More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0204 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0204  transcriptional regulator, AsnC family  100 
 
 		 153 aa  315  2e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.138221  normal  0.141193 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2901  transcriptional regulator, AsnC family  58.62 
 
 		 154 aa  188  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.225499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0021  AsnC family transcriptional regulator  55.92 
 
 		 152 aa  182  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2805  transcriptional regulator, AsnC family  46 
 
 		 158 aa  144  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2132  AsnC family transcriptional regulator  45.7 
 
 		 152 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.83383  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3319  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1520  AsnC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 153 aa  137  4.999999999999999e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0172  transcriptional regulator, AsnC family  42.95 
 
 		 172 aa  135  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1628  transcriptional regulator, AsnC family  45.33 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6858  transcriptional regulator, AsnC family  45.14 
 
 		 167 aa  132  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0772  AsnC family transcriptional regulator  42.28 
 
 		 156 aa  131  3e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.148197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 153 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1372  regulatory protein AsnC/Lrp family  40.41 
 
 		 155 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2829  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 153 aa  129  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0797  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 165 aa  127  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163413  normal  0.817989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0868  transcriptional regulator, AsnC family  39.6 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.67384  normal  0.614838 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2217  AsnC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0872223  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  40.67 
 
 		 157 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2213  regulatory proteins, AsnC/Lrp  38.93 
 
 		 153 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214008  normal  0.442221 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4559  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137777  normal  0.0927691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3252  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 153 aa  124  5e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  39.33 
 
 		 156 aa  124  6e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 180 aa  124  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2574  AsnC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0518335  normal  0.327443 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3387  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3040  transcriptional regulator, AsnC family  41.29 
 
 		 162 aa  124  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1045  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 155 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.596576  normal  0.823935 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0722  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 152 aa  122  1e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1713  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.911969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  39.07 
 
 		 156 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1530  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 157 aa  123  1e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.14965  normal  0.648234 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2554  regulatory protein AsnC/Lrp family  37.67 
 
 		 154 aa  122  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.240558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2126  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 167 aa  122  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000250913  normal  0.0385806 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  38.67 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2299  AsnC family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 156 aa  122  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00073028 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3217  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4066  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2441  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 152 aa  122  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4300  AsnC family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 160 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  38.93 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  39.33 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05245  putative AsnC-family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 157 aa  121  3e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2377  AsnC family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 152 aa  121  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.408866 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2305  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3419  AsnC family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 154 aa  121  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.729086 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2981  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.160309  hitchhiker  0.00904587 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2324  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000733571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2012  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00000455922  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2155  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000584376  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3837  AsnC family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 150 aa  121  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.261619  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 153 aa  121  4e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2216  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000025021  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3379  AsnC family transcriptional regulator  42.21 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2190  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000625254  normal  0.0646213 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1962  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000351105  normal  0.663498 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2014  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000513166  normal  0.0218506 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2049  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000202075  hitchhiker  0.00142974 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2863  leucine-responsive regulatory protein  38.93 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.437935  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2973  leucine-responsive regulatory protein  38.93 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1657  leucine-responsive regulatory protein  38.93 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2924  leucine-responsive regulatory protein  38.93 
 
 		 162 aa  120  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.518607  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3102  transcription regulator protein  40 
 
 		 162 aa  120  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.327288  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2484  leucine-responsive transcriptional regulator  38.93 
 
 		 167 aa  120  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000151917  unclonable  0.000000015798 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3629  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.217189 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1771  leucine-responsive transcriptional regulator  39.6 
 
 		 167 aa  120  7e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000022114  normal  0.0203642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1002  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.782239 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5271  leucine-responsive regulatory protein  37.58 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5323  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0644813 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3216  AsnC family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 163 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0199  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00074926 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4195  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.203034  normal  0.136531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5181  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.73265  normal  0.0995684 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3606  transcriptional regulator of AsnC/Lrp family protein  38.26 
 
 		 155 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1324  AsnC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 150 aa  120  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.719808  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1059  AsnC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 159 aa  119  9.999999999999999e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0704538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3718  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.531548 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2390  transcriptional regulator, AsnC family  38.93 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4306  AsnC family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.269184 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2025  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000839293  unclonable  0.00000134482 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0234  regulatory proteins, AsnC/Lrp  36.24 
 
 		 162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2546  AsnC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 167 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0741  AsnC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.703113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1794  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000016537  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1986  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.64528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5482  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0784989  normal  0.0295853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0927  leucine-responsive regulatory DNA-binding transcription regulator protein  38.1 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.276629 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3993  transcriptional regulator, AsnC family  39.44 
 
 		 155 aa  118  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1640  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 154 aa  118  3e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2261  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0124412  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1802  transcriptional regulator, AsnC family  40.69 
 
 		 166 aa  118  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.93685  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4561  AsnC family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 156 aa  118  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00127893  normal  0.163186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1718  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2361  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 164 aa  118  3e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.84534  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2234  leucine-responsive transcriptional regulator  38.26 
 
 		 167 aa  118  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000872232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1785  AsnC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 171 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.121731 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>