122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0177 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 446 aa  899    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0175  polysaccharide biosynthesis protein  28.99 
 
 		 449 aa  132  9e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  27.2 
 
 		 461 aa  122  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3713  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 445 aa  86.7  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.336357  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 		 490 aa  80.9  0.00000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  25.52 
 
 		 475 aa  77.8  0.0000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  25.29 
 
 		 489 aa  75.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  25.32 
 
 		 504 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0416  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 506 aa  65.5  0.000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.484223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  30.41 
 
 		 444 aa  65.1  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  22.62 
 
 		 492 aa  63.5  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  22.37 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  22.37 
 
 		 492 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  22.37 
 
 		 492 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  22.37 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  22.11 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  22.37 
 
 		 492 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 504 aa  60.8  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  22.37 
 
 		 507 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4577  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 452 aa  60.5  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  22.11 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  27.04 
 
 		 487 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  26.95 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0032  polysaccharide biosynthesis protein  23.87 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.166793 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0391  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1236  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 		 482 aa  57.8  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.286439 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  22.45 
 
 		 486 aa  56.6  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 487 aa  56.6  0.0000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  22.03 
 
 		 423 aa  55.8  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  26.25 
 
 		 449 aa  56.6  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 503 aa  56.2  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0665  polysaccharide biosynthesis protein  28.89 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0667  polysaccharide biosynthesis protein  25.34 
 
 		 476 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.529656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 		 495 aa  55.5  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  22.57 
 
 		 423 aa  55.5  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 510 aa  55.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 510 aa  55.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1178  hypothetical protein  22.43 
 
 		 429 aa  55.5  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  20.97 
 
 		 492 aa  54.7  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  28.31 
 
 		 421 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  23.5 
 
 		 480 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0998  hypothetical protein  25.14 
 
 		 455 aa  53.9  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.238749  normal  0.880315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  23.33 
 
 		 489 aa  53.5  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2862  polysaccharide biosynthesis protein  23.05 
 
 		 500 aa  53.5  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  25.28 
 
 		 433 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.71 
 
 		 435 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1142  PST family polysaccharide transporter  26.51 
 
 		 475 aa  52.8  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000134656  hitchhiker  0.0000175319 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  23.88 
 
 		 490 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  23.44 
 
 		 493 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1920  polysaccharide biosynthesis protein  23.02 
 
 		 484 aa  52.8  0.00001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0707623  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3669  polysaccharide biosynthesis protein  23 
 
 		 501 aa  52.8  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.77196  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  21.43 
 
 		 517 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  19.08 
 
 		 477 aa  52  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  22.8 
 
 		 575 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2188  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 446 aa  51.6  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1759  polysaccharide biosynthesis protein  22.66 
 
 		 423 aa  51.6  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  20.32 
 
 		 512 aa  51.6  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1696  polysaccharide biosynthesis protein  24 
 
 		 454 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.235327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  25 
 
 		 449 aa  50.4  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2844  polysaccharide biosynthesis protein  21.76 
 
 		 457 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 		 470 aa  50.1  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4040  polysaccharide biosynthesis protein  27.35 
 
 		 444 aa  50.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.519664  normal  0.589796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  26.01 
 
 		 482 aa  50.1  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  27.03 
 
 		 477 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  26.11 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  27.11 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08851  hypothetical protein  27.59 
 
 		 484 aa  49.7  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.227884  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  23.93 
 
 		 493 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  24.73 
 
 		 471 aa  48.9  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  21.6 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1361  polysaccharide biosynthesis protein  22.61 
 
 		 413 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.483225  unclonable  0.0000000256808 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  19.69 
 
 		 503 aa  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0469  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00384316  hitchhiker  0.000182088 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  22.3 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  26.42 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1959  polysaccharide biosynthesis protein  25.44 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1274  integral membrane protein MviN  29.76 
 
 		 506 aa  47.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0184214  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0310  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 		 421 aa  47.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1481  polysaccharide biosynthesis protein  22.64 
 
 		 471 aa  47.4  0.0006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.297126  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.1 
 
 		 488 aa  47  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  22.48 
 
 		 489 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 		 484 aa  47  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 490 aa  47  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  21.32 
 
 		 510 aa  47  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2100  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.56 
 
 		 415 aa  46.6  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30181  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  21.32 
 
 		 510 aa  46.6  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 		 429 aa  46.6  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  25.24 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4228  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 486 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 479 aa  46.6  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3770  polysaccharide biosynthesis protein  24.73 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0060  polysaccharide synthase family protein  40.58 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5256  polysaccharide synthase family protein  40.58 
 
 		 533 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  22.81 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>