More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0624 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  100 
 
 
570 aa  1187    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  56.65 
 
 
579 aa  682    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5642  alpha amylase catalytic region  52.32 
 
 
540 aa  619  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000211534  normal  0.444192 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2083  alpha amylase catalytic region  53.33 
 
 
541 aa  621  1e-176  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.583803 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  53.99 
 
 
553 aa  617  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8020  trehalose synthase  52.69 
 
 
553 aa  618  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  53.8 
 
 
553 aa  611  1e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  50.56 
 
 
554 aa  586  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2621  alpha amylase catalytic region  51.01 
 
 
554 aa  580  1e-164  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0541919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5237  alpha amylase catalytic region  51.67 
 
 
554 aa  581  1e-164  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0387802 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0315  alpha amylase catalytic region  48.43 
 
 
555 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.906298  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4604  alpha amylase catalytic region  50.83 
 
 
554 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0894643  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1579  alpha amylase catalytic region  48.16 
 
 
543 aa  542  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3928  alpha amylase catalytic region  44.38 
 
 
544 aa  519  1e-146  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  42.36 
 
 
552 aa  479  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0937  alpha amylase domain-containing protein  43.04 
 
 
548 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2596  alpha amylase, catalytic region  42.86 
 
 
558 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  41.93 
 
 
548 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3708  alpha amylase catalytic region  42.22 
 
 
521 aa  466  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3079  alpha amylase catalytic region  40.45 
 
 
556 aa  463  1e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.493465  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3723  alpha amylase, catalytic region  41.51 
 
 
559 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0922665 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4981  alpha amylase, catalytic region  41.44 
 
 
559 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3225  alpha amylase catalytic region  40.51 
 
 
564 aa  447  1.0000000000000001e-124  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.262228  hitchhiker  0.0000603449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4598  alpha amylase, catalytic region  41.25 
 
 
559 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.541891  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4088  alpha amylase, catalytic region  42.7 
 
 
563 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4686  alpha amylase, catalytic region  41.25 
 
 
559 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  41.93 
 
 
548 aa  444  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3686  alpha amylase, catalytic region  41.53 
 
 
540 aa  441  9.999999999999999e-123  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12163  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  41.96 
 
 
1100 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  42.15 
 
 
1115 aa  434  1e-120  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  40.93 
 
 
1088 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  41.11 
 
 
1088 aa  434  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1172  alpha amylase domain-containing protein  41.87 
 
 
1095 aa  429  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  40.73 
 
 
1102 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  42.8 
 
 
1123 aa  431  1e-119  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  40.92 
 
 
1102 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  42.06 
 
 
551 aa  428  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  40.55 
 
 
1102 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1404  Alpha amylase, catalytic region  42.8 
 
 
1100 aa  423  1e-117  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  39.23 
 
 
591 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5383  trehalose synthase  40.62 
 
 
1093 aa  422  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0116468  normal  0.915163 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  42.51 
 
 
1101 aa  422  1e-117  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  40.52 
 
 
553 aa  423  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  40.26 
 
 
682 aa  420  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  40.22 
 
 
1094 aa  420  1e-116  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  41.23 
 
 
1088 aa  419  1e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  41.4 
 
 
1093 aa  421  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  41.98 
 
 
1121 aa  421  1e-116  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  40.91 
 
 
1108 aa  419  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  41.23 
 
 
1088 aa  419  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0621  trehalose synthase/putative maltokinase  41.64 
 
 
1131 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  41.08 
 
 
1152 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  43.2 
 
 
1111 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4164  trehalose synthase  41.3 
 
 
1100 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  43.17 
 
 
1108 aa  417  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6322  putative trehalose synthase  40.51 
 
 
1101 aa  417  9.999999999999999e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.319777  normal  0.483748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  40.28 
 
 
588 aa  416  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  40.55 
 
 
577 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  42.57 
 
 
1110 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  41.63 
 
 
551 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1567  trehalose synthase/putative maltokinase  41.64 
 
 
1131 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  39.19 
 
 
1088 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  41.15 
 
 
1113 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  41.55 
 
 
556 aa  416  9.999999999999999e-116  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  41.26 
 
 
1137 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4038  alpha amylase catalytic region  40.92 
 
 
544 aa  418  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0583407  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  40.33 
 
 
1092 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1544  alpha-glucosidase  41.64 
 
 
1131 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  40.07 
 
 
556 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  43.88 
 
 
1121 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  39.45 
 
 
601 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  39.66 
 
 
1085 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1340  trehalose synthase/putative maltokinase  41.64 
 
 
1131 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0534  trehalose synthase/putative maltokinase  41.64 
 
 
1131 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0821  alpha amylase family protein  41.45 
 
 
1131 aa  414  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.145364  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  39.2 
 
 
606 aa  415  1e-114  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4228  alpha amylase domain-containing protein  39.68 
 
 
1121 aa  413  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  40.04 
 
 
1113 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  39.96 
 
 
553 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  40.15 
 
 
572 aa  414  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1883  trehalose synthase  38.97 
 
 
1100 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.12501  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  40.56 
 
 
1099 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  39.52 
 
 
567 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3483  trehalose synthase-like  40 
 
 
1100 aa  415  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  41.11 
 
 
1137 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  41.26 
 
 
1137 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  38.83 
 
 
610 aa  413  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  40.67 
 
 
1088 aa  414  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  41.26 
 
 
1137 aa  415  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  41 
 
 
1114 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  41.26 
 
 
1137 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  39.96 
 
 
572 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3106  trehalose synthase  40.45 
 
 
535 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0151531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  39.03 
 
 
1104 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 
1138 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  41.37 
 
 
1116 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2862  putative trehalose synthase  40.71 
 
 
1154 aa  410  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  41.87 
 
 
1130 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  40.97 
 
 
1164 aa  411  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  41.37 
 
 
1116 aa  409  1e-113  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>