84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0635 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0635  protein of unknown function DUF1680  100 
 
 		 656 aa  1363    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4996  protein of unknown function DUF1680  45.27 
 
 		 800 aa  541  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0292235  normal  0.0722722 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1696  hypothetical protein  43.12 
 
 		 634 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.793702  normal  0.298068 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7232  protein of unknown function DUF1680  40.75 
 
 		 666 aa  509  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00213031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4720  protein of unknown function DUF1680  41.19 
 
 		 655 aa  503  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.827878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2720  protein of unknown function DUF1680  41.89 
 
 		 640 aa  492  1e-137  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4835  protein of unknown function DUF1680  40.28 
 
 		 648 aa  473  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3957  hypothetical protein  40.54 
 
 		 651 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.565903  normal  0.86497 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2215  protein of unknown function DUF1680  41.69 
 
 		 638 aa  471  1.0000000000000001e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3909  hypothetical protein  38.98 
 
 		 656 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3893  hypothetical protein  40.73 
 
 		 651 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03438  conserved hypothetical protein  38.89 
 
 		 659 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4002  hypothetical protein  40.58 
 
 		 651 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.563325 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3877  hypothetical protein  40.54 
 
 		 651 aa  467  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4064  hypothetical protein  40.61 
 
 		 651 aa  469  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4952  hypothetical protein  38.98 
 
 		 656 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03389  hypothetical protein  38.89 
 
 		 667 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4474  protein of unknown function DUF1680  40.55 
 
 		 636 aa  460  9.999999999999999e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0254713  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2242  protein of unknown function DUF1680  37.57 
 
 		 652 aa  449  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3619  protein of unknown function DUF1680  41.85 
 
 		 640 aa  442  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3930  protein of unknown function DUF1680  38.79 
 
 		 640 aa  441  9.999999999999999e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.693712 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0969  hypothetical protein  38.11 
 
 		 634 aa  438  1e-121  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00300565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2907  protein of unknown function DUF1680  41.35 
 
 		 659 aa  437  1e-121  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0376366  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0502  protein of unknown function DUF1680  37.88 
 
 		 617 aa  432  1e-120  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.171957  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3907  protein of unknown function DUF1680  40.99 
 
 		 648 aa  435  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.373018 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4162  hypothetical protein  41.11 
 
 		 640 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549846 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6525  protein of unknown function DUF1680  37.77 
 
 		 647 aa  428  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0294245 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1126  protein of unknown function DUF1680  37.97 
 
 		 628 aa  425  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2143  hypothetical protein  37.16 
 
 		 648 aa  412  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.56985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0668  hypothetical protein  37.39 
 
 		 620 aa  403  1e-111  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0643  hypothetical protein  37.39 
 
 		 620 aa  405  1e-111  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000119693  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0591  hypothetical protein  36.01 
 
 		 646 aa  396  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000770924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5347  protein of unknown function DUF1680  36.94 
 
 		 686 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.611947  normal  0.22403 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4989  protein of unknown function DUF1680  37.08 
 
 		 647 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0192762 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1535  hypothetical protein  34.98 
 
 		 742 aa  354  2.9999999999999997e-96  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2748  protein of unknown function DUF1680  33.83 
 
 		 684 aa  345  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.0072487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4148  protein of unknown function DUF1680  34.98 
 
 		 652 aa  343  8e-93  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.834889  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2738  protein of unknown function DUF1680  31.95 
 
 		 680 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0391777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1151  protein of unknown function DUF1680  32.27 
 
 		 679 aa  337  3.9999999999999995e-91  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2133  protein of unknown function DUF1680  32.23 
 
 		 673 aa  333  5e-90  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0401427  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05305  DUF1680 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G08910)  33.99 
 
 		 629 aa  330  4e-89  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0057  protein of unknown function DUF1680  33.49 
 
 		 643 aa  324  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0839925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0910  hypothetical protein  31.52 
 
 		 665 aa  322  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.027132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2831  protein of unknown function DUF1680  33.68 
 
