More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1235 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1235  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 98 aa  192  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000309025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1209  co-chaperonin GroES (HSP10)  95.92 
 
 		 98 aa  187  4e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000436994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1427  chaperonin GroES  94.9 
 
 		 98 aa  186  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00000324311  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  50.55 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5250  co-chaperonin GroES  50.55 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.584342  normal  0.464773 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4783  co-chaperonin GroES  50.55 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0265575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2175  chaperonin Cpn10  46.81 
 
 		 96 aa  94.7  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.95289 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  44.44 
 
 		 95 aa  94.4  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2887  co-chaperonin GroES  41.24 
 
 		 97 aa  94  7e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0300428  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2595  co-chaperonin GroES  41.24 
 
 		 97 aa  93.6  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000536943 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  41.49 
 
 		 102 aa  93.2  9e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  39.58 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  47.78 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  38.3 
 
 		 97 aa  92.8  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0535  co-chaperonin GroES  48.35 
 
 		 96 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.235794  normal  0.722093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1332  co-chaperonin GroES  50 
 
 		 98 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6002  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 101 aa  92  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0711534 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4232  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 104 aa  92.4  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0774007 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1770  chaperonin Cpn10  50.55 
 
 		 95 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0933044  normal  0.173989 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04660  Co-chaperonin GroES  40.43 
 
 		 97 aa  92.4  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00798314  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  40.22 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0549  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000019989  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 96 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0674  chaperonin Cpn10  50.55 
 
 		 95 aa  92  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.248436  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5829  10 KD chaperonin (protein CPN10)  47.37 
 
 		 98 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0158717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2573  co-chaperonin GroES  50.55 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.320362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5581  chaperonin Cpn10  47.25 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1086  chaperonin Cpn10  39.58 
 
 		 98 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.692359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  44.33 
 
 		 100 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1768  chaperonin Cpn10  50.56 
 
 		 95 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.939398  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4258  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6544  chaperonin Cpn10  40.62 
 
 		 97 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.303398  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3027  chaperonin Cpn10  51.04 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  42.71 
 
 		 98 aa  90.9  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7829  chaperonin Cpn10  50.56 
 
 		 95 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  39.8 
 
 		 98 aa  90.5  6e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2927  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 96 aa  90.5  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 99 aa  90.5  8e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0794  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 95 aa  90.1  8e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142401 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0358  chaperonin Cpn10  46.32 
 
 		 98 aa  90.1  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  47.19 
 
 		 94 aa  89.7  1e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13452  co-chaperonin GroES  41.94 
 
 		 100 aa  89.7  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000956292  hitchhiker  0.00171205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4725  co-chaperonin GroES  51.11 
 
 		 98 aa  89.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1737  co-chaperonin GroES  48.89 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.168742  hitchhiker  0.00175489 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  43.33 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0605  chaperonin Cpn10  47.19 
 
 		 95 aa  89.4  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.131818 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  43.75 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5464  co-chaperonin GroES  45.74 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.835161  normal  0.183317 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  46.24 
 
 		 103 aa  88.6  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1494  co-chaperonin GroES  41.49 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.642503 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2625  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 96 aa  89.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1837  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 98 aa  89.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.747297  normal  0.0192495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1672  co-chaperonin GroES  48.89 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.723246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4126  co-chaperonin GroES  48.91 
 
 		 98 aa  88.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505672  normal  0.752904 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4925  co-chaperonin GroES  41.49 
 
 		 100 aa  89.4  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  44.57 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  43.82 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 		 101 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1170  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.480442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  46.15 
 
 		 95 aa  88.2  3e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1153  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28700  Co-chaperonin GroES  39.58 
 
 		 97 aa  88.6  3e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235736  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16550  Co-chaperonin GroES  38.54 
 
 		 98 aa  88.6  3e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.639377  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1180  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 127 aa  88.2  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0241756 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6083  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0471  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3195  co-chaperonin GroES  48.89 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0409  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 98 aa  88.2  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.52328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0516  co-chaperonin GroES  46.32 
 
 		 98 aa  87.8  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218545 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  43.16 
 
 		 101 aa  87.4  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0196  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 98 aa  87.4  6e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  42.7 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0635  chaperonin Cpn10  40.82 
 
 		 97 aa  87.4  6e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16161  co-chaperonin GroES  41.57 
 
 		 103 aa  87  7e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.5001  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  47.92 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2589  Chaperonin Cpn10  38.78 
 
 		 97 aa  87  7e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.565547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1547  co-chaperonin GroES  40.43 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.807216  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  46.74 
 
 		 92 aa  87  8e-17  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3058  co-chaperonin GroES  37.23 
 
 		 98 aa  87  8e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.495905 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0740  co-chaperonin GroES  46.15 
 
 		 95 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0178  co-chaperonin GroES  47.92 
 
 		 98 aa  86.7  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000749715  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2067  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000661626  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3063  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 95 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.428511 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3627  co-chaperonin GroES  43.62 
 
 		 95 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2104  co-chaperonin GroES  43.48 
 
 		 94 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00575627  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3233  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.211647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2228  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 105 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.145562  normal  0.505926 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5039  chaperonin Cpn10  42.55 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.747065  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2458  co-chaperonin GroES  47.37 
 
 		 104 aa  86.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  45.74 
 
 		 104 aa  86.7  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1677  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 97 aa  86.7  1e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2029  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 96 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.218748  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5284  co-chaperonin GroES  46.07 
 
 		 104 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.262452 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  45.83 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2008  chaperonin Cpn10  44.94 
 
 		 94 aa  85.5  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.377969  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1195  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 95 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0507909  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0296  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 97 aa  85.5  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.018883  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>