More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0404 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0404  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 432 aa  864    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.90763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1023  major facilitator superfamily MFS_1  72.37 
 
 		 431 aa  642    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0652623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3956  major facilitator superfamily MFS_1  64.05 
 
 		 449 aa  569  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.621866  normal  0.612872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1244  major facilitator superfamily MFS_1  62.38 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.477377  normal  0.0341715 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3116  major facilitator superfamily MFS_1  61.92 
 
 		 430 aa  568  1e-160  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000115925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2843  major facilitator superfamily MFS_1  64.47 
 
 		 426 aa  565  1e-160  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.088157  normal  0.111913 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1017  major facilitator superfamily MFS_1  62.97 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.451459  normal  0.743333 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6829  major facilitator superfamily MFS_1  60.22 
 
 		 454 aa  549  1e-155  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5749  major facilitator superfamily MFS_1  59.39 
 
 		 436 aa  535  1e-151  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6194  major facilitator superfamily MFS_1  53.47 
 
 		 453 aa  452  1.0000000000000001e-126  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2219  major facilitator superfamily MFS_1  49.64 
 
 		 441 aa  448  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.200056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4070  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3451  major facilitator transporter  50.95 
 
 		 430 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.225334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2718  major facilitator transporter  50.24 
 
 		 430 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3400  major facilitator transporter  50.47 
 
 		 430 aa  423  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5234  major facilitator transporter  50.71 
 
 		 430 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3510  major facilitator transporter  49.17 
 
 		 427 aa  422  1e-117  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.935373  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5166  major facilitator transporter  50.59 
 
 		 429 aa  421  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.733081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1766  major facilitator transporter  47.76 
 
 		 424 aa  414  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.601014  normal  0.308968 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03865  hexuranate transporter  47.04 
 
 		 433 aa  411  1e-113  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5675  major facilitator transporter  48.94 
 
 		 429 aa  409  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4271  major facilitator transporter  45.34 
 
 		 468 aa  394  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0659968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4307  major facilitator transporter  45.28 
 
 		 430 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.622363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6282  major facilitator superfamily MFS_1  44.37 
 
 		 429 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5030  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 441 aa  341  1e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.580497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1058  major facilitator superfamily MFS_1  42.35 
 
 		 449 aa  335  1e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.494018  normal  0.557281 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4265  major facilitator transporter  42.46 
 
 		 489 aa  335  1e-90  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.762522  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4907  major facilitator transporter  39.57 
 
 		 445 aa  327  3e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4288  major facilitator transporter  42.23 
 
 		 457 aa  325  7e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51130  MFS (major facilitator superfamily) transporter  40.57 
 
 		 439 aa  325  1e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.845287  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3045  major facilitator transporter  42.79 
 
 		 435 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.116198 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2345  transporter, putative  39.1 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2604  major facilitator family transporter  39.38 
 
 		 480 aa  323  3e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0399959 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2272  major facilitator superfamily MFS_1  41.72 
 
 		 479 aa  323  5e-87  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.972023  decreased coverage  0.00181869 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3121  major facilitator transporter  39.44 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02990  putative MFS transporter  39.62 
 
 		 441 aa  322  7e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00105539 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2129  major facilitator transporter  38.86 
 
 		 442 aa  319  7e-86  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.526702  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3239  major facilitator transporter  38.97 
 
 		 441 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.935103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0325  MFS family transporter  39.38 
 
 		 442 aa  317  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.334434  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02062  putative transporter transmembrane protein  41.53 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000104941  normal  0.781434 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3179  major facilitator transporter  38.42 
 
 		 432 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.107398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1666  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 411 aa  295  8e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.493096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4873  major facilitator transporter  40.35 
 
 		 501 aa  294  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.103797  normal  0.996153 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2910  major facilitator transporter  35.75 
 
 		 441 aa  280  3e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3106  major facilitator transporter  35.43 
 
 		 428 aa  273  5.000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2448  major facilitator transporter  34.71 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.581947  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2068  major facilitator superfamily MFS_1  38.32 
 
