More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0659 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0659  AAA ATPase central domain protein  100 
 
 
442 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0372478  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3168  ATPase central domain-containing protein  52.53 
 
 
434 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0578626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2559  AAA ATPase central domain protein  51.62 
 
 
450 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.585202  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1669  AAA ATPase central domain protein  51.16 
 
 
450 aa  449  1e-125  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3934  AAA ATPase central domain protein  44.73 
 
 
450 aa  391  1e-107  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.158027  normal  0.185322 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1049  elongation factor P  47.37 
 
 
432 aa  386  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0362  ATPase central domain-containing protein  44.77 
 
 
448 aa  381  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5237  AAA ATPase central domain protein  46.29 
 
 
459 aa  353  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.368199  hitchhiker  0.00000000902621 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2996  AAA ATPase, central region  40.5 
 
 
478 aa  347  2e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4120  AAA ATPase central domain protein  43.7 
 
 
466 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0052109  hitchhiker  0.000242019 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3602  AAA ATPase, central region  47.38 
 
 
448 aa  345  7e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.000000057004 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3136  AAA ATPase, central region  41.36 
 
 
478 aa  299  7e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2455  putative ATPase  39.3 
 
 
441 aa  271  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0571186  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1879  AAA ATPase  43.61 
 
 
787 aa  226  9e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2830  ATPase central domain-containing protein  44.87 
 
 
657 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0972  AAA family ATPase  41.64 
 
 
743 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1952  AAA ATPase central domain protein  44.49 
 
 
656 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.248161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1651  ATPase central domain-containing protein  45.45 
 
 
653 aa  213  7.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0496762 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1734  AAA ATPase central domain protein  41.67 
 
 
697 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.168086 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1499  AAA ATPase central domain protein  42.62 
 
 
744 aa  206  5e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2524  AAA ATPase central domain protein  42.97 
 
 
656 aa  206  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5978  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 
1085 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4150  AAA ATPase central domain protein  42.16 
 
 
665 aa  203  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4356  hypothetical protein  41.02 
 
 
652 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00948823  normal  0.0832553 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1500  AAA ATPase central domain protein  41.44 
 
 
639 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1819  ATPase central domain-containing protein  48.72 
 
 
662 aa  198  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.760352  normal  0.277502 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2933  AAA ATPase central domain protein  40.15 
 
 
689 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1753  ATPase central domain-containing protein  46.45 
 
 
450 aa  196  6e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.215663  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1943  AAA ATPase central domain protein  40.57 
 
 
619 aa  195  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00697304  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2258  AAA ATPase central domain protein  40.23 
 
 
680 aa  193  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.226213  hitchhiker  0.00277333 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1893  AAA ATPase central domain protein  42.02 
 
 
698 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103439  normal  0.0680609 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2559  AAA ATPase  39.68 
 
 
444 aa  192  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000494228 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0755  AAA ATPase central domain protein  40.93 
 
 
725 aa  191  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0859  AAA ATPase  40.94 
 
 
634 aa  191  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3811  ATPase central domain-containing protein  41.7 
 
 
788 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.308842 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1133  AAA ATPase, central region  40.52 
 
 
445 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5257  AAA ATPase central domain protein  39.84 
 
 
749 aa  186  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4397  AAA ATPase central domain protein  39.85 
 
 
687 aa  183  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3054  ATPase central domain-containing protein  37.93 
 
 
725 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000821112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1020  AAA ATPase central domain protein  40.32 
 
 
646 aa  179  8e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0938  ATPase central domain-containing protein  42.27 
 
 
671 aa  177  4e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1822  ATPase central domain-containing protein  43.42 
 
 
622 aa  176  6e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5393  AAA ATPase central domain protein  39.83 
 
 
682 aa  175  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3668  AAA ATPase central domain protein  63.49 
 
 
134 aa  172  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2009  AAA ATPase central domain protein  32.44 
 
 
1193 aa  169  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0827  AAA ATPase, central region  44.33 
 
 
697 aa  169  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.934037  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1864  AAA ATPase central domain protein  36.24 
 
 
678 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1549  ATPase, AAA family protein  26.88 
 
