148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0039 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0039  protein of unknown function UPF0187  100 
 
 		 300 aa  622  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.115525  normal  0.475905 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1250  protein of unknown function UPF0187  42.34 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000295826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0277  protein of unknown function UPF0187  41.06 
 
 		 302 aa  229  4e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162073  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3670  protein of unknown function UPF0187  37.71 
 
 		 309 aa  215  7e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3397  hypothetical protein  42.32 
 
 		 315 aa  214  9.999999999999999e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.193975  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6784  protein of unknown function UPF0187  39.71 
 
 		 299 aa  208  7e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.256656  normal  0.854767 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2382  hypothetical protein  37.04 
 
 		 321 aa  205  9e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000769788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0893  protein of unknown function UPF0187  36.69 
 
 		 297 aa  195  9e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.193687 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1229  hypothetical protein  33.07 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.551182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3860  protein of unknown function UPF0187  33.2 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0101759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1069  hypothetical protein  32.95 
 
 		 308 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.686021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02585  hypothetical protein  34.13 
 
 		 286 aa  169  6e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3402  hypothetical protein  37.7 
 
 		 296 aa  168  1e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.408916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1275  hypothetical protein  32.1 
 
 		 333 aa  165  8e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0364003  normal  0.373706 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1817  hypothetical protein  32.97 
 
 		 313 aa  165  9e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.294075  normal  0.846199 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1446  hypothetical protein  32.56 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3456  protein of unknown function UPF0187  31.77 
 
 		 307 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0228488  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2692  hypothetical protein  28.57 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.14568  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2042  hypothetical protein  29.41 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.660228  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2549  protein of unknown function UPF0187  34.1 
 
 		 272 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5036  protein of unknown function UPF0187  36 
 
 		 305 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3926  hypothetical protein  33.74 
 
 		 305 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.74386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2252  hypothetical protein  30.93 
 
 		 299 aa  151  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.272487  normal  0.629804 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2476  hypothetical protein  32.34 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.759422 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3933  hypothetical protein  28.89 
 
 		 309 aa  145  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.195059  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5054  hypothetical protein  32.14 
 
 		 295 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.399703  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2785  hypothetical protein  32.35 
 
 		 300 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31760  hypothetical protein  32.43 
 
 		 306 aa  144  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5376  hypothetical protein  28.62 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4128  hypothetical protein  30.66 
 
 		 299 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.903788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0092  hypothetical protein  29.82 
 
 		 300 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3907  hypothetical protein  29.45 
 
 		 299 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5502  hypothetical protein  32.54 
 
 		 295 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3389  hypothetical protein  28.52 
 
 		 299 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3226  hypothetical protein  30.87 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4598  hypothetical protein  28.77 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0395716  normal  0.546384 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2950  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  140  3e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.345922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1290  hypothetical protein  29.97 
 
 		 299 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3033  hypothetical protein  28.79 
 
 		 310 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2133  hypothetical protein  31.25 
 
 		 304 aa  139  7e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.337926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2942  hypothetical protein  31.39 
 
 		 287 aa  139  7e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0047162  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2126  protein of unknown function UPF0187  30.2 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0815429  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1423  hypothetical protein  32.38 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4544  hypothetical protein  30.2 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0214885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1652  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  138  1e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01477  conserved inner membrane protein  30.2 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0016  protein of unknown function UPF0187  31.37 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.742789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01488  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0021  protein of unknown function UPF0187  31.25 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1602  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.738962  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1720  hypothetical protein  31.25 
 
 		 321 aa  137  2e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.219104  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3922  hypothetical protein  29.86 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.314293  normal  0.0751799 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2138  hypothetical protein  30.2 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1689  hypothetical protein  28.78 
 
 		 321 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00204582  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0078  protein of unknown function UPF0187  28.52 
 
 		 291 aa  136  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.323458  hitchhiker  0.00334919 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4007  hypothetical protein  30.77 
 
 		 306 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0696  hypothetical protein  25.66 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3414  hypothetical protein  30.47 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2184  hypothetical protein  30.08 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0159481 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3475  hypothetical protein  31.67 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0869  hypothetical protein  32.16 
 
 		 295 aa  132  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0828  hypothetical protein  32.16 
 
 		 323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00926098 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1371  conserved effector locus protein  30.71 
 
 		 314 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0841301  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1417  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.285233  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4358  hypothetical protein  32.16 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.750707  normal  0.330007 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1255  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.288403  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2578  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.468115  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1155  protein of unknown function UPF0187  33.58 
 
 		 293 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.272335  normal  0.253462 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0228  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0500  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1335  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1070  hypothetical protein  31.78 
 
 		 302 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.55174  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0854  hypothetical protein  32.16 
 
 		 297 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4064  hypothetical protein  31.17 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4469  hypothetical protein  30.36 
 
 		 306 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.476961  normal  0.842377 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5346  hypothetical protein  29.51 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00567307  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1456  protein of unknown function UPF0187  31.54 
 
 		 309 aa  129  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.205773  normal  0.5655 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1264  hypothetical protein  29.76 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.021109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3788  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.476035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4580  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0477154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5725  hypothetical protein  29.32 
 
 		 306 aa  129  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.890183  normal  0.38929 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5726  protein of unknown function UPF0187  30.61 
 
 		 303 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.124746  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1022  protein of unknown function UPF0187  31.06 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.88279 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1182  hypothetical protein  29.8 
 
 		 314 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.720294  normal  0.241586 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2014  hypothetical protein  27.34 
 
 		 304 aa  125  7e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00931147  normal  0.0815668 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1404  protein of unknown function UPF0187  27.62 
 
 		 306 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.453282  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3495  hypothetical protein  28.57 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2042  protein of unknown function UPF0187  30.32 
 
 		 286 aa  123  4e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0364314  hitchhiker  0.00398813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3128  hypothetical protein  26.62 
 
 		 305 aa  123  4e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2577  hypothetical protein  29.84 
 
 		 306 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.652411 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3207  hypothetical protein  29.84 
 
 		 310 aa  122  8e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2717  protein of unknown function UPF0187  28.57 
 
 		 303 aa  120  1.9999999999999998e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0718878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0613  protein of unknown function UPF0187  28.29 
 
 		 312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0834  hypothetical protein  29.02 
 
 		 304 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.725312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2003  protein of unknown function UPF0187  31.65 
 
 		 289 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157888  normal  0.175148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3838  hypothetical protein  30.2 
 
 		 303 aa  119  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.294262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2127  hypothetical protein  27.18 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.446173 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2414  membrane protein-like protein  27.82 
 
 		 335 aa  119  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.547284 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4283  protein of unknown function UPF0187  30 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>