More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0018 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0018  (2Fe-2S)-binding domain protein  100 
 
 
163 aa  339  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17826 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5426  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.92 
 
 
187 aa  217  7e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0584  (2Fe-2S)-binding domain protein  62.34 
 
 
158 aa  205  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00001317  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3758  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  63.09 
 
 
153 aa  205  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566675  normal  0.0134234 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6243  (2Fe-2S)-binding domain protein  61.18 
 
 
151 aa  204  4e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7215  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  62.67 
 
 
153 aa  204  4e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5895  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.09 
 
 
154 aa  204  4e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.413057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0731  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
151 aa  204  5e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0806  (2Fe-2S)-binding protein  61.84 
 
 
153 aa  202  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0756376  normal  0.191785 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0863  (2Fe-2S)-binding protein  62.42 
 
 
153 aa  201  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.134679 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1746  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60.67 
 
 
153 aa  201  4e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.446262  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1103  (2Fe-2S)-binding domain protein  60 
 
 
163 aa  201  4e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00357841  normal  0.792999 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2930  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.42 
 
 
153 aa  200  5e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0797474  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4733  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.211012  normal  0.305671 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2250  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  60 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1007  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.408478  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3103  (2Fe-2S)-binding ferredoxin  63.16 
 
 
155 aa  200  6e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0922  putative oxidoreductase, iron-sulfur cluster-binding subunit  60 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0747581  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3530  (2Fe-2S)-binding  61.74 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4836  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.74 
 
 
153 aa  200  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00102836 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4140  (2Fe-2S)-binding domain protein  63.95 
 
 
157 aa  200  8e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.478107  normal  0.124056 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5448  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
153 aa  199  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0179621 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4210  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.07 
 
 
153 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.465873  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2620  (2Fe-2S)-binding  63.82 
 
 
153 aa  198  3e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40180  putative oxidoreductase  61.33 
 
 
153 aa  198  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.948778  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1530  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.33 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1154  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.33 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.669322  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0086  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  59.33 
 
 
153 aa  197  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2280  (2Fe-2S)-binding protein  57.14 
 
 
154 aa  196  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.938299  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4167  (2Fe-2S)-binding  60 
 
 
152 aa  196  9e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3977  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.17 
 
 
153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156195  normal  0.592226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3465  (2Fe-2S)-binding  57.14 
 
 
154 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2461  (2Fe-2S)-binding domain protein  58.6 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4483  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.59 
 
 
152 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5636  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.02 
 
 
171 aa  194  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3950  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.14 
 
 
164 aa  195  3e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.194686  normal  0.0539481 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0849  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
151 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.369182  normal  0.586703 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3147  hypothetical protein  58.55 
 
 
152 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.483124 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0874  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.53 
 
 
151 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.607116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0913  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.53 
 
 
151 aa  193  8.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0626  aldehyde dehydrogenase subunit III  60 
 
 
152 aa  193  1e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2173  ferredoxin  59.46 
 
 
151 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.634408  normal  0.744864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33890  putative oxidoreductase  58.44 
 
 
156 aa  192  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.570354  normal  0.112211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2917  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.09 
 
 
153 aa  192  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1750  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
151 aa  191  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5082  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.6 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3776  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.67 
 
 
152 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.544021 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3173  (2Fe-2S)-binding  59.6 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2882  putative oxidoreductase  57.79 
 
 
156 aa  191  2e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0718166  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5195  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.6 
 
 
151 aa  192  2e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00758562 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2477  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit, putative  60.54 
 
 
153 aa  191  3e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.195637  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3147  (2Fe-2S)-binding  57.89 
 
 
152 aa  191  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00215108  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1691  putative oxidoreductase alpha subunit  60.14 
 
 
151 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.119824  normal  0.987612 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0905  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.78 
 
 
162 aa  191  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2320  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
152 aa  191  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0838  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  61.38 
 
 
154 aa  191  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0864  (2Fe-2S)-binding domain protein  59.87 
 
 
152 aa  191  5e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.383234 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4959  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.14 
 
 
151 aa  191  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.333735  normal  0.14163 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0200  isoquinoline 1-oxidoreductase, alpha subunit  62.68 
 
 
156 aa  190  6e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1603  (2Fe-2S)-binding protein  59.33 
 
 
151 aa  190  6e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356413  normal  0.202464 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2511  (2Fe-2S)-binding  56.95 
 
 
166 aa  190  6e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2021  putative aldehyde dehydrogenase  57.59 
 
 
162 aa  190  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.290531  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3902  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.24 
 
 
152 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4170  ferredoxin  59.09 
 
 
170 aa  190  8e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.373967  normal  0.177637 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3164  ferredoxin like protein  57.24 
 
 
152 aa  190  8e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.758839  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7868  putative aldehyde dehydrogenase  56.6 
 
 
162 aa  190  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5951  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.588853  normal  0.695303 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3961  (2Fe-2S)-binding  59.73 
 
 
151 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3679  (2Fe-2S)-binding  60.78 
 
 
165 aa  189  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4406  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.73 
 
 
151 aa  189  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.322434 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2662  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  58.39 
 
 
152 aa  188  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.626504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26060  oxidoreductase iron sulphur binding subunit  58.39 
 
 
152 aa  189  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.555573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2575  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.11 
 
 
151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.294784 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2854  putative oxidoreductase  54.25 
 
 
155 aa  188  2.9999999999999997e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4819  (2Fe-2S)-binding domain protein  56.76 
 
 
151 aa  188  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721772  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3840  (2Fe-2S)-binding domain protein  60.26 
 
 
167 aa  188  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1317  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  61.38 
 
 
153 aa  187  5e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1891  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  58.39 
 
 
152 aa  187  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2198  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58.17 
 
 
177 aa  187  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185555  hitchhiker  0.00320999 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2803  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.89 
 
 
163 aa  186  9e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.020197 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0857  (2Fe-2S)-binding  60.69 
 
 
153 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.774695  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1338  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.69 
 
 
153 aa  186  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1890  isoquinoline 1-oxidoreductase alpha subunit  56.58 
 
 
155 aa  186  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0051746  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3252  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  56.95 
 
 
151 aa  186  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256088  normal  0.660124 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4888  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
155 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5480  (2Fe-2S)-binding  59.06 
 
 
155 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5382  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.06 
 
 
155 aa  186  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25850  Ferredoxin:(2Fe-2S)-binding protein  58.55 
 
 
156 aa  185  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.589202  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1743  ferredoxin:(2Fe-2S)-binding  58.22 
 
 
154 aa  186  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1987  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  55.26 
 
 
155 aa  185  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000249056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3446  (2Fe-2S)-binding domain protein  57.24 
 
 
153 aa  186  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0763161 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2601  (2Fe-2S)-binding  58 
 
 
154 aa  185  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.346256  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0200  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60.54 
 
 
159 aa  185  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3827  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  58 
 
 
151 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.799959  normal  0.448884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3368  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  59.71 
 
 
157 aa  185  3e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.215369 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1962  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  60 
 
 
153 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.583833 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4295  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.33 
 
 
151 aa  185  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.969748 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4218  2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain-containing protein  57.62 
 
 
151 aa  185  3e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05442  dehydrogenase, small chain oxidoreductase protein  56.58 
 
 
152 aa  184  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.094889  normal  0.0167614 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4805  (2Fe-2S)-binding domain protein  55.92 
 
 
152 aa  184  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.875575 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>