150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0277 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 302 aa  627  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  60.33 
 
 		 305 aa  398  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  56.4 
 
 		 309 aa  372  1e-102  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  53.66 
 
 		 315 aa  323  2e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  42.24 
 
 		 299 aa  266  4e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  41.2 
 
 		 321 aa  265  5e-70  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  36.84 
 
 		 297 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  41.06 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  36.49 
 
 		 313 aa  182  6e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  32.89 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  32.3 
 
 		 296 aa  160  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  32.85 
 
 		 315 aa  158  1e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.47 
 
 		 315 aa  155  9e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  31.8 
 
 		 305 aa  152  5.9999999999999996e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  29.71 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  26.99 
 
 		 314 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  30.07 
 
 		 295 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  29.82 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  33.99 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  30.03 
 
 		 308 aa  146  4.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  28.47 
 
 		 300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  29.72 
 
 		 308 aa  146  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  27.04 
 
 		 335 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  29.02 
 
 		 286 aa  142  5e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  28.77 
 
 		 305 aa  142  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  29.17 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  28.78 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  28.08 
 
 		 308 aa  140  3e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  28.42 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  28.57 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  28.62 
 
 		 308 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  25.96 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  34.78 
 
 		 287 aa  134  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  28.52 
 
 		 295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  29.43 
 
 		 308 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  27.62 
 
 		 299 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.29 
 
 		 309 aa  130  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.04 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  27.37 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  27.65 
 
 		 305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  30.33 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  26.37 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  24.81 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  24.56 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  29.5 
 
 		 306 aa  125  8.000000000000001e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  25.8 
 
 		 291 aa  124  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  28.42 
 
 		 309 aa  123  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  28.16 
 
 		 307 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3315  hypothetical protein  29.56 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.386659 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  28.52 
 
 		 308 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  24.21 
 
 		 299 aa  122  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  26.81 
 
 		 303 aa  122  7e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  29.74 
 
 		 318 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  29.12 
 
 		 321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  27.04 
 
 		 335 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  29.48 
 
 		 315 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  33.47 
 
 		 289 aa  119  7.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  30.38 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  31.68 
 
 		 293 aa  118  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0922  hypothetical protein  28.06 
 
 		 307 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  27.82 
 
 		 300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5402  hypothetical protein  26.94 
 
 		 306 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.145488  normal  0.0274711 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  27.69 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  27.42 
 
 		 306 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.62 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  24.74 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  24.74 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  29 
 
 		 303 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  24.74 
 
 		 304 aa  113  3e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  26.54 
 
 		 298 aa  114  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  23.61 
 
 		 312 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.16 
 
 		 286 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  24.57 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  24.57 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4016  hypothetical protein  25.87 
 
 		 296 aa  112  6e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  25.43 
 
 		 304 aa  112  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  28.87 
 
 		 310 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  25.27 
 
 		 307 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1996  protein of unknown function UPF0187  27.53 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.16551  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  24.22 
 
 		 321 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0993  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000360463  normal  0.124336 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5562  membrane protein-like protein  25.23 
 
 		 333 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7068  hypothetical protein  26.57 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.85763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  25.7 
 
 		 303 aa  108  8.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0121  protein of unknown function UPF0187  26.71 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1420  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6409  hypothetical protein  26.2 
 
 		 306 aa  106  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.621107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3117  protein of unknown function UPF0187  29.07 
 
 		 315 aa  106  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  28.23 
 
 		 304 aa  106  4e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5683  hypothetical protein  25.83 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.326794 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6441  hypothetical protein  25.83 
 
 		 306 aa  106  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.549137 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5790  membrane protein-like protein  24.77 
 
 		 333 aa  105  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162832  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6970  hypothetical protein  25.09 
 
 		 306 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.780234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  30.18 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>