 		 629 aa  320  5e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01840  hypothetical protein  34.43 
 
 		 643 aa  313  4.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4097  hypothetical protein  30.04 
 
 		 672 aa  309  1.0000000000000001e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.121081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02820  hypothetical protein  31.42 
 
 		 643 aa  300  5e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.491149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3839  hypothetical protein  33.63 
 
 		 654 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254825  normal  0.0525361 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0407  protein of unknown function DUF1680  30.79 
 
 		 633 aa  279  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0212  hypothetical protein  38.46 
 
 		 397 aa  247  6e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000517482  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1993  hypothetical protein  23.45 
 
 		 795 aa  107  6e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0573537  hitchhiker  0.00434895 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1982  hypothetical protein  23.06 
 
 		 795 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0591519  hitchhiker  0.000518937 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2080  acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  23.34 
 
 		 795 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.254608  hitchhiker  0.00000268125 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3214  hypothetical protein  24.44 
 
 		 844 aa  102  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.77483  normal  0.454399 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0778  Acetyl-CoA carboxylase, biotin carboxylase  25.6 
 
 		 803 aa  102  3e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.163489 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1938  protein of unknown function DUF1680  25.68 
 
 		 711 aa  94.4  6e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0478  protein of unknown function DUF1680  26.92 
 
 		 641 aa  94  8e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.216473  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2153  protein of unknown function DUF1680  23.92 
 
 		 792 aa  93.2  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.299284  normal  0.0915146 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1254  protein of unknown function DUF1680  22.43 
 
 		 684 aa  92.8  2e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.831647  normal  0.201869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1422  protein of unknown function DUF1680  25.34 
 
 		 760 aa  90.5  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.428296  normal  0.497833 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0320  hypothetical protein  25.37 
 
 		 607 aa  90.1  1e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.280201  normal  0.603461 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3876  hypothetical protein  23.71 
 
 		 765 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0164  hypothetical protein  23.23 
 
 		 602 aa  88.6  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.935603  normal  0.0626406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1728  protein of unknown function DUF1680  23.78 
 
 		 675 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.670849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01470  hypothetical protein  27.03 
 
 		 783 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3545  hypothetical protein  22.26 
 
 		 663 aa  84  0.000000000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.550366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1342  hypothetical protein  22.11 
 
 		 669 aa  82  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4617  protein of unknown function DUF1680  23.13 
 
 		 1025 aa  80.5  0.00000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0602011  normal  0.370298 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2836  protein of unknown function DUF1680  27.21 
 
 		 614 aa  78.6  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3107  protein of unknown function DUF1680  23.78 
 
 		 771 aa  77.8  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0859472  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0089  protein of unknown function DUF1680  21.88 
 
 		 677 aa  76.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1236  protein of unknown function DUF1680  23.1 
 
 		 955 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00269962  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0636  protein of unknown function DUF1680  24.85 
 
 		 667 aa  74.7  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.788531 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2035  protein of unknown function DUF1680  22.88 
 
 		 678 aa  72  0.00000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4712  protein of unknown function DUF1680  26.36 
 
 		 881 aa  70.1  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0997  protein of unknown function DUF1680  20.69 
 
 		 597 aa  70.5  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4363  protein of unknown function DUF1680  22.52 
 
 		 963 aa  67.8  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0125989  normal  0.151908 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0062  protein of unknown function DUF1680  23.45 
 
 		 596 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.560227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2967  protein of unknown function DUF1680  22.22 
 
 		 838 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000186086  hitchhiker  0.000639223 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  25.25 
 
 		 846 aa  58.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1194  protein of unknown function DUF1680  23.89 
 
 		 749 aa  53.5  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  normal  0.159601 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11690  hypothetical protein  23.65 
 
 		 752 aa  52.8  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1480  protein of unknown function DUF1680  21.9 
 
 		 632 aa  48.9  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.311718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0363  protein of unknown function DUF1680  22.66 
 
 		 744 aa  47.4  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>