More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1220 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02482  protein disaggregation chaperone  49.65 
 
 		 857 aa  810    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.0000328184  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1080  ATP-dependent chaperone ClpB  49.65 
 
 		 857 aa  810    Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.0000000000145981  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.99 
 
 		 824 aa  801    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  96.06 
 
 		 812 aa  1583    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0658  ClpB protein  52.6 
 
 		 865 aa  872    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2327  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  48.91 
 
 		 859 aa  784    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  50.5 
 
 		 817 aa  836    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3106  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.03 
 
 		 859 aa  791    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652443  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.28 
 
 		 811 aa  844    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3913  ATP-dependent chaperone protein ClpB  48.63 
 
 		 861 aa  820    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1864  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.77 
 
 		 874 aa  834    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3577  clpB protein  49.71 
 
 		 857 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.28 
 
 		 811 aa  844    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  53.28 
 
 		 811 aa  844    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  53.78 
 
 		 811 aa  843    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1377  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.6 
 
 		 865 aa  804    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  49.2 
 
 		 858 aa  805    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1714  endopeptidase Clp ATP-binding chain B (ClpB)  49.26 
 
 		 858 aa  805    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  50.67 
 
 		 830 aa  831    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1980  AAA ATPase, central region:Clp, N terminal  48.56 
 
 		 862 aa  787    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192819  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0815  ClpB protein  49.89 
 
 		 859 aa  792    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0589  AAA ATPase  49.08 
 
 		 891 aa  815    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.917819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0132  ATPase  50.4 
 
 		 873 aa  834    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0140  ATPase  48.24 
 
 		 876 aa  791    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.182889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0910  UvrB/UvrC protein  51.17 
 
 		 823 aa  813    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2335  ATPase  49.71 
 
 		 872 aa  839    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2389  ClpB heat-shock protein  49.71 
 
 		 865 aa  805    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2381  ATP-dependent Clp protease  48.57 
 
 		 865 aa  801    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1408  chaperone ClpB  49.19 
 
 		 870 aa  783    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0359  heat shock protein ClpB-like  48.81 
 
 		 872 aa  785    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5148  AAA ATPase, ClpB  49.49 
 
 		 865 aa  801    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.830586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0911  ATPase  47.7 
 
 		 862 aa  796    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.629487  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1007  ATPase  49.54 
 
 		 862 aa  796    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.783787 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1627  ATPase  49.15 
 
 		 846 aa  782    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0475854  normal  0.546866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2851  AAA ATPase  52.79 
 
 		 864 aa  858    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000473406  hitchhiker  0.00000000124432 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1661  ATPase  50.06 
 
 		 863 aa  809    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  53.28 
 
 		 811 aa  844    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1099  Clp protease ATP-binding subunit  49.58 
 
 		 842 aa  799    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.372897  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0260  ATPase  50.86 
 
 		 824 aa  799    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1089  ATPase  50 
 
 		 883 aa  805    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000277828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1541  ATPase with chaperone activity  49.2 
 
 		 869 aa  806    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.886983  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0753  chaperone clpB  49.13 
 
 		 870 aa  798    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  53.46 
 
 		 840 aa  818    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2205  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.83 
 
 		 865 aa  810    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.489947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0385  AAA ATPase, ClpA/B  51.09 
 
 		 870 aa  805    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4383  ATPase AAA-2  51.61 
 
 		 834 aa  809    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.388012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4247  AAA_5 ATPase  50.11 
 
 		 879 aa  828    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0997657  normal  0.754892 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2824  AAA ATPase, central region  49.14 
 
 		 859 aa  834    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.553525  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3987  ATPase AAA-2  48.34 
 
 		 871 aa  791    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0598394  normal  0.931428 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4277  ATPase AAA-2  49.77 
 
 		 879 aa  811    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.345892  normal  0.036292 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2198  ATPase AAA-2  48.91 
 
 		 861 aa  810    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.105301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2374  heat-shock protein, chaperone ClpB  49.94 
 
 		 865 aa  808    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0849473  normal  0.41836 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2861  ATPase AAA-2  49.08 
 
 		 862 aa  802    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.133285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2199  ATPase AAA-2  48.39 
 
 		 869 aa  801    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0278692  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4095  ATPase AAA-2  49.66 
 
 		 879 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0499  ATPase AAA-2  49.94 
 
 		 860 aa  809    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.333931  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0681  ATPase AAA-2  49.71 
 
 		 878 aa  805    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.310186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4765  ATPase AAA-2  47.59 
 
 		 878 aa  788    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000533628  normal  0.0145469 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0406  ATPase AAA-2  49.25 
 
 		 862 aa  825    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6232  ATPase AAA-2  49.49 
 
 		 865 aa  803    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4756  ATPase AAA-2  50.31 
 
 		 847 aa  796    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.491369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  58.54 
 
 		 837 aa  786    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  52.15 
 
 		 834 aa  835    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1337  ATPase AAA-2  49.14 
 
 		 858 aa  798    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.184939  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2996  ATPase AAA-2  50.12 
 
 		 891 aa  832    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0199  ATP-dependent Clp protease, subunit B  49.88 
 
 		 856 aa  812    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0543  ATPase AAA-2  50.29 
 
 		 870 aa  822    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0110246  normal  0.574025 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2437  ATPase AAA-2  51.56 
 
 		 825 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.643825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  49.63 
 
 		 825 aa  790    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2991  ATPase  48.68 
 
 		 857 aa  791    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00302942  normal  0.61786 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3072  ATPase  48.68 
 
 		 857 aa  791    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0239882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2558  ATPase  49.37 
 
 		 864 aa  813    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.111038  hitchhiker  0.00562869 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0669  ATPase  49.71 
 
 		 865 aa  810    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0949399  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  50.24 
 
 		 828 aa  804    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0650  ATPase  48.54 
 
 		 868 aa  804    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.557806 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1785  ATPase  49.49 
 
 		 865 aa  801    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  50.74 
 
 		 830 aa  804    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3740  ATPase  48.33 
 
 		 889 aa  805    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1847  ATPase  49.49 
 
 		 865 aa  803    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3169  ATPase  48.68 
 
 		 857 aa  791    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00027679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  52.42 
 
 		 839 aa  831    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2119  ATPase  50.52 
 
 		 864 aa  799    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.299274  normal  0.0630262 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0062  ATPase  49.48 
 
 		 875 aa  806    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.294718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0466  ATPase  50.74 
 
 		 861 aa  806    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4357  ATPase  49.66 
 
 		 866 aa  798    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.427241  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4842  ATPase  50.31 
 
 		 847 aa  796    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3263  chaperone ClpB  48.34 
 
 		 857 aa  795    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5358  ATPase  50.56 
 
 		 847 aa  809    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.406565 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0880  ATPase  49.37 
 
 		 859 aa  813    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0343543  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1290  ATPase  49.25 
 
 		 865 aa  806    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.851585  normal  0.196036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2225  ATPase  50 
 
 		 867 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00451076 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3198  ATPase  50.06 
 
 		 867 aa  793    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1867  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.6 
 
 		 865 aa  804    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.60175  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3599  ATPase  49.89 
 
 		 867 aa  799    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.177428 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2232  ATPase  48.1 
 
 		 870 aa  790    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11941  ClpC  49.45 
 
 		 842 aa  803    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.316562  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11791  ClpC  49.82 
 
 		 843 aa  797    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09911  ClpC  48.72 
 
 		 859 aa  783    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18321  ATP-dependent Clp protease, Hsp 100, ATP-binding subunit ClpB  48.56 
 
 		 863 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.207261 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0030  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpB  49.6 
 
 		 865 aa  804    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>