More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_1157 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1157  1-phosphofructokinase  100 
 
 		 310 aa  635    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1128  carbohydrate kinase, PfkB family  90 
 
 		 310 aa  570  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1346  carbohydrate kinase  89.35 
 
 		 310 aa  567  1e-161  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0175  1-phosphofructokinase  39.81 
 
 		 306 aa  218  1e-55  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0686  1-phosphofructokinase  38.61 
 
 		 316 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.020594  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1351  ribokinase-like domain-containing protein  37.94 
 
 		 309 aa  206  5e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1715  1-phosphofructokinase  35.92 
 
 		 324 aa  202  7e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22720  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  37.94 
 
 		 315 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.727681  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1031  1-phosphofructokinase  37.92 
 
 		 311 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3234  1-phosphofructokinase  37.92 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1788  1-phosphofructokinase  33.97 
 
 		 311 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.468548  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0012  1-phosphofructokinase  38.51 
 
 		 308 aa  192  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00179205  unclonable  0.0000000067569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0576  1-phosphofructokinase  34.95 
 
 		 310 aa  189  4e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000336585  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1252  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 312 aa  188  9e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1956  tagatose-6-phosphate kinase  34.5 
 
 		 310 aa  185  7e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000247641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0565  1-phosphofructokinase  36.04 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0551  1-phosphofructokinase  37.42 
 
 		 306 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4571  1-phosphofructokinase  37.58 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.78186 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1834  ribokinase-like domain-containing protein  35.16 
 
 		 306 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1642  tagatose-6-phosphate kinase, phosphofructokinase I  33.99 
 
 		 307 aa  175  9e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3382  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 308 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000263995  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0650  1-phosphofructokinase  36.42 
 
 		 307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2174  1-phosphofructokinase  35.69 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1907  tagatose-6-phosphate kinase  34.3 
 
 		 307 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.961969  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0358  1-phosphofructokinase  32.36 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3745  1-phosphofructokinase  31.83 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0550156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4713  1-phosphofructokinase  34.2 
 
 		 330 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1600  6-phosphofructokinase II  36.58 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.349634 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3541  1-phosphofructokinase  33.65 
 
 		 332 aa  170  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3768  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 303 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000270139  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0415  6-phosphofructokinase  35.23 
 
 		 350 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3564  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0892785  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3463  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00127204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3477  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000168948  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3847  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000858241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3727  1-phosphofructokinase  30.87 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5453300000000002e-26 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0445  fructose-1-phosphate kinase  34.81 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00359315  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1347  1-phosphofructokinase  34.6 
 
 		 303 aa  165  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.50692  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1268  1-phosphofructokinase  39.15 
 
 		 314 aa  165  8e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.955109  normal  0.500032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2395  1-phosphofructokinase  30.84 
 
 		 303 aa  165  9e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.378006  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0700  PfkB  30.65 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0382  1-phosphofructokinase  34.09 
 
 		 302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000931152  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1485  1-phosphofructokinase  31.51 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.211736  normal  0.0136163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3817  1-phosphofructokinase  31.19 
 
 		 303 aa  163  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00128432  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2080  ribokinase-like domain-containing protein  34.9 
 
 		 312 aa  163  3e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.234736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1873  1-phosphofructokinase  32.79 
 
 		 320 aa  162  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00509321 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2756  6-phosphofructokinase  34.51 
 
 		 312 aa  162  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.785383  normal  0.0918353 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3483  1-phosphofructokinase  30.23 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.622893  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0147  1-phosphofructokinase  32.69 
 
 		 315 aa  162  9e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000110184  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4850  ribokinase-like domain-containing protein  32.52 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00898059 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0209  1-phosphofructokinase  33.67 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.898641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4105  ribokinase-like domain-containing protein  34.43 
 
 		 332 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0641  1-phosphofructokinase  32.58 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.021814  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5875  1-phosphofructokinase  34.34 
 
 		 326 aa  159  8e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0444  PfkB  33.33 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6213  1-phosphofructokinase  33.33 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.175632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0611  tagatose-6-phosphate kinase  32.69 
 
 		 311 aa  156  3e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0589  1-phosphofructokinase  30.74 
 
 		 305 aa  157  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0347  PfkB  33.33 
 
 		 312 aa  156  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0042233 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4226  1-phosphofructokinase  37.79 
 
 		 313 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1727  tagatose-6-phosphate kinase  31.51 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.209721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1032  tagatose-6-phosphate kinase  33.45 
 
 		 305 aa  154  1e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.104168  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4388  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.758839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4987  ribokinase-like domain-containing protein  34.55 
 
 		 315 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4520  1-phosphofructokinase  33.56 
 
 		 310 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.491603  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0739  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0723  1-phosphofructokinase  29.77 
 
 		 306 aa  154  2e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1394  ribokinase-like domain-containing protein  33.55 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224009  normal  0.554881 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3412  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0583306  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3475  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0202827  normal  0.0135281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3423  6-phosphofructokinase  33.89 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.151366 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2896  1-phosphofructokinase  32.78 
 
 		 322 aa  152  5e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.931372  hitchhiker  0.00747036 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1511  1-phosphofructokinase  31.72 
 
 		 303 aa  152  5.9999999999999996e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000166616  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0237  6-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 320 aa  152  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1069  1-phosphofructokinase  32.07 
 
 		 311 aa  152  8e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1793  tagatose-6-phosphate kinase  33.01 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.354584  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0693  1-phosphofructokinase  32.89 
 
 		 310 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320034 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23410  6-phosphofructokinase II  34.45 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.479216  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0383  1-phosphofructokinase  34.56 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12066  phosphofructokinase pfkB  33.89 
 
 		 339 aa  148  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1776  1-phosphofructokinase  29.26 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1929  tagatose-6-phosphate kinase  33.96 
 
 		 310 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0744  1-phosphofructokinase  32.47 
 
 		 315 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0611075  normal  0.168241 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2650  1-phosphofructokinase  34.3 
 
 		 303 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5272  1-phosphofructokinase  33.01 
 
 		 325 aa  146  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.390992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2110  1-phosphofructokinase  29.49 
 
 		 311 aa  146  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7074  ribokinase-like domain-containing protein  33.22 
 
 		 316 aa  145  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0794  PfkB  32.4 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0909395  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0435  1-phosphofructokinase  29.75 
 
 		 310 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0696  putative 6-phosphofructokinase: 1-phosphofructokinase  34.44 
 
 		 328 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1455  6-phosphofructokinase 2  33.44 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.620186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2018  6-phosphofructokinase 2  33.44 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0138  1-phosphofructokinase  30.1 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3901  1-phosphofructokinase  31.35 
 
 		 300 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000128039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1845  6-phosphofructokinase 2  33.44 
 
 		 310 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00011126  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28610  1-phosphofructokinase  32.91 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0750785  normal  0.0817952 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1423  6-phosphofructokinase 2  33.44 
 
 		 310 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.445434  hitchhiker  0.000900172 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1282  6-phosphofructokinase  34.68 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.949275  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2659  putative fructokinase  34.68 
 
 		 442 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1807  carbohydrate kinase, PfkB family  33.55 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.917848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>