64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_R0040 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET_tRNA-Leu-3  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000000880716  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0040  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.208848  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1221  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.164315  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0029  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 88 bp  60  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000498774  normal  0.0770032 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07180  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000122258  normal  0.69512 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10180  tRNA-Leu  94.74 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000000392924  hitchhiker  0.000000470652 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0044  tRNA-Leu  84.09 
 
 		 88 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000178577  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0052  tRNA-Leu  96.77 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0256  tRNA-Leu  94.87 
 
 		 89 bp  54  0.000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.994208  normal  0.020013 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21100  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.570038  normal  0.190308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13650  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00181798  normal  0.743101 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17070  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.779723 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0619619  normal  0.0360334 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0037  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0612357  normal  0.0343105 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0031  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0989322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000019352  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14022  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0040  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00145069  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0035  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0036  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0024  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.7456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21120  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.387136  normal  0.20293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0029  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 89 bp  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0024  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.478295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0030  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0028  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 88 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.380759  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0027  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.994542  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0033  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 85 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.34016  normal  0.730319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0028  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.639598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0034  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 83 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0025  tRNA-Leu  94.12 
 
 		 86 bp  52  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.873101  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0038  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000434442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0056  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.177317  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0025  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.191845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2246  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0031  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0527771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1958  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.301935  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0040  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0360515  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0008  tRNA-Ser  100 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_R0012  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.328516  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_R0047  tRNA-Ser  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0118  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.233228  hitchhiker  0.00000366381 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0146  tRNA-Leu  87.3 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000070771  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0072  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000050044  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0045  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.259532  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1379  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 91 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.107567 
 
 
-
 
NC_006369  lplt43  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt43  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0035  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna008  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000945853  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna115  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000448705  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0103  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0061  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0072  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000217176  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0050  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000589808  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0033  tRNA-Leu  93.33 
 
 		 90 bp  44.1  0.005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.37116 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03400  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06707  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0027  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3125t  tRNA-Leu  89.13 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.556265  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0049  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000122389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>