14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0097 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0097  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  568  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3490  hypothetical protein  46.84 
 
 
264 aa  230  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.425617  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3387  hypothetical protein  49.58 
 
 
257 aa  226  4e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0845009  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06660  hypothetical protein  31.97 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1997  hypothetical protein  34.48 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.311664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5006  hypothetical protein  31.17 
 
 
266 aa  110  2.0000000000000002e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04425  hypothetical protein  28.02 
 
 
256 aa  95.1  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0522  hypothetical protein  27.86 
 
 
265 aa  90.1  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.582583  normal  0.0215931 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0100  hypothetical protein  26.49 
 
 
266 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1601  hypothetical protein  28.23 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.253838 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2274  hypothetical protein  23.3 
 
 
274 aa  53.9  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0519  hypothetical protein  23.35 
 
 
268 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0818036  normal  0.0227607 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2893  hypothetical protein  26.29 
 
 
342 aa  50.8  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.213192 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0146  hypothetical protein  22.91 
 
 
300 aa  48.9  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>