47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0069 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0069  protein of unknown function DUF1080  100 
 
 
209 aa  437  9.999999999999999e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.334679 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1177  protein of unknown function DUF1080  57.62 
 
 
214 aa  236  2e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2940  protein of unknown function DUF1080  47.6 
 
 
216 aa  195  5.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.221061  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0153  hypothetical protein  36.49 
 
 
501 aa  159  4e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0958  protein of unknown function DUF1080  32.99 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2356  protein of unknown function DUF1080  27.04 
 
 
453 aa  84  0.000000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0639  protein of unknown function DUF1080  31.98 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798724  normal  0.087669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5725  protein of unknown function DUF1080  28.17 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0208334 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3672  protein of unknown function DUF1080  28.85 
 
 
276 aa  71.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1742  protein of unknown function DUF1080  27.92 
 
 
241 aa  65.1  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4384  protein of unknown function DUF1080  27.89 
 
 
211 aa  64.7  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.968412  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3566  hypothetical protein  26.7 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0845109  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21190  protein of Unknown Function (DUF1080)  25.33 
 
 
1194 aa  62.8  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.900923  normal  0.894931 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0046  protein of unknown function DUF1080  25.71 
 
 
451 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4651  protein of unknown function DUF1080  27 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264791  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1130  protein of unknown function DUF1080  25.47 
 
 
240 aa  62.4  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.342121 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11080  glucose/sorbosone dehydrogenase  28.06 
 
 
1505 aa  62  0.000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.120578  normal  0.319442 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3650  protein of unknown function DUF1080  29.49 
 
 
230 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2672  protein of unknown function DUF1080  25.73 
 
 
1140 aa  59.3  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.189319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
1444 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7244  protein of unknown function DUF1080  28.12 
 
 
198 aa  58.2  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.709056  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2871  protein of unknown function DUF1080  23.91 
 
 
326 aa  58.2  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0516361  normal  0.710867 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1708  protein of unknown function DUF1080  28.79 
 
 
451 aa  58.2  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1060  protein of unknown function DUF1080  25.24 
 
 
260 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1112  hypothetical protein  24.76 
 
 
197 aa  55.5  0.0000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.58426  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2976  protein of unknown function DUF1080  24.69 
 
 
1145 aa  55.1  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.657239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4583  protein of unknown function DUF1080  28.84 
 
 
234 aa  54.3  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00498268  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3462  protein of unknown function DUF1080  27.31 
 
 
261 aa  53.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.772407  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0438  protein of unknown function DUF1080  27.6 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.11505  normal  0.50578 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2385  protein of unknown function DUF1080  26.29 
 
 
217 aa  52.4  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.40187  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2324  hypothetical protein  25.67 
 
 
308 aa  52.4  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.460066  normal  0.0304211 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3167  protein of unknown function DUF1080  30.82 
 
 
1046 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.213021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5403  protein of unknown function DUF1080  24.3 
 
 
240 aa  50.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.784732 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1648  hypothetical protein  25.13 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.761562  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5384  protein of unknown function DUF1080  24.46 
 
 
322 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6281  protein of unknown function DUF1080  30.97 
 
 
281 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.221693  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0295  protein of unknown function DUF1080  26.63 
 
 
212 aa  47.8  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.154289  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3047  protein of unknown function DUF1080  22.98 
 
 
242 aa  48.1  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.134306 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5676  protein of unknown function DUF1080  29.22 
 
 
455 aa  47.4  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.644868  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7277  protein of unknown function DUF1080  26.42 
 
 
237 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.271098  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0366  hypothetical protein  25.85 
 
 
239 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2881  protein of unknown function DUF1080  26.76 
 
 
452 aa  44.7  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3433  protein of unknown function DUF1080  25 
 
 
239 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.552511  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3405  protein of unknown function DUF1080  22.97 
 
 
321 aa  42.4  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.177564  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6337  protein of unknown function DUF1080  21.35 
 
 
218 aa  42  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.975208  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6569  protein of unknown function DUF1080  21.76 
 
 
238 aa  41.6  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.301124  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3718  protein of unknown function DUF1080  29.79 
 
 
311 aa  41.6  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>