39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0308 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0308  GDSL family lipase  100 
 
 
207 aa  434  1e-121  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.449597  normal  0.278541 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0219  hypothetical protein  47.42 
 
 
197 aa  190  1e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0736207  normal  0.977558 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2123  GDSL family lipase  41.5 
 
 
216 aa  169  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1746  GDSL family lipase  41.92 
 
 
238 aa  165  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.761874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1357  lipolytic protein G-D-S-L family  38.95 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0467272  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1951  GDSL family lipase  36.56 
 
 
268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00720297 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0355  hypothetical protein  37.93 
 
 
248 aa  129  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2921  cyclic nucleotide-binding protein  36.08 
 
 
871 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2575  lipolytic protein G-D-S-L family  38.24 
 
 
280 aa  118  6e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4894  hypothetical protein  35.29 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.323139 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0654  lipolytic protein G-D-S-L family  29.74 
 
 
233 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.428767  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5066  lipolytic protein G-D-S-L family  29.82 
 
 
217 aa  101  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0170642  normal  0.012377 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4335  hypothetical protein  31.96 
 
 
230 aa  95.9  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.400802 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0446  lipolytic protein G-D-S-L family  29.69 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0027  Esterase/lipase-like protein  29.23 
 
 
509 aa  89  5e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0272532  normal  0.692184 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1383  hypothetical protein  28.64 
 
 
240 aa  87.8  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04655  hypothetical protein  34.88 
 
 
167 aa  74.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157636  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4695  GDSL family lipase  27.69 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.609852  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2125  GDSL family lipase  24.23 
 
 
261 aa  61.6  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.849583  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30260  predicted protein  24.67 
 
 
235 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.804588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1258  G-D-S-L family lipolytic protein  27.88 
 
 
274 aa  57.8  0.0000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4478  lipolytic enzyme, G-D-S-L  27.49 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.301699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3012  lipolytic protein  29.45 
 
 
383 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0718  putative platelet-activating factor acetylhydrolase IB gamma subunit  23.53 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.279585  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2957  lipolytic protein  30.52 
 
 
275 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.903412  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01237  acetylhydrolase  26 
 
 
479 aa  51.2  0.00001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.507757  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1104  platelet activating factor, putative  24.12 
 
 
204 aa  48.9  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04656  hypothetical protein  42.5 
 
 
48 aa  49.3  0.00005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15268  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2668  GDSL family lipase  25.52 
 
 
424 aa  47.8  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0125  lipolytic protein G-D-S-L family  26.32 
 
 
249 aa  46.6  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.299252  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0641  hypothetical protein  24.19 
 
 
246 aa  45.1  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.726256 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2205  lipolytic protein G-D-S-L family  25.97 
 
 
241 aa  44.7  0.0009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0428962 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2563  lipolytic protein G-D-S-L family  26.47 
 
 
261 aa  43.5  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3780  lipolytic enzyme, G-D-S-L  20 
 
 
221 aa  43.9  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3427  lipase/acylhydrolase domain-containing protein  23.78 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1829  esterase  23.6 
 
 
188 aa  42.7  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0305538  normal  0.13667 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3119  lipolytic protein G-D-S-L family  27.03 
 
 
227 aa  42.7  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0965245  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2141  GDSL family lipase  25.14 
 
 
189 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.953926  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1053  GDSL family lipase  20.92 
 
 
230 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>