 
570 aa  141  3e-32  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.974713  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4054  AAA ATPase, central region  34.75 
 
 
299 aa  139  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0357172 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1579  ATPase, AAA family protein  26.46 
 
 
570 aa  138  2e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1667  ATPase, AAA family protein  27.6 
 
 
569 aa  137  4e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0426  ATPase, AAA family protein  26.23 
 
 
570 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0401  ATPase, AAA family protein  26.24 
 
 
570 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1833  AAA ATPase  30.5 
 
 
578 aa  133  5e-30  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.735306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0853  AAA ATPase  38.04 
 
 
305 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0137  AAA ATPase central domain protein  34.47 
 
 
577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1774  cysteine synthase A  30.04 
 
 
580 aa  124  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0393214  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0869  AAA ATPase family protein  35.64 
 
 
352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000165138  normal  0.784704 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2297  AAA ATPase, central region  40.12 
 
 
228 aa  120  4.9999999999999996e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.754524 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0172  ATPase central domain-containing protein  32.05 
 
 
387 aa  117  5e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1642  AAA-family ATPase  33.19 
 
 
308 aa  105  2e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.722719  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29008  predicted protein  29.35 
 
 
804 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2842  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.98 
 
 
701 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0679  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  33.63 
 
 
718 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.497403  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3503  AAA ATPase, central region  29.46 
 
 
348 aa  102  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.238924 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1882  ATPase central domain-containing protein  29.61 
 
 
617 aa  102  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0025  AAA ATPase central domain protein  34.38 
 
 
443 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1890  AAA ATPase central domain protein  33.16 
 
 
367 aa  100  6e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.439906  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3267  ATPase central domain-containing protein  37.59 
 
 
795 aa  99  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.115516 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0304  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  31.05 
 
 
732 aa  98.2  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1658  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.6 
 
 
737 aa  97.8  4e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.814127 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2089  ATPase central domain-containing protein  31.9 
 
 
428 aa  96.7  7e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0920  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.17 
 
 
723 aa  96.3  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0165  putative ATPase protein  38.64 
 
 
772 aa  95.9  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1301  AAA ATPase central domain protein  31.47 
 
 
493 aa  94.7  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1492  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  32.21 
 
 
753 aa  94.4  4e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0112  ATPase central domain-containing protein  38.93 
 
 
789 aa  94.4  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.181464 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2097  AAA ATPase central domain protein  33.57 
 
 
369 aa  94  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0405  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.71 
 
 
727 aa  94  5e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0846413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0291  AAA ATPase  36.99 
 
 
370 aa  93.6  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00325104  normal 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_21083  predicted protein  26.87 
 
 
806 aa  93.6  7e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3392  Adenosinetriphosphatase  30.28 
 
 
746 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0642335  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1395  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  29.1 
 
 
759 aa  92.8  1e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0522  ATPase central domain-containing protein  31.6 
 
 
391 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0166  AAA ATPase, central region  37.88 
 
 
789 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3431  AAA ATPase central domain protein  31.75 
 
 
477 aa  92.8  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0150  AAA ATPase central domain protein  35.09 
 
 
775 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.172395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0190  ATPase central domain-containing protein  34.63 
 
 
425 aa  92.4  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.384028  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0536  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.88 
 
 
738 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.033227 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0952  proteasome-activating nucleotidase  31.2 
 
 
407 aa  91.3  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1809  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  29 
 
 
736 aa  91.3  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3794  AAA ATPase, central region  36.03 
 
 
369 aa  91.3  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.437647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3114  ATPase central domain-containing protein  36.51 
 
 
698 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.020083  normal 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5123  Adenosinetriphosphatase  29.54 
 
 
739 aa  91.7  3e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.541256  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02750  MMS2, putative  27.47 
 
 
810 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2822  AAA ATPase central domain protein  31.22 
 
 
239 aa  90.9  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1619  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  28.02 
 
 
737 aa  90.9  4e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1958  AAA ATPase central domain protein  32 
 
 
468 aa  90.5  6e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.268075 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7058  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.77 
 
 
704 aa  89.7  8e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7561  AAA family ATPase, CDC48 subfamily  30.43 
 
 
757 aa  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0445379  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>