260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0445 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0445  sulfatase  100 
 
 
611 aa  1254    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00137642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2548  sulfatase  34.99 
 
 
621 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1736  sulfatase  36.41 
 
 
597 aa  366  1e-100  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_002950  PG2021  hypothetical protein  35.81 
 
 
643 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.112326 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3456  sulfatase  27.7 
 
 
657 aa  216  9.999999999999999e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.383156  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4129  sulfatase  29.84 
 
 
654 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4333  sulfatase  29.66 
 
 
654 aa  212  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4201  sulfatase  29.48 
 
 
654 aa  211  4e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000207245  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0154  sulfatase  27.1 
 
 
656 aa  210  7e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0174  sulfatase  29.46 
 
 
670 aa  209  2e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0138  sulfatase  29.38 
 
 
654 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000529062  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3808  sulfatase  28.79 
 
 
654 aa  207  5e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5023  sulfatase  28.69 
 
 
646 aa  206  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0910313  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3884  sulfatase  28.4 
 
 
654 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003619  phosphoglycerol transferase I  26.67 
 
 
649 aa  203  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.878946  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0432  phosphoglycerol transferase  28.29 
 
 
653 aa  203  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.504655  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3562  sulfatase  26.56 
 
 
682 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4628  sulfatase  28.11 
 
 
660 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3632  sulfatase  28.68 
 
 
662 aa  199  9e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1979  sulfatase  26.45 
 
 
663 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2716  sulfatase domain-containing protein  26.41 
 
 
665 aa  199  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.324091  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1915  sulfatase  26.62 
 
 
654 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.256965  normal  0.471265 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02464  phosphoglycerol transferase  25.55 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0240  sulfatase  28.38 
 
 
678 aa  195  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3507  sulfatase  26.89 
 
 
646 aa  193  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3803  sulfatase  27.12 
 
 
654 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4012  sulfatase  27.82 
 
 
654 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4108  sulfatase  26.17 
 
 
697 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.526454 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1399  sulfatase  25.49 
 
 
670 aa  180  8e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1838  hypothetical protein  24.39 
 
 
685 aa  179  1e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.8565  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3872  sulfatase  24.55 
 
 
685 aa  178  2e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.292904  normal  0.0933221 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1447  sulfatase  23.95 
 
 
690 aa  177  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.189062 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2948  hypothetical protein  27.35 
 
 
633 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.146367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1416  sulfatase  24.51 
 
 
685 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.934087  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2056  hypothetical protein  25.49 
 
 
695 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.814835  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0320  sulfatase  31.91 
 
 
640 aa  172  1e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1865  sulfatase  24.67 
 
 
695 aa  171  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119974  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1753  sulfatase  26 
 
 
696 aa  170  6e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.100359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3618  sulfatase  25.81 
 
 
633 aa  170  8e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4881  sulfatase  26.86 
 
 
695 aa  168  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.652285 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25880  Sulfatase protein  26.02 
 
 
717 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3858  sulfatase  28.25 
 
 
647 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.499421  normal  0.910234 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42670  hypothetical protein  23.8 
 
 
700 aa  167  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4499  sulfatase  27.48 
 
 
649 aa  166  9e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000368912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3581  hypothetical protein  23.99 
 
 
700 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.377432  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3723  sulfatase  25.5 
 
 
633 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2475  sulfatase  26.7 
 
 
652 aa  165  3e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.84195 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1932  sulfatase  26.11 
 
 
666 aa  161  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0319  sulfatase  25.99 
 
 
646 aa  160  7e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0526  sulfatase  26.38 
 
 
633 aa  155  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1625  sulfatase  30.15 
 
 
635 aa  155  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00413884  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0080  sulfatase  31.31 
 
 
634 aa  155  2e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.204618  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2974  hypothetical protein  26.2 
 
 
550 aa  150  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.113702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4465  sulfatase  29.97 
 
 
656 aa  150  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2881  sulfatase  25.59 
 
 
712 aa  150  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.242387  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1564  hypothetical protein  27.27 
 
 
651 aa  148  2.0000000000000003e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1405  sulfatase  33.45 
 
 
712 aa  149  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1118  sulfatase  32.35 
 
 
628 aa  147  5e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3051  sulfatase  23.59 
 
 
652 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.535064  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3537  sulfatase  27.96 
 
 
650 aa  144  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1996  sulphatase  28.72 
 
 
628 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.745737 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2377  sulfatase  25.13 
 
 
643 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0140  hypothetical protein  29.1 
 
 
633 aa  137  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.597793  normal  0.930623 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3855  sulfatase  25.14 
 
 
666 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.593214  normal  0.690048 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3271  sulfatase  26.33 
 
 
642 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.269035 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1353  sulfatase  26.32 
 
 
639 aa  109  1e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1069  sulfatase  25.84 
 
 
641 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0999  sulfatase  26.22 
 
 
593 aa  106  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.477664  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0309  sulfatase  28.67 
 
 
630 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1131  sulfatase  26.61 
 
 
593 aa  103  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1100  sulfatase  24.17 
 
 
609 aa  96.3  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2207  sulfatase  23.54 
 
 
627 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0371  sulfatase  26.1 
 
 
625 aa  95.1  3e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000394083  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1028  sulfatase  27.52 
 
 
640 aa  95.1  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0869325  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2501  sulfatase  25 
 
 
629 aa  95.1  4e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0062  sulfatase  24.62 
 
 
629 aa  93.2  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000880147  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0377  sulfatase  21.83 
 
 
671 aa  91.3  5e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000264889  hitchhiker  0.0000000000000148489 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1015  sulfatase  24.93 
 
 
588 aa  90.5  9e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0174  sulfatase  28.28 
 
 
630 aa  87  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.326693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3211  sulfatase  21.59 
 
 
612 aa  87  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.139741  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0584  sulfatase family protein  23.11 
 
 
602 aa  86.7  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0369  sulfatase  25.83 
 
 
628 aa  85.5  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00151431  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1340  sulfatase  22.59 
 
 
628 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.5616  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0570  sulfatase family protein  23.11 
 
 
602 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1139  sulfatase  22.22 
 
 
628 aa  84.3  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1327  sulfatase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1300  sulfatase; phosphoglycerol transferase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1301  sulfatase; phosphoglycerol transferase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1508  sulfatase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00221211 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1436  sulfatase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.567309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3874  sulfatase  23.86 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1576  sulfatase  25.44 
 
 
628 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1538  sulfatase  25.44 
 
 
628 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1899  sulfatase family protein  23.45 
 
 
677 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1470  sulfatase  23.53 
 
 
628 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3864  sulfatase  24.92 
 
 
639 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00973329  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5081  sulfatase  25.21 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.140992  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4913  sulfatase  25.21 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000919892  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5470  sulfatase  25.21 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000729601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5321  sulfatase  24.57 
 
 
642 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.10214e-55 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>