More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1372 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  94.89 
 
 
567 aa  1057    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 
567 aa  1121    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  95.24 
 
 
567 aa  1057    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  38.6 
 
 
673 aa  378  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  38.96 
 
 
671 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3938  sodium/hydrogen exchanger  39.64 
 
 
652 aa  374  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4016  sodium/hydrogen exchanger  39.11 
 
 
775 aa  367  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00920037  hitchhiker  0.000000797462 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2967  sodium/hydrogen exchanger  39.29 
 
 
762 aa  359  9e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.619834 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3086  Sodium/hydrogen exchanger  38.82 
 
 
773 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.982722  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1539  sodium/hydrogen exchanger  41.99 
 
 
662 aa  352  7e-96  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  34.51 
 
 
636 aa  348  2e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1420  sodium/hydrogen exchanger  38.2 
 
 
771 aa  344  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1076  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
665 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.886506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1047  sodium/hydrogen exchanger  38.01 
 
 
665 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  35.83 
 
 
658 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1204  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.52 
 
 
697 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.944233  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  35.63 
 
 
664 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0855  sodium/hydrogen exchanger  33.63 
 
 
674 aa  333  6e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0221534  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1991  sodium/hydrogen exchanger  34.77 
 
 
666 aa  332  7.000000000000001e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000714201 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0784  sodium/hydrogen exchanger  35.82 
 
 
665 aa  332  1e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  35.3 
 
 
672 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1651  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.21 
 
 
671 aa  326  8.000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.899858  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  33.81 
 
 
741 aa  323  6e-87  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1987  sodium/hydrogen exchanger  34.17 
 
 
667 aa  320  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0275155 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1631  sodium/hydrogen exchanger  32.61 
 
 
665 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2236  sodium/hydrogen exchanger  34.11 
 
 
666 aa  313  4.999999999999999e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
684 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0258  sodium/hydrogen exchanger  35.28 
 
 
573 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  34.83 
 
 
588 aa  306  6e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1178  putative potassium efflux transporter  34.06 
 
 
650 aa  299  1e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  34.33 
 
 
584 aa  297  4e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0669  glutathione-regulated potassium-efflux system protein  33.57 
 
 
663 aa  296  7e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.842993 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  33.27 
 
 
666 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0727  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  33.22 
 
 
670 aa  292  9e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000025266  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0658  potassium efflux system protein  34.21 
 
 
555 aa  291  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1132  hypothetical protein  32.55 
 
 
564 aa  291  3e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1188  hypothetical protein  31.54 
 
 
682 aa  291  3e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0275042 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3853  sodium/hydrogen exchanger  34.46 
 
 
583 aa  288  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1301  sodium/hydrogen exchanger  35.78 
 
 
693 aa  287  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0257  sodium/hydrogen exchanger  32.03 
 
 
674 aa  286  5e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0120325  normal  0.149917 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  33.83 
 
 
562 aa  286  5e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3064  Sodium/hydrogen exchanger  32.41 
 
 
565 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2803  sodium/hydrogen exchanger  32.78 
 
 
656 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4813  sodium/hydrogen exchanger  38.04 
 
 
666 aa  284  3.0000000000000004e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2663  sodium/hydrogen exchanger  33.93 
 
 
668 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0308  sodium/hydrogen exchanger  35.04 
 
 
674 aa  283  8.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.512225  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1853  sodium/hydrogen exchanger  32.55 
 
 
688 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000204486  normal  0.40293 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  32.08 
 
 
664 aa  281  2e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0360  TrkA-N:TrkA-C:Sodium/hydrogen exchanger  33.64 
 
 
659 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.852363  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3670  potassium efflux system protein  35.6 
 
 
576 aa  279  8e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.663125  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  33.21 
 
 
666 aa  278  2e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  32.67 
 
 
567 aa  277  4e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2617  potassium efflux system protein  32.37 
 
 
649 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1368  potassium efflux system protein  31.27 
 
 
662 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.164343  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1293  potassium efflux system protein  33.21 
 
 
650 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0567  hypothetical protein  31.58 
 
 
564 aa  274  3e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  33.02 
 
 
561 aa  274  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1145  putative cation:proton antiport protein  32.39 
 
 
563 aa  274  3e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.176983  unclonable  0.0000000402209 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0410  putative cation:proton antiport protein  34.34 
 
 
558 aa  273  5.000000000000001e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00429  predicted transporter with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.9 
 
 
558 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3138  putative cation:proton antiport protein  33.9 
 
 
558 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000511667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0555  putative cation:proton antiport protein  33.9 
 
 
558 aa  273  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00434  hypothetical protein  33.9 
 
 
558 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0517  putative cation:proton antiport protein  33.9 
 
 
558 aa  273  9e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0570  putative cation:proton antiport protein  33.9 
 
 
558 aa  273  9e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.861339  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0522  putative cation:proton antiport protein  33.9 
 
 
558 aa  272  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4112  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3094  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 
605 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3414  sodium/hydrogen exchanger  34.5 
 
 
605 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.399905  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3132  potassium efflux system protein  33.71 
 
 
558 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1736  potassium efflux system protein  34.02 
 
 
556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  32.33 
 
 
561 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1026  putative cation:proton antiport protein  33.21 
 
 
562 aa  268  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1156  TrkA-N:Sodium/hydrogen exchanger  32.99 
 
 
595 aa  268  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.269314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3034  putative cation:proton antiport protein  32.7 
 
 
563 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0496878  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0554  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 
558 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.556541  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0544  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 
558 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.890116  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0599  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 
558 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.18338  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0538  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 
558 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0539  putative cation:proton antiport protein  33.33 
 
 
558 aa  267  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3175  putative cation:proton antiport protein  32.77 
 
 
563 aa  266  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.47283  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0917  sodium/hydrogen exchanger  32.07 
 
 
585 aa  266  5.999999999999999e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2867  sodium/hydrogen exchanger  31.66 
 
 
649 aa  265  1e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0602  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 
667 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.616152  normal  0.0415752 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3287  potassium efflux system protein  34.14 
 
 
605 aa  265  1e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15318  normal  0.307272 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3733  potassium efflux system protein  32.71 
 
 
575 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.769555 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3434  sodium/hydrogen exchanger  33.51 
 
 
577 aa  265  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.106813  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72800  putative potassium efflux transporter  33.46 
 
 
567 aa  265  2e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0332  sodium/hydrogen exchanger  32.32 
 
 
667 aa  264  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1259  putative cation:proton antiport protein  32.95 
 
 
562 aa  264  3e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00350207  hitchhiker  0.0000131586 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5295  sodium/hydrogen exchanger  32.23 
 
 
661 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3140  potassium efflux system protein  31.66 
 
 
566 aa  263  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.138229  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1645  sodium/hydrogen exchanger  31.63 
 
 
586 aa  263  6.999999999999999e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2797  potassium efflux system protein  32.5 
 
 
648 aa  261  2e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.488143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0957  putative cation:proton antiport protein  32.58 
 
 
558 aa  261  2e-68  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4116  putative glutathione-regulated potassium efflux system protein  32.66 
 
 
666 aa  262  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0668  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefC, putative  32.17 
 
 
584 aa  260  4e-68  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.457032  normal  0.0419012 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2956  sodium/hydrogen exchanger  30.52 
 
 
654 aa  259  6e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356807  normal  0.100111 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1858  sodium/hydrogen exchanger  32.72 
 
 
613 aa  259  9e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2098  sodium/hydrogen exchanger  32.34 
 
 
584 aa  258  1e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1647  glutathione-regulated potassium-efflux system protein KefB, putative  32.38 
 
 
648 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>