6  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0521729  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2914  FeS assembly SUF system protein  41.49 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.446647  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4866  hypothetical protein  39.8 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4274  hypothetical protein  40.62 
 
 
128 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1375  YitW  36.84 
 
 
98 aa  67.4  0.00000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000417964  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0561  YitW  37.23 
 
 
93 aa  67  0.00000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0356325  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1270  hypothetical protein  36.11 
 
 
182 aa  66.6  0.0000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5182  hypothetical protein  38.78 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00344764  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1146  protein of unknown function DUF59  38.83 
 
 
109 aa  66.2  0.0000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.501134  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3350  protein of unknown function DUF59  37.89 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.10795 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5196  hypothetical protein  38.78 
 
 
105 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3621  hypothetical protein  38.54 
 
 
104 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11520  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  43.52 
 
 
108 aa  66.6  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0389496  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3035  FeS assembly SUF system protein  35 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.010077 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13400  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.71 
 
 
108 aa  66.2  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0107382  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4906  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4751  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000601505  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4770  hypothetical protein  38.78 
 
 
105 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5281  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.604827  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1600  FeS assembly SUF system protein SufT  38.32 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0141  hypothetical protein  43.16 
 
 
124 aa  65.9  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00350528  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0498  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.305412 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2281  protein of unknown function DUF59  41.84 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000601574  hitchhiker  0.00785585 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5151  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000362667 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2530  hypothetical protein  44.57 
 
 
105 aa  65.9  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0900  hypothetical protein  39.33 
 
 
108 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5981  metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  32.41 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.579625  normal  0.0823678 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0711  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.223396  normal  0.719184 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04480  hypothetical protein  34.69 
 
 
108 aa  65.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.633098  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0248  hypothetical protein  36.26 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1777  hypothetical protein  39.77 
 
 
105 aa  64.7  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0348  protein of unknown function DUF59  32.98 
 
 
96 aa  64.7  0.0000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000101094  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16180  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  37.78 
 
 
134 aa  64.7  0.0000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5887  hypothetical protein  37.37 
 
 
120 aa  64.7  0.0000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1024  protein of unknown function DUF59  35.71 
 
 
142 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.929199  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2485  hypothetical protein  38.46 
 
 
183 aa  63.9  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5187  hypothetical protein  37.76 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.287075  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14660  predicted metal-sulfur cluster biosynthetic enzyme  38.1 
 
 
110 aa  64.3  0.0000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0062  phenylacetic acid degradation protein PaaD  37.76 
 
 
105 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  hitchhiker  0.00639923 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0795  hypothetical protein  38.3 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.944317  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0606  protein of unknown function DUF59  39.13 
 
 
105 aa  63.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.712634  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  40.23 
 
 
238 aa  63.9  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2422  protein of unknown function DUF59  40 
 
 
112 aa  63.9  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2836  hypothetical protein  37.61 
 
 
123 aa  63.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0221891  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1849  protein of unknown function DUF59  41.76 
 
 
110 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1571  hypothetical protein  37.62 
 
 
105 aa  63.5  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1237  hypothetical protein  35.78 
 
 
187 aa  63.5  0.0000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.568332  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1459  hypothetical protein  39.81 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.226744  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0998  hypothetical protein  36.08 
 
 
108 aa  63.5  0.0000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.239725 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1197  hypothetical protein  36 
 
 
104 aa  63.2  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.792644  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1435  protein of unknown function DUF59  41.67 
 
 
99 aa  63.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2460  hypothetical protein  39.09 
 
 
122 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0123184  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0909  protein of unknown function DUF59  34.38 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0748991  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2267  hypothetical protein  37.14 
 
 
121 aa  62.4  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0373343  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0118  protein of unknown function DUF59  36.67 
 
 
99 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1363  protein of unknown function DUF59  39.08 
 
 
111 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>