 		 434 aa  266  5.999999999999999e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3282  putative hexuronate transporter  36.7 
 
 		 424 aa  258  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0854544  normal  0.252683 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4445  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0453314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4579  major facilitator superfamily MFS_1  32.71 
 
 		 433 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.571903 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1871  major facilitator transporter  35.29 
 
 		 423 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00153919  normal  0.351915 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3658  major facilitator transporter  34.55 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1012  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 430 aa  242  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.318414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3128  major facilitator transporter  34.92 
 
 		 435 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0258  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 440 aa  240  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4383  major facilitator superfamily MFS_1  34.77 
 
 		 420 aa  239  5.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00326845  normal  0.997814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0947  major facilitator superfamily MFS_1  34.57 
 
 		 430 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.35328  normal  0.0858315 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0834  hexuronate transporter transmembrane protein  33.64 
 
 		 435 aa  239  6.999999999999999e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00560856 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1170  major facilitator superfamily MFS_1  37.27 
 
 		 425 aa  236  8e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0610  major facilitator transporter  34.75 
 
 		 430 aa  233  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.400877  normal  0.0253848 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3670  major facilitator transporter  33.5 
 
 		 411 aa  233  6e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04071  Hexuronate transporter  32.64 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04033  hypothetical protein  32.64 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3386  hexuronate transporter  31.28 
 
 		 434 aa  230  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.333246  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11473  putative hexuronate transport protein (MFS family)  32.79 
 
 		 424 aa  230  5e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.485615  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3479  hexuronate transporter  31.05 
 
 		 434 aa  229  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.474263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3306  hexuronate transporter  31.28 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.123622  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3316  hexuronate transporter  31.28 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.433687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3380  hexuronate transporter  31.28 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.586322  normal  0.6284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4207  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0961062  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4159  major facilitator transporter  35.14 
 
 		 423 aa  229  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.718979  decreased coverage  0.00263409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1080  putative hexuronate transporter transmembrane protein  33.87 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.503694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3566  major facilitator transporter  35.05 
 
 		 443 aa  227  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000684429  normal  0.364964 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3357  major facilitator transporter  34.91 
 
 		 423 aa  226  6e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0473601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4048  major facilitator transporter  34.67 
 
 		 423 aa  225  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0187179  normal  0.633628 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4247  major facilitator transporter  33.01 
 
 		 429 aa  222  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0745  d-galactonate transporter  32.12 
 
 		 433 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0528  d-galactonate transporter  32.64 
 
 		 433 aa  219  7.999999999999999e-56  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.888492  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4322  d-galactonate transporter  32.21 
 
 		 432 aa  219  1e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.743401 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0490  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.8 
 
 		 433 aa  217  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.40951e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1105  putative hexuronate MFS transporter ExuT  30.8 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.0000000000998284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0553  d-galactonate transporter  30.8 
 
 		 434 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.351291  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3512  d-galactonate transporter  31.47 
 
 		 433 aa  216  5e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1806  major facilitator superfamily metabolite(phthalate/hexuronate)/H(+) symporter  33.1 
 
 		 433 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0119934 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3529  hexuronate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  215  9.999999999999999e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02962  hexuronate transporter  33.59 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3561  putative hexuronate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02913  hypothetical protein  33.59 
 
 		 472 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3386  d-galactonate transporter  30.79 
 
 		 434 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0456  major facilitator superfamily MFS_1  32.45 
 
 		 415 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.317164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4857  major facilitator superfamily MFS_1  32.55 
 
 		 430 aa  209  5e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0133188  normal  0.643957 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3385  hexuronate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  208  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2627  major facilitator superfamily MFS_1  32.14 
 
 		 436 aa  208  1e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0935  major facilitator transporter  30.93 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.881993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3547  d-galactonate transporter  32.73 
 
 		 474 aa  207  2e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.48586 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0608  d-galactonate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3276  putative hexuronate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4408  hexuronate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.591703 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0607  d-galactonate transporter  33.59 
 
 		 432 aa  207  3e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0978  major facilitator transporter  34.19 
 
 		 435 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>