84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0130 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 		 450 aa  938    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  63.06 
 
 		 447 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  36.1 
 
 		 471 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  34.08 
 
 		 479 aa  223  4.9999999999999996e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  34.04 
 
 		 479 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  32.47 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  34.42 
 
 		 441 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  34.55 
 
 		 473 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  34.13 
 
 		 479 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  33.51 
 
 		 473 aa  192  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  32.8 
 
 		 581 aa  191  2e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  32.38 
 
 		 494 aa  191  2.9999999999999997e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  33.71 
 
 		 440 aa  190  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  34.11 
 
 		 435 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  31.79 
 
 		 435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  32.95 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  34.01 
 
 		 596 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  34.8 
 
 		 452 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  33.64 
 
 		 415 aa  173  5.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  32.42 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  28.99 
 
 		 446 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  31.29 
 
 		 445 aa  161  2e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  30.32 
 
 		 464 aa  161  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  32.88 
 
 		 429 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  30.59 
 
 		 538 aa  158  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  33.22 
 
 		 478 aa  157  2e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  30.65 
 
 		 408 aa  156  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.28 
 
 		 467 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  31.98 
 
 		 627 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  28.41 
 
 		 711 aa  140  4.999999999999999e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  29.61 
 
 		 674 aa  136  7.000000000000001e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  26.65 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.12 
 
 		 340 aa  124  4e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  25.22 
 
 		 474 aa  122  9.999999999999999e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  25.98 
 
 		 644 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  28.49 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  28.04 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  27.42 
 
 		 505 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  24.55 
 
 		 473 aa  112  2.0000000000000002e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  26.47 
 
 		 482 aa  111  3e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  27.94 
 
 		 466 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  24.24 
 
 		 731 aa  107  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  25.64 
 
 		 492 aa  107  5e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  26.02 
 
 		 484 aa  106  9e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  26.39 
 
 		 464 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  26.91 
 
 		 463 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  24.73 
 
 		 471 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  32.57 
 
 		 704 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.41 
 
 		 698 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  26.4 
 
 		 515 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  25.79 
 
 		 474 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  31.63 
 
 		 690 aa  98.6  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  25.85 
 
 		 490 aa  97.4  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  24.65 
 
 		 495 aa  97.1  6e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  24.75 
 
 		 534 aa  96.7  7e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  25.24 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.6 
 
 		 487 aa  94.4  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  24.62 
 
 		 460 aa  94  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.13 
 
 		 704 aa  94  4e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  26.87 
 
 		 687 aa  93.2  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  25.89 
 
 		 478 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  29.64 
 
 		 638 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  33.52 
 
 		 470 aa  92.4  2e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  25.08 
 
 		 460 aa  92  2e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  33.73 
 
 		 606 aa  90.9  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  35.62 
 
 		 581 aa  90.9  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.74 
 
 		 688 aa  90.1  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.67 
 
 		 709 aa  90.1  8e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  35.76 
 
 		 750 aa  89  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  24.2 
 
 		 500 aa  86.7  8e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  35.76 
 
 		 932 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  23.74 
 
 		 516 aa  83.2  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  29.89 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  27.4 
 
 		 212 aa  79.3  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  24.17 
 
 		 486 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  33.59 
 
 		 584 aa  75.5  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  30.11 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  22.42 
 
 		 483 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  22.84 
 
 		 663 aa  73.6  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  29.17 
 
 		 537 aa  71.2  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  24.3 
 
 		 798 aa  70.5  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  26.55 
 
 		 540 aa  60.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  31.91 
 
 		 555 aa  53.5  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>