213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0066 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0066  polysaccharide export protein  100 
 
 		 275 aa  552  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.200434 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4354  Soluble ligand binding domain protein  48.26 
 
 		 266 aa  237  1e-61  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.76847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0727  polysaccharide export protein  47.13 
 
 		 276 aa  231  9e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.567222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6397  Soluble ligand binding domain protein  45.14 
 
 		 265 aa  225  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.141277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6308  Soluble ligand binding domain protein  40.89 
 
 		 276 aa  211  7.999999999999999e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.611613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4765  polysaccharide export periplasmic protein  38.08 
 
 		 281 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00350662  normal  0.271358 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2358  polysaccharide export periplasmic protein  41.43 
 
 		 263 aa  182  6e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2665  Soluble ligand binding domain protein  38.15 
 
 		 275 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.436748  normal  0.303362 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4088  polysaccharide export protein  37.45 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.142355 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10728  polysaccharide export outer membrane protein  37.71 
 
 		 283 aa  164  2.0000000000000002e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2077  polysaccharide export protein  39.02 
 
 		 260 aa  158  8e-38  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00598024  normal  0.432742 
 
 
-
 
NC_002950  PG0437  BexD/CtrA/VexA family polysaccharide export protein  35.11 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0250029 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2287  polysaccharide export protein  32.82 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0879  polysaccharide export outer membrane protein  32.57 
 
 		 250 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.146875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0845  polysaccharide export protein  27.83 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.700264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0361  polysaccharide export protein  26.02 
 
 		 263 aa  98.6  1e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2882  polysaccharide export protein  33.14 
 
 		 247 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000309988  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07225  polysaccharide export protein, BexD/CtrA/VexA family protein  28.7 
 
 		 257 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3890  polysaccharide export system outer membrane protein  25.48 
 
 		 264 aa  84  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3196  polysaccharide export protein  37.69 
 
 		 391 aa  79  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.622788  normal  0.189888 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3133  polysaccharide export protein  35.38 
 
 		 417 aa  76.6  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3189  polysaccharide export protein  36.54 
 
 		 392 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.32554  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1118  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 426 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1189  polysaccharide export protein  38.83 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1925  polysaccharide export protein  37.25 
 
 		 372 aa  70.9  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6483  polysaccharide export protein  31.29 
 
 		 426 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.45057 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0546  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.06 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4916  polysaccharide export protein  29.19 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.713407  hitchhiker  0.000554375 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1690  polysaccharide export protein  33.76 
 
 		 428 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.977677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0915  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  31.06 
 
 		 396 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.138032  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2620  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.06 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2482  capsular polysaccharide biosynthesis/export protein  31.06 
 
 		 391 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.153813  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6745  polysaccharide export protein  32.19 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.274318  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3319  polysaccharide export protein  29.59 
 
 		 383 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00116836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5370  polysaccharide export protein  33.99 
 
 		 391 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4169  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.95415  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4197  polysaccharide export protein  28.3 
 
 		 423 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.937901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3865  putative polysaccharide export protein  27.52 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2273  polysaccharide export protein  29.38 
 
 		 392 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.534811  normal  0.26202 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3621  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 408 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.816168 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5851  EPS I polysaccharide export outer membrane protein  30.21 
 
 		 362 aa  65.9  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4096  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 407 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.512388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4540  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0169971  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3823  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 387 aa  65.5  0.0000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01391  exopolysaccharide xanthan biosynthesis export protein GumB  29.08 
 
 		 232 aa  65.1  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.300976  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3701  polysaccharide export protein  27.95 
 
 		 392 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3726  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.489348  normal  0.448229 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5549  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 392 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4241  polysaccharide export protein  33.33 
 
 		 417 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.238114 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0253  polysaccharide export protein  28.57 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.138137  decreased coverage  0.000559198 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1020  EPS I polysaccharide export outer membrane transmembrane protein  32.43 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.784638  normal  0.873856 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  30.71 
 
 		 473 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1817  polysaccharide export protein  31.68 
 
 		 390 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.538171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0609  polysaccharide export protein  27.16 
 
 		 358 aa  62.8  0.000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.278241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1352  capsular polysaccharide biosynthesis/export periplasmic protein  28.26 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5905  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 385 aa  62  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.438446  normal  0.224196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1060  polysaccharide export protein  28.74 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3278  polysaccharide export protein  33.01 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.828407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0819  polysaccharide export protein  28.89 
 
 		 379 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1088  polysaccharide export protein  31.37 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000453729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6173  polysaccharide export protein  28.06 
 
 		 391 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.371162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6263  polysaccharide export protein  26.05 
 
 		 385 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.527808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  31.43 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2257  putative outer membrane polysaccharide exporter  29.2 
 
 		 384 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1114  polysaccharide export protein  31.85 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0366205  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7400  polysaccharide export protein  27.34 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471372 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3260  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.81 
 
 		 422 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.14085  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2650  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.28267  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2243  polysaccharide (EPS I) exporter  28.31 
 
 		 407 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0548899  normal  0.73055 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0509  putative polysaccharide export, outer membrane protein, epsA  31.68 
 
 		 350 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5118  polysaccharide export protein  31.07 
 
 		 348 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.898445  normal  0.024948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2473  polysaccharide export protein  32.04 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0662836  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6022  polysaccharide export protein  28.47 
 
 		 384 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.113173  normal  0.244063 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3222  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  38.61 
 
 		 205 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2833  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.173775  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3274  polysaccharide biosynthesis/export protein  26.09 
 
 		 446 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1958  polysaccharide export protein  29.8 
 
 		 407 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.676148  normal  0.565154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2738  polysaccharide export protein  30.37 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.01 
 
 		 495 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0619  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 376 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112684  normal  0.159669 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4055  polysaccharide export protein  30.69 
 
 		 390 aa  57  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  32.79 
 
 		 439 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3692  polysaccharide export protein  30.77 
 
 		 348 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  normal  0.965292 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2586  polysaccharide export protein  30.36 
 
 		 184 aa  56.2  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.693737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0647  polysaccharide export system, outer membrane component  26.75 
 
 		 358 aa  55.5  0.0000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428631 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1728  putative capsular polysaccharide transport outermembrane protein  29.41 
 
 		 352 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0503982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2495  polysaccharide export protein  28.07 
 
 		 212 aa  55.1  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  32.12 
 
 		 347 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000178188  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  29.49 
 
 		 253 aa  55.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1538  GumB protein  27.07 
 
 		 249 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  30.43 
 
 		 196 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1482  polysaccharide export protein  27.82 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.242862  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 455 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  31.97 
 
 		 455 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2864  polysaccharide export protein  30.66 
 
 		 389 aa  53.9  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3871  polysaccharide export protein  33.66 
 
 		 214 aa  53.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.631942  normal  0.0416181 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  34.71 
 
 		 264 aa  52.8  0.000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  35.78 
 
 		 196 aa  52.4  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4093  hypothetical protein  29.08 
 
 		 356 aa  52.4  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.818341  normal  0.104815 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>