298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0041 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000732945  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1222  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0686417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  88 
 
 		 78 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000219569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  95.74 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0058  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.585582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5654  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000615914  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000301735  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000445849  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000721816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5657  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814589  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.634702  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0195  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5141  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000127094  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0174  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0012  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000311563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0012  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000023664  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0058  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  95.45 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0016  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  93.18 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0065  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.109951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0043  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.27027  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0018  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00221415  normal  0.014977 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>