More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0068 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0068  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1220    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.588647 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4200  ABC transporter related  65.65 
 
 		 591 aa  816    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117631  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5572  ABC transporter related protein  65.64 
 
 		 593 aa  822    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0982  hypothetical protein  36.13 
 
 		 588 aa  395  1e-108  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.44347 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1567  ABC transporter related  31.18 
 
 		 653 aa  296  5e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.989153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0999  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component-like protein  32.32 
 
 		 591 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0553  ABC transporter related  26.84 
 
 		 598 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  25.53 
 
 		 587 aa  170  7e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  25.82 
 
 		 586 aa  168  2e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  24.01 
 
 		 586 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16460  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.21 
 
 		 595 aa  164  6e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.407385  normal  0.84482 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  26.78 
 
 		 612 aa  160  4e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  26.85 
 
 		 652 aa  161  4e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2696  ABC transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  26.73 
 
 		 612 aa  160  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143711  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0739  ABC transport protein ATPase component  28.01 
 
 		 624 aa  160  7e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.191693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  26.69 
 
 		 595 aa  160  9e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  30.61 
 
 		 455 aa  159  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  26.44 
 
 		 625 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1171  ABC transporter CbaT  26.1 
 
 		 747 aa  158  3e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0885  ABC transporter related protein  34.7 
 
 		 590 aa  158  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  27.45 
 
 		 738 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  25.09 
 
 		 583 aa  155  1e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1541  ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 597 aa  155  2e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02349  ABC transporter, ATP-binding protein  23.95 
 
 		 598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  26.8 
 
 		 727 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12840  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.63 
 
 		 617 aa  154  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.376239  normal  0.0776203 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  27.44 
 
 		 738 aa  154  5e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0591  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.82 
 
 		 564 aa  153  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.234027  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  26.17 
 
 		 606 aa  152  1e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1107  ABC transporter, ATP-binding protein  33.09 
 
 		 610 aa  151  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000586381  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0731  hypothetical protein  23.96 
 
 		 582 aa  151  4e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  24.35 
 
 		 618 aa  151  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2200  ABC transporter related  24.91 
 
 		 592 aa  151  4e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.257555  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34840  ABC transporter, ATP-binding protein  35.54 
 
 		 595 aa  150  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  24.65 
 
 		 727 aa  150  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  25.42 
 
 		 604 aa  150  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  24.49 
 
 		 585 aa  150  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  27 
 
 		 734 aa  150  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3820  type I secretion system ATPase  27.36 
 
 		 741 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0301354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0198  ABC transporter  26.69 
 
 		 572 aa  149  2.0000000000000003e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1147  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.73 
 
 		 564 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1958  type I secretion system ATPase  27.16 
 
 		 739 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  25.23 
 
 		 585 aa  149  2.0000000000000003e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22440  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  33.86 
 
 		 610 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000108745 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  26.64 
 
 		 715 aa  149  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  25 
 
 		 722 aa  149  2.0000000000000003e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.17 
 
 		 583 aa  148  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2091  hypothetical protein  26.25 
 
 		 598 aa  148  3e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2174  ABC transporter related  23.6 
 
 		 627 aa  148  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003428  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  31.95 
 
 		 554 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000488495  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1898  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  33.86 
 
 		 610 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0761429  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06251  putative multidrug efflux ABC transporter  23.6 
 
 		 598 aa  147  5e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.761119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  25.71 
 
 		 602 aa  147  5e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1487  ABC transporter related  26.22 
 
 		 609 aa  147  5e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 		 641 aa  147  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.99 
 
 		 600 aa  147  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11970  ABC transporter, transmembrane permease and ATP binding components  24.91 
 
 		 599 aa  147  5e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  25.59 
 
 		 715 aa  147  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1385  ABC transporter related  26.02 
 
 		 622 aa  147  6e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0591  ABC transporter related  26.38 
 
 		 613 aa  147  6e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0415751  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2080  hypothetical protein  26.6 
 
 		 598 aa  147  7.0000000000000006e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.8 
 
 		 734 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07729  ABC metal ion transporter (Eurofung)  26.38 
 
 		 1535 aa  146  8.000000000000001e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.902977  normal  0.265707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  24.71 
 
 		 591 aa  146  9e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3418  ABC transporter related  25.58 
 
 		 595 aa  146  9e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  normal  0.0149825 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  24.77 
 
 		 590 aa  146  9e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1891  multidrug ABC transporter  23.46 
 
 		 598 aa  146  1e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4088  ABC transporter-like  34.55 
 
 		 605 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0836  ABC transporter related  34.66 
 
 		 610 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.181434  normal  0.584452 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0837  ABC transporter related protein  25.76 
 
 		 603 aa  145  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.568302 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0975  ABC transporter related  27.67 
 
 		 626 aa  146  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2930  ABC transporter related  27.8 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4750  ABC transporter related  35.41 
 
 		 611 aa  146  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0785549  normal  0.275934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1970  type I secretion system ATPase  27.54 
 
 		 731 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.231744  normal  0.591198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3410  ABC transporter related  24.11 
 
 		 638 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1272  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.73 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0677  ABC transporter related  34.92 
 
 		 618 aa  145  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.021842  normal  0.0281361 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  27.98 
 
 		 716 aa  145  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  36.51 
 
 		 550 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0665  ABC transporter related  34.92 
 
 		 646 aa  145  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.308501 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0907  ABC transporter related  34.66 
 
 		 610 aa  145  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.657123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6225  ABC transporter related  24.52 
 
 		 624 aa  145  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2448  ABC transporter, ATP-binding  25.75 
 
 		 594 aa  145  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.946245 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0591  ABC transporter related  26.21 
 
 		 593 aa  145  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00179629 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4748  ABC transporter related  34.71 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.426144 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4431  ABC transporter related  31.67 
 
 		 581 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1935  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.47 
 
 		 606 aa  145  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 		 632 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1868  ABC transporter related  26.52 
 
 		 610 aa  145  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0369  ABC transporter related  25 
 
 		 612 aa  145  3e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0276  ABC transporter related  26.49 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12810  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  26.25 
 
 		 598 aa  144  4e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0126222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  24.54 
 
 		 606 aa  144  4e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1463  ABC transporter related  26.01 
 
 		 597 aa  144  5e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  24.38 
 
 		 583 aa  144  5e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1192  ABC transporter related  26.06 
 
 		 587 aa  144  6e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.858634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  26.22 
 
 		 620 aa  144  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  27.44 
 
 		 584 aa  144  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0415  cytochrome bd biosynthesis ABC-type transporter, ATPase and permease component  29.79 
 
 		 570 aa  143  7e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.762356  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.48 
 
 		 591 aa  143  8e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>