More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0042 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0042  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 454 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1967  outer membrane efflux protein  53.53 
 
 		 443 aa  438  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000399706  normal  0.35271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2362  outer membrane efflux protein  50.68 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1475  outer membrane efflux protein  30.31 
 
 		 449 aa  206  7e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.236212  normal  0.298581 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1143  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0286987  normal  0.128527 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2515  outer membrane protein  30.34 
 
 		 463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5506  outer membrane efflux protein  28.13 
 
 		 451 aa  161  3e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  26.37 
 
 		 442 aa  157  4e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4162  outer membrane efflux protein  26.88 
 
 		 443 aa  134  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000533026  normal  0.288124 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  25.41 
 
 		 453 aa  133  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3706  outer membrane efflux protein  29.26 
 
 		 447 aa  122  9.999999999999999e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2173  outer membrane efflux protein  25.53 
 
 		 448 aa  120  3.9999999999999996e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4492  outer membrane efflux protein  24.65 
 
 		 455 aa  119  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.685781 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  24.05 
 
 		 467 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  22.72 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2807  outer membrane efflux protein/ immunoreative antigen  23.13 
 
 		 441 aa  109  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 462 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2560  outer membrane efflux protein  24.88 
 
 		 438 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  23.63 
 
 		 470 aa  107  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1266  outer membrane efflux protein  23.75 
 
 		 444 aa  105  2e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0733  outer membrane efflux protein, putative  22.22 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  22.89 
 
 		 496 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.77 
 
 		 463 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3719  outer membrane efflux protein  23.91 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.633766  normal  0.0948534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2819  outer membrane efflux protein  23.21 
 
 		 438 aa  96.3  9e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2647  outer membrane efflux protein  25.06 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.910769  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0538  outer membrane efflux protein  23.15 
 
 		 462 aa  93.2  8e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  25.68 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1450  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  26.21 
 
 		 471 aa  87.8  3e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1761  hypothetical protein  24.84 
 
 		 576 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  24.33 
 
 		 438 aa  80.9  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  23.61 
 
 		 419 aa  80.1  0.00000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01970  outer membrane efflux protein, putative  23.78 
 
 		 456 aa  80.1  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.154405  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.64 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  26.16 
 
 		 451 aa  79  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  22.13 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  21.48 
 
 		 441 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  23.08 
 
 		 1496 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 		 471 aa  75.5  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3409  outer membrane efflux protein  23.63 
 
 		 419 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000155286  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3444  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.17 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.960604 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5330  outer membrane efflux protein  24.43 
 
 		 429 aa  73.6  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.757466 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2026  RND efflux system outer membrane lipoprotein NodT  23.95 
 
 		 519 aa  73.2  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.192262 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  21.1 
 
 		 421 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3777  outer membrane channel protein  23.38 
 
 		 470 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3737  outer membrane efflux protein  24.95 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.315415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0549  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  25.67 
 
 		 501 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.569542  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2662  outer membrane efflux protein  20.75 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0544  outer membrane channel protein  24.6 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000576987  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02621  outer membrane protein required for AvrXa21 activity C (raxC)  24.43 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0366  outer membrane efflux protein  22.5 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6215  outer membrane efflux protein  25.62 
 
 		 493 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.811282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004522  type I secretion TolC precursor  24.29 
 
 		 442 aa  69.7  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000301167  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0516  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  25.33 
 
 		 500 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0482869  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 		 494 aa  69.3  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0329  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.47 
 
 		 474 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3448  outer membrane channel protein  22.59 
 
 		 494 aa  68.9  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.203909 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0545  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.84 
 
 		 470 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.540838  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0491  Type I secretion outer membrane protein, TolC  22.04 
 
 		 477 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00611692  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3619  outer membrane channel protein  22.47 
 
 		 469 aa  67.8  0.0000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1606  outer membrane efflux protein  21.75 
 
 		 421 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  21.66 
 
 		 417 aa  67.4  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3904  outer membrane channel protein  21.67 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0499  RND efflux system outer membrane lipoprotein  23.62 
 
 		 546 aa  66.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.16116  normal  0.32958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1015  Outer membrane efflux protein  25.35 
 
 		 731 aa  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0127212 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2963  putative outer membrane drug efflux lipoprotein  22.88 
 
 		 487 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0774  outer membrane channel protein  23 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000983275  unclonable  0.000000000104798 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3096  outer membrane efflux protein  22.82 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4195  outer membrane channel protein  22.81 
 
 		 443 aa  65.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000611538  hitchhiker  0.000431125 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2013  outer membrane channel protein  23.51 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000158125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4543  outer membrane efflux protein  21.11 
 
 		 430 aa  65.1  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.781416  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3343  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.24 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3497  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.45 
 
 		 470 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3710  outer membrane efflux protein  25.78 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0532  RND efflux system outer membrane lipoprotein  22.84 
 
 		 475 aa  65.1  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.17075 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0527  outer membrane protein OprM precursor  21.36 
 
 		 485 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71666  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4088  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT  22.29 
 
 		 489 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.947344  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2148  TolC family type I secretion outer membrane protein  20.84 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.400858  normal  0.0489946 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3330  outer membrane channel protein  23.86 
 
 		 493 aa  64.7  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1482  outer membrane efflux protein  21.04 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  20.1 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1195  RND efflux system outer membrane lipoprotein  25.17 
 
 		 482 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000171892  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  23.82 
 
 		 455 aa  63.5  0.000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  20.37 
 
 		 518 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3372  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.258775 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3367  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3437  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3444  outer membrane channel protein  22.8 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.606184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2630  Type I secretion outer membrane protein, TolC  19.46 
 
 		 489 aa  63.2  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0665  type I secretion outer membrane protein, TolC family  23.59 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02857  hypothetical protein  23.59 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3213  outer membrane channel protein  23.59 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00955114  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0480  RND efflux system outer membrane lipoprotein  24.29 
 
 		 505 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0104002 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0662  outer membrane channel protein  23.59 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.120975  normal  0.0171626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3466  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  23.53 
 
 		 461 aa  62.8  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4349  outer membrane channel protein  23.85 
 
 		 493 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.823303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05550  major intrinsic multiple antibiotic resistance efflux outer membrane protein OprM precursor  21.12 
 
 		 485 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.203755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3499  outer membrane channel protein  23.59 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0404091  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  24.67 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0979  outer membrane efflux protein  25.95 
 
 		 375 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>