More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1296 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1296  SsrA-binding protein  100 
 
 		 182 aa  375  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000870079  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1506  SsrA-binding protein  98.26 
 
 		 172 aa  347  7e-95  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000124278  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1280  ssrA binding protein (smpB)  93.51 
 
 		 154 aa  300  1e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000661775  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0256  SsrA-binding protein  55.94 
 
 		 153 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00851918  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4712  SsrA-binding protein  55 
 
 		 156 aa  171  5.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000106723  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0691  SsrA-binding protein  52.74 
 
 		 161 aa  170  9e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1443  SsrA-binding protein  54.79 
 
 		 158 aa  169  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000666048  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3124  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  163  1.0000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4955  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000570818  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4806  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000144098  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4817  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000561916  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0189  SsrA-binding protein  52.35 
 
 		 158 aa  162  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000399646  normal  0.0189188 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5332  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000321328  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5212  SsrA-binding protein  51.37 
 
 		 155 aa  162  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1092  SsrA-binding protein  51.35 
 
 		 152 aa  162  3e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2954  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 155 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0748  SsrA-binding protein  50 
 
 		 157 aa  160  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.107528  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3672  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  160  8.000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.35402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5242  SsrA-binding protein  50.34 
 
 		 155 aa  160  1e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.275752  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5231  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0275  SsrA-binding protein  53.74 
 
 		 155 aa  160  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000343962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5277  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  160  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000417052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0002  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.185549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4350  SsrA-binding protein  50.68 
 
 		 158 aa  158  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1646  SsrA-binding protein  44.79 
 
 		 172 aa  158  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.281559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4920  SsrA-binding protein  51.43 
 
 		 155 aa  157  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00075072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1709  SsrA-binding protein  48.59 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0149731  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3008  SsrA-binding protein  48.03 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1493  SsrA-binding protein  51.03 
 
 		 150 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0661081  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1314  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 152 aa  157  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00672101  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2325  SsrA-binding protein  50 
 
 		 155 aa  155  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.595693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15720  SsrA-binding protein  49.66 
 
 		 155 aa  156  2e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000205152  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1592  SsrA-binding protein  52.82 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2697  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 162 aa  155  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2231  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.589723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2169  SsrA-binding protein  52.45 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1253  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 157 aa  154  6e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1354  SsrA-binding protein  50.7 
 
 		 156 aa  154  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000258997  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0463  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 158 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2045  SsrA-binding protein  51.05 
 
 		 155 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.524843 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2748  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000119247  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0795  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.387755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1455  SmpB protein  49.66 
 
 		 155 aa  152  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.773196 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2083  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 151 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1088  SsrA-binding protein  49.65 
 
 		 155 aa  151  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.469803  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0655  SsrA-binding protein  51.02 
 
 		 158 aa  151  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00271498 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1501  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000046727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1291  SsrA-binding protein  50 
 
 		 156 aa  150  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00149026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2476  SsrA-binding protein  47.59 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.472283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1996  SsrA-binding protein  49.63 
 
 		 175 aa  150  8.999999999999999e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.661314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1728  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 159 aa  150  1e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0775  SsrA-binding protein  47.92 
 
 		 148 aa  149  2e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000199999  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2984  SsrA-binding protein  48.32 
 
 		 161 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000114855  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1797  SsrA-binding protein  50 
 
 		 151 aa  149  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2342  SsrA-binding protein  48.25 
 
 		 156 aa  149  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0903697 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1869  SsrA-binding protein  50.69 
 
 		 159 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315571  normal  0.12343 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1795  SsrA-binding protein  50 
 
 		 154 aa  148  4e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.398108  decreased coverage  0.00283091 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0771  SsrA-binding protein  49.64 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0749395  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1916  SsrA-binding protein  48.61 
 
 		 165 aa  147  6e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0329726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0806  SsrA-binding protein  48.34 
 
 		 151 aa  147  7e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.747303  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0281  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 157 aa  147  7e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000135529  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0820  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 155 aa  147  8e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.533301  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0694  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000543524  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0670  SsrA-binding protein  48.28 
 
 		 150 aa  146  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000585556  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4446  SsrA-binding protein  47.26 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1638  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.223466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1584  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.687182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1613  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 168 aa  146  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3929  SsrA-binding protein  48.97 
 
 		 152 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000169272  normal  0.790907 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0395  SsrA-binding protein  46.15 
 
 		 157 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.269893  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2689  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 151 aa  145  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.322401  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1725  SsrA-binding protein  47.89 
 
 		 154 aa  145  3e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3316  SsrA-binding protein  51.75 
 
 		 154 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.959276  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1679  SsrA-binding protein  50.36 
 
 		 167 aa  144  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00257797  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1824  SsrA-binding protein  46.21 
 
 		 150 aa  144  6e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000470623  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0819  SsrA-binding protein  47.18 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.796399  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07720  SsrA-binding protein  47.48 
 
 		 160 aa  144  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3821  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3738  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  143  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1603  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 150 aa  143  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0330195  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3807  SsrA-binding protein  45.14 
 
 		 165 aa  144  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0298581 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4865  SsrA-binding protein  47.3 
 
 		 157 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1033  SsrA-binding protein  52.71 
 
 		 154 aa  143  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3680  SsrA-binding protein  47.45 
 
 		 163 aa  142  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.535779  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09100  SsrA-binding protein  47.95 
 
 		 155 aa  142  2e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.971292  normal  0.0787138 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1302  SsrA-binding protein  46.43 
 
 		 151 aa  142  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000931328  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0947  SsrA-binding protein  49.29 
 
 		 161 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2865  SsrA-binding protein  42.47 
 
 		 154 aa  142  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000473081  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0920  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 159 aa  142  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.624021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0366  SsrA-binding protein  46.31 
 
 		 150 aa  142  3e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1965  SsrA-binding protein  48 
 
 		 155 aa  141  4e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1994  SsrA-binding protein  46.98 
 
 		 154 aa  141  4e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000521346  normal  0.65027 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1069  SsrA-binding protein  46 
 
 		 165 aa  142  4e-33  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.439427 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13117  SsrA-binding protein  45.83 
 
 		 160 aa  141  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4003  SsrA-binding protein  46.76 
 
 		 162 aa  141  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1464  SsrA-binding protein  47.22 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3721  SsrA-binding protein  44.44 
 
 		 154 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.516097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25160  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2014  SsrA-binding protein  44.9 
 
 		 151 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.960885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0451  SsrA-binding protein  46.9 
 
 		 156 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>