50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0011 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_0011  protein of unknown function DUF1684  100 
 
 		 217 aa  447  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.160968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0288  protein of unknown function DUF1684  46.67 
 
 		 214 aa  191  6e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76834  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1152  hypothetical protein  42.11 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5770  protein of unknown function DUF1684  41.14 
 
 		 207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.146553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6369  protein of unknown function DUF1684  35.45 
 
 		 201 aa  122  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.415821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0693  protein of unknown function DUF1684  38.29 
 
 		 180 aa  122  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.138384 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1921  protein of unknown function DUF1684  35.9 
 
 		 197 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1972  protein of unknown function DUF1684  39.43 
 
 		 181 aa  118  7.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0790773 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1648  hypothetical protein  38.55 
 
 		 180 aa  117  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.496243  normal  0.437489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3770  protein of unknown function DUF1684  36.96 
 
 		 217 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1422  protein of unknown function DUF1684  41.04 
 
 		 188 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.68423  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1948  protein of unknown function DUF1684  38.73 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.483598 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06965  hypothetical protein  36.22 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2774  hypothetical protein  36.36 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0639344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0110  hypothetical protein  34.88 
 
 		 300 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24171 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4150  protein of unknown function DUF1684  37.67 
 
 		 271 aa  94  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0098  protein of unknown function DUF1684  36.3 
 
 		 284 aa  92.8  4e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.512612  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0091  hypothetical protein  33.56 
 
 		 285 aa  90.9  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00776  lipoprotein, putative  39.04 
 
 		 317 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0102845  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3706  protein of unknown function DUF1684  37.68 
 
 		 275 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0109  protein of unknown function DUF1684  34.93 
 
 		 284 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.530437  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1983  hypothetical protein  35.76 
 
 		 307 aa  85.9  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3906  hypothetical protein  33.56 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00409  lipoprotein, putative  32.89 
 
 		 324 aa  83.6  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2292  protein of unknown function DUF1684  35.43 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000238321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2196  protein of unknown function DUF1684  34.59 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2981  protein of unknown function DUF1684  34.29 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4806  protein of unknown function DUF1684  30 
 
 		 313 aa  79.3  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.997979  normal  0.94206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2723  hypothetical protein  33.81 
 
 		 270 aa  78.2  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0153726 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2001  hypothetical protein  33.56 
 
 		 320 aa  78.2  0.00000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2755  protein of unknown function DUF1684  32.62 
 
 		 272 aa  78.2  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.699811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2080  hypothetical protein  34.29 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2753  protein of unknown function DUF1684  31.43 
 
 		 309 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2554  hypothetical protein  32.57 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0345217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3157  protein of unknown function DUF1684  30.72 
 
 		 209 aa  73.9  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0117254 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2363  protein of unknown function DUF1684  34.97 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.380756  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2308  protein of unknown function DUF1684  29.63 
 
 		 267 aa  72  0.000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0730  protein of unknown function DUF1684  30.94 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.592553  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0731  protein of unknown function DUF1684  28.65 
 
 		 279 aa  68.6  0.00000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0349  protein of unknown function DUF1684  32.05 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0336856 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29090  Protein of unknown function (DUF1684)  30.37 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.941237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2305  protein of unknown function DUF1684  25.55 
 
 		 270 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.557281  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4200  hypothetical protein  28.36 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.267233 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3485  protein of unknown function DUF1684  34.53 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0709  protein of unknown function DUF1684  39.74 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.664073  normal  0.268622 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34240  hypothetical protein  27.01 
 
 		 289 aa  48.9  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.213477 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4349  protein of unknown function DUF1684  29.6 
 
 		 198 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0740  protein of unknown function DUF1684  27.97 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07020  hypothetical protein  29 
 
 		 273 aa  45.8  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0611  hypothetical protein  26.58 
 
 		 274 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0308884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>